สืบค้นงานวิจัย
TSD: ฐานข้อมูลของการจัดเก็บข้อมูลชีววิทยาของอ้อย และเครื่องมือที่เป็นคอมพิวเตอร์ซอฟท์แวร์ผ่านเว็บ
ปิยรัตน์ พลยะเรศ - มหาวิทยาลัยขอนแก่น
ชื่อเรื่อง: TSD: ฐานข้อมูลของการจัดเก็บข้อมูลชีววิทยาของอ้อย และเครื่องมือที่เป็นคอมพิวเตอร์ซอฟท์แวร์ผ่านเว็บ
ชื่อเรื่อง (EN): TSD: a database of sugarcane biological data collection and web-based computer software tools
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ปิยรัตน์ พลยะเรศ
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Piyarat Ponyared
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
บทคัดย่อ: อ้อยเป็นพืชเศรษฐกิจที่สำคัญของไทย ทีมวิจัยของเราให้ความสนใจศึกษาสรีรวิทยา พันธุศาสตร์ และชีวโมเลกุลของอ้อย และได้ผลิตข้อมูลจำนวนมากจากสองแนวทาง คือ งานทดลองที่อาศัยคอมพิวเตอร์ และงานทดลองที่อาศัยสารเคมี ข้อมูลเหล่านี้ ได้แก่ เครื่องหมายดีเอ็นเอชนิด EST-derived SSR เครื่องหมายดีเอ็นเอชนิด EST-derived SNP เครื่องหมายโปรตีนจากการระบุด้วยเทคนิค 2D-gel และ LC-MS ข้อมูลที่มีความหลากหลายเหล่านี้จำเป็นต้องมีการบูรณาการเพื่อช่วยอธิบายถึงความสัมพันธ์ระหว่างกัน ดังนั้นเพื่อให้บรรลุถึงเป้าหมายดังกล่าว ทีมวิจัยของเราจึงได้สร้างระบบชีวสารสนเทศ สำหรับฐานข้อมูลทางชีววิทยาของอ้อย ให้ชื่อว่า Thai sugarcane database (TSD) ซึ่งบทความนี้จะนำเสนอส่วนของ TSD ที่ใช้จัดเก็บเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิด EST-derived SSR และเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิด EST-derived SNP นอกจากนี้ยังมีการติดตั้งเครื่องมือที่เป็นคอมพิวเตอร์ซอฟท์แวร์ใช้งานผ่านทางเว็บ มาพร้อมกับ TSD เครื่องมือทางคอมพิวเตอร์ ซอฟท์แวร์นี้จะทำให้ผู้ใช้เข้าสู่ TSD และเข้าแหล่งข้อมูลอื่นผ่านทางลิงค์ การติดตั้งเครื่องมือนี้ช่วยรับรองการบูรณาการของการใช้ประโยชน์ของ TSD กับฐานข้อมูลสาธารณะ เช่น GenBank ระบบชีวสารสนเทศที่ประกอบด้วยฐานข้อมูลและเครื่องมือคอมพิวเตอร์ที่ใช้งานผ่านทางเว็บ จึงมีคุณค่าต่อการวิเคราะห์ข้อมูลชีววิทยาจากการทดลองที่อาศัยสารเคมีของกลุ่มวิจัยที่มีการสะสมปริมาณงานเพิ่มมากขึ้น และเป็นแนวทางให้ทีมวิจัยกำหนดงานวิจัยในอนาคตทั้งด้านการทดลองด้วยคอมพิวเตอร์และการทดลองที่อาศัยสารเคมี และทำให้เกิดองค์ความรู้ในด้านชีววิทยาของอ้อยอย่างลึกซึ้ง
บทคัดย่อ (EN): Sugarcane is an economic important crop of Thailand. Physiology, genetics and molecular biology of sugarcane are of our interest. A wealth of data has been produced by both computational-based and chemical reagent-based experimental works such as EST-derived SSR markers, EST-derived SNP markers, protein markers identified by 2D-gel and LC-MS. These diverse data would be integrated to describe the meaningful relationships in biological processes of sugarcane. To achieve this goal, a bioinformatic system for sugarcane biology database has been established namely Thai sugarcane database (TSD). A section of TSD database collecting EST-derived SSR markers and EST-derived SNP markers is presented in this article. Another feature, web-based application is equipped with TSD database allowing querying of TSD database and several links. This feature guarantees a high integration with other public database such as GenBank. Bioinformatic system combining the database and web-based applications are therefore valuable tool for the analysis of the increasing quantities of biological data resulting from chemical reagent laboratory works of our group. It will also guide us to design future computational-based and chemical reagent-based experimental works and gain more in-depth knowledge of sugarcane biology.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
จำนวนหน้า: 6
เอกสารแนบ: https://ag2.kku.ac.th/kaj/PDF.cfm?filename=273.pdf&id=654&keeptrack=22
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยขอนแก่น
คำสำคัญ: ชีววิทยาอ้อย
คำสำคัญ (EN): Bioinformatics and Database
หมวดหมู่:
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
TSD: ฐานข้อมูลของการจัดเก็บข้อมูลชีววิทยาของอ้อย และเครื่องมือที่เป็นคอมพิวเตอร์ซอฟท์แวร์ผ่านเว็บ
มหาวิทยาลัยขอนแก่น
2555
เปรียบเทียบการใช้ชนิดและปริมาณปุ๋ยอินทรีย์ในการปลูกอ้อยเพื่อเกษตรกรรายย่อยใน อำเภอศรีเทพ จังหวัดเพชรบูรณ์ การจัดทำระบบฐานข้อมูลสารสนเทศพื้นที่ความเหมาะสมและการจัดการดินสำหรับการปลูกอ้อยบนอุปกรณ์อัจฉริยะ การจัดทำระบบฐานข้อมูลสารสนเทศพื้นที่ความเหมาะสมและการจัดการดินสำหรับการปลูกอ้อยในภาคตะวันออกเฉียงเหนือ โครงการการจัดทำระบบฐานข้อมูลสารสนเทศพื้นที่ความเหมาะสมและการจัดการดินสำหรับการปลูกอ้อยบนอุปกรณ์อัจฉริยะ ชีววิทยาบางประการของปลาชะโด ชีววิทยาบางประการของปลาดุกด้านในจังหวัดพิจิตร โครงการพัฒนาฐานข้อมูลข้าวเหนียวเพื่อความมั่นคงทางอาหาร ชีววิทยาบางประการของกบอ๋องข้างลายในจังหวัดเชียงใหม่ ชีววิทยาเพื่อการเพาะพันธุ์ของปลารากกล้วยในแม่น้ำวัง จังหวัดลำปาง(ชีววิทยาบางประการของปลารากกล้วยในแม่น้ำวังจังหวัดลำปาง) การคัดเลือกพันธุ์อ้อยเพื่อเพิ่มผลผลิตอ้อยและคุณภาพอ้อยลูกผสม ชุด CSB10 ขั้นที่ 4 เปรียบเทียบพันธุ์มาตรฐาน ในอ้อยปลูก อ้อยตอ 1 และอ้อยตอ 2
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก