สืบค้นงานวิจัย
การศึกษาความหลากหลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ reduced polyketides จากราที่แยกได้ในประเทศไทย
สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์ - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
ชื่อเรื่อง: การศึกษาความหลากหลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ reduced polyketides จากราที่แยกได้ในประเทศไทย
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Suranat Phonghanpot
บทคัดย่อ: polyketide จากรา เป็นสารประกอบ secondary metabolite ที่สำคัญชนิดหนึ่งที่สามารถนำมาพัฒนาเป็นยารักษาโรคได้อย่างมีประสิทธิภาพ เช่น lovastatin เป็นต้น อย่างไรก็ตาม การค้นหา polyketides ชนิดใหม่จากราที่เจริญยากในห้องปฎิบัติการด้วยวิธีการคัดเลือกทางเคมีมีข้อจำกัดหลายประการ ในการศึกษานี้จึงได้พัฒนาวิธีทางชีวโมเลกุล เพื่อใช้ในการค้นหาศักยภาพของราที่แยกได้ในประเทศไทยในการสร้างสารประกอบในกลุ่ม polyketide โดยการโคลนยีน polyketide synthase type I [PKS] ด้วยวิธี PCR โดยใช้ KA-series primer ที่ออกแบบให้จำเพาะต่อยีน reducing PKS และใช้เทคนิคทางด้าน phylogenetic ในการศึกษาคุณสมบัติของยีนที่โคลนได้ ราที่ใช้ในการศึกษา ได้แก่ insect pathogenic fungi marine fungi และ lichenized fungi ทั้งหมด 20 ชนิด ผลการศึกษาพบว่า สามารถโคลนยีน PKS ได้ 65 ยีน และนำยีนมาจัดกลุ่มได้ 7 กลุ่ม ด้วยวิธี neighbor joining ได้แก่ กลุ่ม HRA HRB HRC HRD HRE HRF HRG โดยกลุ่ม HRE and HRG เป็นกลุ่มใหม่ ซึ่งยีนที่โคลนได้ถูกจัดให้ใกล้เคียงกับยีนที่ยังไม่ทราบหน้าที่ในการสังเคราะห์ polyketide นอกจากนี้ยังสามารถพบยีน PKS ที่น่าจะมีลักษณะจำเพาะกับราในกลุ่มต่างๆ ได้แก่ ยีน PKS จาก insect pathogenic fungi ซึ่งจัดอยุ่ใกล้เคียงกันในกลุ่ม HRC ยีน PKS จาก marine fungi ซึ่งพบได้ในกลุ่ม HRE และเป็นที่น่าสนใจว่า เมื่อเปรียบเทียบการจัดจำแนกยีน PKS กับ internal transcribed spacer (ITS) phylogenetic tree แล้ว พบว่ายีนในกลุ่ม HRC พบเฉพาะราในชั้น Sordariomycetes เท่านั้น ผลที่ได้จากการศึกษานี้ สามารถค้นพบยีน PKS ในกลุ่มใหม่ๆ และยีนในกลุ่มที่น่าสนใจ ซึ่งสามารถนำมาใช้ศึกษาศักยภาพของราในการสังเคราะห์สารประกอบ polyketide ที่มีค่าในอนาคต
บทคัดย่อ (EN): insect pathogenic fungi, marine fungi, and lichenized fungi. Using PCR amplification with KA-series primer pairs, 65 PKS gene fragments were identified from these fungi. Phylogenetic analysis of these cloned PKS sequences with other fungal PKS in the NCBI database using neighbor joining method revealed 7 groups of reducing PKS. Among these groups, some PKS in 5 groups were identified for functions. There are 2 novel groups: HRE and HRG with unknown functions. Interestingly, many PKS genes from marine fungi were clustered together in the group HRE, whereas those from insect pathogenic fungi were in group HRC. Furthermore, comparison between the PKS phylogenetic tree and the ITS-derived fungal species tree indicated that group HRC PKS are solely identified in Sordariomycetes. The use of unexploited resources in Thailand and use of different PKS regions for phylogenetic analysis (from KS domain to KS-AT interdomain) in this study lead to the identification of many novel genes and groups within the fungal reducing PKS.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=54&RecId=8894&obj_id=25283
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
คำสำคัญ: การสังเคราะห์
คำสำคัญ (EN): Phylogenetics Analysis
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
รายละเอียด: insect pathogenic fungi, marine fungi, and lichenized fungi. Using PCR amplification with KA-series primer pairs, 65 PKS gene fragments were identified from these fungi. Phylogenetic analysis of these cloned PKS sequences with other fungal PKS in the NCBI database using neighbor joining method revealed 7 groups of reducing PKS. Among these groups, some PKS in 5 groups were identified for functions. There are 2 novel groups: HRE and HRG with unknown functions. Interestingly, many PKS genes from marine fungi were clustered together in the group HRE, whereas those from insect pathogenic fungi were in group HRC. Furthermore, comparison between the PKS phylogenetic tree and the ITS-derived fungal species tree indicated that group HRC PKS are solely identified in Sordariomycetes. The use of unexploited resources in Thailand and use of different PKS regions for phylogenetic analysis (from KS domain to KS-AT interdomain) in this study lead to the identification of many novel genes and groups within the fungal reducing PKS.
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์. "การศึกษาความหลากหลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ reduced polyketides จากราที่แยกได้ในประเทศไทย". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2548

สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์. "การศึกษาความหลากหลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ reduced polyketides จากราที่แยกได้ในประเทศไทย". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2548. Print.



TARR Wordcloud:
การศึกษาความหลากหลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ reduced polyketides จากราที่แยกได้ในประเทศไทย
สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
2548
การแยกยีน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ depudecin จาก Xylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170 การโคลนยีน polyketide synthase จากรา Xylaria sp. BCC 1067 การทดสอบความสัมพันธ์ระหว่างอัตราการเปลี่ยนแปลงของดัชนีราคาตลาดหลักทรัพย์แห่งประเทศไทยกับอัตราการเจริญเติบโตทางเศรษฐกิจของประเทศไทย ผลกระทบของการส่งออกสินค้าในภาคการเกษตรต่อความมั่นคงทางอาหารในประเทศไทย ในประเทศไทย การโคลนและการแสดงออกของยีนไคติเนสที่แยกได้จาก Beauveria bassiana ใน Escherichia Coli ความหลากหลายทางชีวภาพของราเอนโดไฟท์และความสามารถในการสร้าง สาร 2-Acetyl-1-Pyrroline ของราที่แยกได้จากข้าวพันธุ์ต่าง ๆ ในประเทศไทย ศึกษาเปรียบเทียบวิธีการกำจัดสิ่งเจือปนและการแยกส่วนของการหาปริมาณสารประกอบออร์กาโนคลอลีนในปลานำจือโดยใช้เทคนิคแก๊สโครมาโตกราฟี สำหรับประเทศไทย การหาลักษณะจำเพาะของยีนเซลลูเลสและไซลาเนสจากแบคทีเรีย ในกระเพาะหมักของวัว
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair