สืบค้นงานวิจัย
การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของ Tilapia lake virus (TiLV) และการพัฒนาวิธีตรวจสายพันธุ์ของไวรัสอย่างจำเพาะ
แสงจันทร์ เสนาปิน - สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ชื่อเรื่อง: การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของ Tilapia lake virus (TiLV) และการพัฒนาวิธีตรวจสายพันธุ์ของไวรัสอย่างจำเพาะ
ชื่อเรื่อง (EN): Investigation of genetic diversity of Tilapia lake virus (TiLV) and development of detection methods for TiLV genetic variants
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: แสงจันทร์ เสนาปิน
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
บทคัดย่อ: ไวรัส TiLV หรือ Tilapia lake virus นับเป็นไวรัสอุบัติใหม่ในอุตสาหกรรมการเพาะเลี้ยงปลานิล ขณะนี้มีการพบการติดเชื้อนี้ใน 14 ประเทศจาก 3 ทวีป (เอเชีย แอฟริกา และอเมริกาใต้) โดยเริ่มพบครั้งแรกในประเทศอิสราเอลในปีค.ศ. 2014 ส่วนในประเทศไทยมีรายงานครั้งแรกเมื่อต้นปีค.ศ. 2017 อย่างไรก็ตาม เมื่อคณะผู้วิจัยได้พัฒนาวิธีตรวจไวรัสแบบ Semi-nested PCR ได้สำเร็จ และนำไปตรวจตัวอย่างปลาป่วยที่เก็บดองไว้ตั้งแต่ปี 2012 ถึง 2016 ปรากฏผลว่าตัวอย่างปลาส่วนใหญ่ให้ผลเป็นบวก แสดงถึงการปรากฏของเชื้อไวรัสชนิดนี้เกิดขึ้นมานานก่อนที่จะมีการตรวจพบทางวิทยาศาตร์ครั้งแรก เบื้องต้นทางคณะผู้วิจัยได้ศึกษาข้อมูลทางพันธุกรรมบางส่วนของเชื้อไวรัสในตัวอย่างดังกล่าว พบว่าไวรัสชนิดนี้มีความแตกต่างกันทางพันธุกรรม เมื่อพิจารณาข้อมูลอัตราการตายของปลานิลที่เกิดจากเชื้อนี้ พบว่ามีความหลากหลายตั้งแต่ 20-90% บางครั้งสามารถตรวจพบไวรัส TiLV ในปลาที่มีสุขภาพแข็งแรงได้อีกด้วย (&lt;10% mortality) และกรณีล่าสุด คณะผู้วิจัยได้ตัวอย่างปลาที่มีรอยโรคตามลักษณะพยาธิสภาพยืนยันได้ว่าติดเชื้อไวรัส TiLV แต่กลับให้ผลเป็นลบกับวิธีตรวจที่ใช้อยู่ปัจจุบัน ข้อมูลดังกล่าวเหล่านี้ผนวกกับลักษณะทางธรรมชาติของไวรัสที่มีสารพันธุกรรมเป็นแบบ RNA ซึ่งมีการกลายพันธุ์ได้ค่อนข้างเร็ว ทำให้โครงการวิจัยมีเป้าหมายเพื่อ 1) ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อ TiLV จากแหล่งต่างๆที่เก็บดองไว้และตัวอย่างปลาใหม่ที่จะเก็บเพิ่มเติมในปี 2018-2019 2) เพื่อนำข้อมูลพันธุกรรมของเชื้อมาวิเคราะห์หาตำแหน่งในจีโนมของไวรัสที่มีความอนุรักษ์และความแปรปรวน และหาความสัมพันธ์ระหว่างสายพันธุ์ของไวรัสกับอัตราการตายของปลา และเพื่อ 3) พัฒนาวิธีตรวจไวรัสให้ครอบคลุมทุกสายพันธุ์และแบบจำเพาะต่อสายพันธุ์ที่มึความรุนแรงในการก่อโรค</p>
บทคัดย่อ (EN): Tilapia lake virus (TiLV) is a newly emerging RNA virus that has affected tilapia aquaculture industry on three continents (Asia, Africa and South America). The virus was discovered in 2014 in Israel and the number of countries where the agent has been detected is increasing rapidly (14 countries at present) as a result of increased awareness, surveillance and accessibility of rapid diagnostic tools. Thailand is one of the affected countries in Asia Pacific that reported emergence of the virus in 2017. However, our further investigation proved that the virus has been detected in archived samples collected from 2012 to 2016, indicating that TiLV might be a hidden pathogen in Thai tilapia farms before science knew its existence. The reported mortalities associated with TiLV outbreaks were extremely variable (20-90%) and recent cases of inapparent infections with no mortalities were also reported. Our preliminary results indicated the sequence variation among the viral isolates. Most recently, we experienced a case of disease outbreak where the affected fish showed pathognomonic lesion of TiLV infection, however, PCR gave negative result. It is well known that RNA virus is normally mutated rapidly, resulted in different genetic variants with different virulent levels. Due to these characteristics, molecular detection requires timely improvements or newly developed methods that cover different genetic variants. Currently, little is known about genetic diversity of TiLV. This project aims to investigate 1) genetic diversity of TiLV from different geographical locations, including archived and newly collected samples from 2012-2019 in Thailand; 2) conserved and variable regions in the TiLV genomes and correlation with their virulence; and 3) develop new PCR methods for detection of variants associated with high mortality and all genetic variants.</p>
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
คำสำคัญ: ปลานิล; ไวรัส TiLV; จีโนม; ความหลากหลายทางพันธุกรรม; อนุรักษ์; ความแปรปรวน; พีซีอาร์; การตรวจโรค
คำสำคัญ (EN): Detection
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของ Tilapia lake virus (TiLV) และการพัฒนาวิธีตรวจสายพันธุ์ของไวรัสอย่างจำเพาะ
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
2562
Inapparent infection cases of tilapia lake virus (TiLV) in farmed tilapia การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของประชากรปลาเผาะ (Pangasius bocourti) การศึกษาความหลากหลายของยีน HSP 70 ในไก่พื้นเมืองไทยสายพันธุ์ต่างๆ การจำแนกสายพันธุ์และความต้านทานต่อโรค Streptococcosis ของปลานิล (Oreochromis niloticus Linnaeus) การศึกษาโครงสร้างและความหลากหลายทางพันธุกรรมในแมวพันธุ์ไทยเปรียบเทียบกับพันธุ์ต่างประเทศ เพื่อประโยชน์ในงานทางด้านนิติวิทยาศาสตร์ การรวบรวมพันธุ์และการศึกษาลักษณะเพื่อคัดเลือกสายพันธุ์ของมะแขว่น Tilapia lake virus (TiLV) from Peru is genetically close to the Israeli isolates ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธุ์ข้าวไร่พื้นเมืองในแขวงเซกองประเทศสาธารณรัฐประชาธิปไตยประชาชนลาว การแสดงออกของพันธุ์และสายพันธุ์ถั่วฝักยาวในการปลูกแบบอินทรีย์และแบบใช้สารเคมี การพัฒนาและปรับปรุงพันธุ์ทานตะวันกินเมล็ดเพื่อพันธุ์การค้า
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก