สืบค้นงานวิจัย
การระบุเครื่องหมายพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับกลไกทางชีวภาพที่ตอบสนองต่อสภาพอากาศร้อนจัดเนื่องจากภาวะแล้งด้วยเทคนิคทรานสคริปโตมเพื่อใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่เนื้อ
ดร.ยุวเรศ มลิลา - สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
ชื่อเรื่อง: การระบุเครื่องหมายพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับกลไกทางชีวภาพที่ตอบสนองต่อสภาพอากาศร้อนจัดเนื่องจากภาวะแล้งด้วยเทคนิคทรานสคริปโตมเพื่อใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่เนื้อ
ชื่อเรื่อง (EN): Transcriptome-based identification of biological markers associated with biological mechanisms in response to heat stress under drought for breeding selection of meat-type chickens
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ดร.ยุวเรศ มลิลา
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
บทคัดย่อ: วัตถุประสงค์หลักของโครงการวิจัยคือเพื่อระบุเครื่องหมายพันธุกรรมสำหรับใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่ เนื้อให้ทนต่อความเครียดเนื่องจากการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ (thernal stress) และยังให้เนื้อไก่ที่มีคุณภาพดี โดยในโครงการปีที่ 1 เป็นการศึกษาผลของการเพิ่มอุณหภูมิระหว่างวันในช่วงสามสัปดาห์สุดท้ายก่อนถึงอายุ ตลาดต่อประสิทธิภาพการเจริญ คุณภาพชาก คุณภาพเนื้อ กิจกรรมของสารต้านอนุมูลอิสระในเลือดและเนื้อ ของไก่ 4 สายพันธุ์ ได้แก่ ไก่เนื้อทางการค้าสายพันธุ์ (Ross 308) ไก่สายพันธุ์พื้นเมืองพันธุ์ชี (NT) ไก่ลูกผสม ระหว่างไก่ทางการค้าและไก่พื้นเมือง ที่มีระดับเลือดของไก่ทางการค้า 75% (H75) และไก่ลูกผสมที่มีระดับ เลือดของไก่ทางการค้าและไก่พื้นเมืองเป็น 50% (H50) และศึกษาการเปลี่ยนแปลงโพรไฟล์ทรานสคริปโต มในกล้ามเนื้อส่วนอกระบุกลไกทางชีวภาพที่เกี่ยวข้อง เมื่อไก่แต่ละสายพันธุ์มีอายุ 3 สัปดาห์ก่อนถึงอายุตลาด ถูกจัดแบ่งเป็นสองกลุ่ม ได้แก่ กลุ่มควบคุม (ก = 50 แบ่งเป็น 4 เล้า เล้าละ 12 -13 ตัว) และกลุ่มทลอง (ก = 50 แบ่งเป็น 4 เล้า เล้าละ 12-13 ตัวก = 50) กลุ่มควบคุมเลี้ยงภายใต้อุณหภูมิ 27 องศาเซลเชียส ส่วนกลุ่ม ทดลองเลี้ยงภายในโรงเรือนปรับขึ้นเป็น 352 องศาเซลเขียส เป็นเวลาประมาณ 6 ชม. ต่อวัน จนครบ 3 สัปดาห์ ติดตามประสิทธิภาพการเจริญ และเก็บอย่างเลือดสัปดาห์ละครั้ง เมื่อครบอายุตลาด ไก่แต่ละกลุ่มจะ ถูกนำไปผ่านกระบวนการเชือด ตรวจสอบคุณภาพชาก และคุณภาพเนื้อ (ค่าสี ค่าความเป็นกรดด่าง ความสามารถในการอุ้มน้ำ และเนื้อสัมผัส) เก็บตัวอย่างกล้ามเนื้อส่วนอกภายใน 20 นาทีหลังเชือด และแช่ เยือกแข็งอย่างรวดเร็วเพื่อใช้ในการวิเคราะห์ทรานสคริปโตม ผลการทดลองพบว่าตัวอย่างกลุ่มทดลองของไก่ เนื้อทางการค้า และไก่ลูกผสม H75 มีน้ำหนักตัวที่เพิ่มขึ้น (body weight gain) น้อยกว่าตัวอย่างกลุ่มควบคุบคุม สายพันธุ์เดียวกันอย่างมีนัยสำคัญ การปรับอุณหภูมิส่งผลลดอัตราการเจริญ (average daily gain) ในไก่เนื้อ ทางการค้า ไก่ลูกผสม H50 และไก่พื้นเมืองด้วย สำหรับอัตราการตายของไก่เนื้อทางการค้า ไก่ลูกผสม H75 และ H50 คิดเป็น 8% 2% และ 4% ตามลำมลำดับ และไม่พบการตายของตัวอย่างไก่พื้นเมืองในระหว่างการทดลอง เนื้อไก่ส่วนอกของไก่เนื้อทางการค้ากลุ่มทดลองมีลักษณะช็ดและเหลืองกว่าตัวอย่างกลุ่มควบคุบคุมอย่าง มีนัยสำคัญ และเนื้อไก่สุกมีค่า shear force สูงกว่าตัวอย่างกลุ่มควบคุมอย่างมีนัยสำคัญ ในขณะที่เนื้อไก่ส่วน อกของไก่ H50 กลุ่มทดลองมีค่า shear force shear energy และ hardness น้อยกว่าตัวอย่างกลุ่มควบคุม อย่างมีนัยสำคัญ ไก่เนื้อทางการค้ากลุ่มทดลองมีสัดส่วนค่าเม็ดเลือด heterophil ต่อ lymphocyte สูงกว่า กลุ่มควบคุมอย่างมีนัยสำคัญ แต่ไม่พบความแตกต่างในไก่สายพันธุ์อื่น และพบว่าในช่วง 3 สัปดาห์ที่ได้รับ ความเครียด ตัวอย่างกลุ่มทดลองของทุกสายพันธุ์กินน้ำมากกว่าตัวอย่างกลุ่มควบคุมอย่างมีนัยสำคัญการวิเคราะห์กิจกรรมของสารต้านอนุมูลอิสระในตัวอย่างเลือดแดงและเนื้อส่วนอกไก่ (ก = 6) พบว่า ปริมาณ alpha-tocopherol ในเม็ดเลือดแดงและเนื้ออกของกลุ่มทดลองและกลุ่มควบคุมไม่แตกต่างอย่างมี นัยสำคัญ การเพิ่มอุณหภูมิระหว่างวันส่งผลให้ free radical scavenging activity luwลาสมาของไก่เนื้อทาง การค้า และไก่ลูกผสม H50 สูงกว่าค่าดังกล่าวของตัวอย่างกลุ่มควบคุมอย่างมีนัยสำคัญ แต่ไม่ส่งผลต่อ free radical scavenging activity ในเนื้อส่วนอก จากการทดสอบกิจกรรมสารต้านอนุมูลอิสระในตัวอย่างเนื้อส่วน อกของไก่ทั้งสี่สายพันธุ์ในสภาวะจำลองการการวางจำหน่าย (simulated shelf display) โดยเก็บที่ 4 องศา เซลเซียส ที่มีการฉายไฟจากหลอด LED (500 lumen) เป็นเวลา 12 ชั่วโมงต่อวัน เป็นเวลา 10 วัน สุ่มเก็บ ตัวอย่างเนื้อไก่ (ก = 3) ในวันที่ 0. 3. 7 และ 10 พบว่าเมื่อระยะเวลาของการเก็บในสภาวะจำลองที่นานขึ้น ออกซิเดชันของไมโอโกลบิน ไขมัน และโปรตีนของเนื้อส่วนอกจากไก่ทุกสายพันธุ์มีค่าเพิ่มขึ้นอย่างมีนัยสำคัญ อย่างไรก็ตาม คำดังกล่าวของกลุ่มทดดลองและกลุ่มควบคุมคุมไม่แตกต่างกัน ศึกษาการเปลี่ยนแปลงโพรไฟล์ทรานสคริปโตมในกล้ามเนื้อส่วนอกของไก่ตัวผู้ระหว่างตัวอย่างกลุ่ม ควบคุมและกลุ่มทดลอง (n = 4) ด้วยเทคนิค Ilumina HiSeg และวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางชีววิทยาที่ เกี่ยวข้องกันด้วย Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ยืนยันความแตกต่างของระดับทราน สคริปโตมด้วย quantitative real-time polymerase chain reaction ผลการทดลองแสดงให้ในไก่ทุกสาย พันธ์พบวิถี glycolysis/gluconeogenesis วิถี biosynthesis of amino acids วิถี HIIF-1 signaling และวิถี PI3K/Akt signaling บ่งชี้ความสำคัญของกลไกดังกล่าวเมื่อไก่อยู่ภายใต้ภาวะเครียดจากอากาศร้อน เมื่อ พิจารณาในไก่แต่ละสายพันธุ์ พบการเปลี่ยนแปลงของทรานสคริปต์ใน pentose phosphate pathway ใน ไก่เนื้อทางการค้า ในขณะที่ top enriched KEGG pathway ของไก่ลูกผสม H75 ไก่ลูกผสม H50 และไก่พื้นเมืองแสดงผลกระทบต่อของกลไกการควบคุมระดับกลูโคส และเมตาบอลิซึมของโปรตีน และเบสพิวรีน วิถี การควบคุมความเข้มข้น Caf* ในเซลล์ และวิถี thermogenesis บ่งชี้ว่ากลไกดังกล่าวอาจช่วยในการปรับตัว ของไก่ลูกผสม และไก่พื้นเมืองภายได้สภาวะการปรับเพิ่มของอุณหภูมิระหว่างวัน
บทคัดย่อ (EN): The main objective of the overall study is to identify of biological markers associated with biological mechanisms in response to heat stress under drought for breeding selection of chickens with good meat quality.The first project aimed at investigating the effects of cyclic thermal stress on growth efficiency, carcass quality, breast meat quality, antioxidant activities within blood and breast meat of commercial broilers, native chickens and hybrids between broilers and native chickens with broiler blood fraction of 75% (H75) and 50% (H50). Transcriptional changes upon the thermal stress within breast muscle were also examined to define relevant biological pathways. Three weeks before the birds from each chicken breeds reached their specific market ages, each breed was divided into two groups, including control (n = 50, 4 pens, 12-13 birds per pen) and stress treatment group (n = 50, 4 pens, 12-13 birds per pen). Control group was raised under a constant 27°C whereas the treatment group was exposed to 35°C (6h daily) for 3 weeks. Growth efficiency was monitored. Blood samples were collected once a week during the thermal challenge. When reached market ages, the birds were slaughtered. Carcass quality and meat quality indices (color, pH, water holding capacity, and texture) were investigated. Breast muscle was collected immediately within 20 min postmortem and snap frozen until used for transcriptome analysis. The results indicated that treatment groups of broilers and H75 showed lower body weight gain than their control counterparts. Thermal condition significantly affected average daily gain of broilers, H50 and native chickens. Mortality rate of broilers, H75 and H50 was 8%, 2% and 4%, respectively. No loss was found for native chickens. Breasts of stressed broilers showed increases in paleness (L *-value) yellowness (b*-value) and shear force than their control. Shear force, shear energy and hardness of H50 treatment groups were lower than those of their control. The ratio of heterophil to lymphocyte of the stressed broilers was greater than that of control. During 3- week thermal challenge, all treatment groups drank water at a greater extent than their control counterparts. Antioxidant activities within blood and chicken breast meat (n = 6) were determined. The results indicated that alpha-tocopherol in read blood cells and the meat did not differ between treatment and control counterparts. Thermal challenge significantly increased free radical scavenging activity in blood plasma of commercial broilers and H50 compared to their control counterparts. However, no significant effect was found for free radical scavenging activity in the meat. Antioxidant activities within breast meat during simulated shelf display were monitored. The meat was stored at 4°C, received 12-h daily LED light (500 lumen), for 10 days. The samples were collected on day 0, 3, 7 and 10. The results indicated that, regardless of chicken breeds and thermal stress, as the storage duration under the simulated shelf display increased, oxidation of myoglobin, lipid and protein within the meat increased. No differences were observed between control and treatment. The changes in transcriptional profiles within breast muscle between male control and treatment group (n = 4) were analyzed using an Illumina HiSeq. Biological functions were subsequently determined using Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Differential transcript abundance was validated using quantitative real-time polymerase chain reaction. The results underlined glycolysis/gluconeogenesis, biosynthesis of amino acids, HIF1 signaling and PI3K/Akt signaling pathways in all chicken breeds. Considering each chicken breed, pentose phosphate pathway was identified in broilers. On the other hand, the top enriched KEGG pathways of H75, H50 and native chickens included the pathways that regulate glucose level, metabolisms of protein and purine bases, intracellular [Ca2+] and thermogenesis, suggesting the crucial roles of those biological pathways in environmental stress adjustment of the hybrids and the native chickens under the thermal challenge.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
คำสำคัญ: ไก่เนื้อ
เจ้าของลิขสิทธิ์: ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ดร.ยุวเรศ มลิลา. "การระบุเครื่องหมายพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับกลไกทางชีวภาพที่ตอบสนองต่อสภาพอากาศร้อนจัดเนื่องจากภาวะแล้งด้วยเทคนิคทรานสคริปโตมเพื่อใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่เนื้อTranscriptome-based identification of biological markers associated with biological mechanisms in response to heat stress under drought for breeding selection of meat-type chickens". สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน). 2564

ดร.ยุวเรศ มลิลา. "การระบุเครื่องหมายพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับกลไกทางชีวภาพที่ตอบสนองต่อสภาพอากาศร้อนจัดเนื่องจากภาวะแล้งด้วยเทคนิคทรานสคริปโตมเพื่อใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่เนื้อTranscriptome-based identification of biological markers associated with biological mechanisms in response to heat stress under drought for breeding selection of meat-type chickens". สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน). 2564. Print.



TARR Wordcloud:
การระบุเครื่องหมายพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับกลไกทางชีวภาพที่ตอบสนองต่อสภาพอากาศร้อนจัดเนื่องจากภาวะแล้งด้วยเทคนิคทรานสคริปโตมเพื่อใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่เนื้อ
ดร.ยุวเรศ มลิลา
สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
2564
การค้นหาเครื่องหมายพันธุกรรมในการคัดเลือกลักษณะทางเศรษฐกิจเพื่อเพิ่มสมรรถภาพการผลิตโคไทยบราห์มัน การปรับปรุงพันธุ์ข้าวลูกผสมเพื่อเพิ่มผลผลิตและคุณภาพสำหรับการแปรรูปเชิงอุตสาหกรรม ระยะที่ 2 การปรับปรุงพันธุ์ข้าวลูกผสมเพื่อเพิ่มผลผลิตและคุณภาพสำหรับการแปรรูปเชิงอุตสาหกรรม ระยะที่ 2 ปีที่ 3 การประยุกต์ใช้โภชนบำบัดเพื่อทดแทนยาปฏิชีวนะในการปรับปรุงสภาวะเครียดจากปฏิกิริยาออกซิเดชันภาวะการอักเสบ และสุขภาพทางเดินอาหารของไก่เนื้อที่เลี้ยงภายใต้สภาวะเครียดรูปแบบต่างๆ (ปีที่2) การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกระท่อม (Mitragyna speciosa (Korth.) Havil.) ในประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลสนิปร่วมกับลักษณะสัณฐานวิทยา การพัฒนาวิธีตรวจหาซีรัมนิวทรัลไลซิงแอนติบอดีต่อไวรัสพีพีอาร์ด้วยเทคนิคซูโดไทป์ ฤทธิ์ทางชีวภาพของไขอ่อนและไขแข็งจากรําข้าวในเซลล์เพาะเลี้ยงเพื่อประยุกต์ใช้ในเครื่องสําอาง การต่อยอดผลงานวิจัยเรื่องกลไกการก่อโรคของเชื้อ Enterocytozoon hepatopenaei (EHP) เพื่อนำไปใช้ในการควบคุมการระบาดของเชื้อในกุ้ง ประสิทธิผลของการใช้ขมิ้นชันร่วมในการรักษาผู้ป่วยโรคซึมเศร้า การศึกษาประสิทธิภาพของตํารับยาสมุนไพรไทยที่มีคุณสมบัติกระตุ้นการเจริญของจุลินทรีย์ โพรไบโอติกในการเสริมภูมิคุ้มกัน และยับยั้งกลไกการเข้าสู่เซลล์ของไวรัสโคโรนาสายพันธุ์ใหม่ (COVID-19) เพื่อนําประยุกต์
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair