สืบค้นงานวิจัย
การถอดรหัสพันธุกรรมของจีโนมไมโทคอนเดรีย ของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) และการเปรียบเทียบจีโนมในนิวเคลียสของจระเข้ไทยกับจระเข้น้ำเค็ม (Crocodylus porosus)
อมรา ทองปาน - มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
ชื่อเรื่อง: การถอดรหัสพันธุกรรมของจีโนมไมโทคอนเดรีย ของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) และการเปรียบเทียบจีโนมในนิวเคลียสของจระเข้ไทยกับจระเข้น้ำเค็ม (Crocodylus porosus)
ชื่อเรื่อง (EN): Decoding of mitochondrial genome in Siamese Crocodile (Crocodylus siamensis) and comparison of nuclear genomes in Siamease crocodile to those of salt water crocodile (Crocodylus porosus)
บทคัดย่อ: ตัวอย่างเลือดจระเข้ทำที่เก็บจากแหล่งต่างๆของประเทศไทยทั้งแหล่งธรรมชาติและฟาร์มเลี้ยงต่างๆแล้วทำการสกัดดีเอ็นเอ ในส่วนของไมโทคอนเดรียนั้น นำข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของจระเข้ชนิดต่างๆจำนวน 7 สปีชีส์ที่มีอยู่ใน GenBank ซึ่งได้แก่ Alligator sinensis, Aligator mississippiensis, Caiman crocodile, Crocodylus ninoticus, Crocodylus porosus, Gavialis gangeticus และ Tomistoma schlegelii มาเปรียบเทียบหาส่วนอนุรักษ์ของจระเข้ทั้ง 7 ชนิด โดยใช้โปรแกรม Clustal W แล้วออกแบบไพร์เมอร์จากส่วนดังกล่าวให้ครอบคลุมทั้งจีโนมของไมโทคอนเดรีย สังเคราะห์ไพร์เมอร์ ทำปฏิกิริยาลูกโซ่จนกระทั่งได้แถบดีเอ็นเอที่คาดไว้ หลังจากนั้นโคลนชิ้นดีเอ็นเอดังกล่าวในพลาสมิด pGEM-T ทรานสฟอร์มเข้าสู่ E. coli หาลำดับยีนที่สมบูรณ์พร้อมทั้งกำหนดรหัสเริ่มต้นและรหัสหยุด จีโนมไมโทคอนเดรียที่สมบูรณ์ของจระเข้มีจำนวน 13 ยีน อยู่บนสาย H และ 8 ยีนอยู่บนสาย L รวมเป็นขนาดประมาณ 17 กิโลเบส หลังจากนั้นพัฒนายีนดังกล่าวเป็นเครื่องหมายดีเอ็นเอสำหรับใช้ในการบ่งชี้จีโนมไมโทคอนเดรียของจระเข้ไทยได้ทั้งสิ้น 7 เครื่องหมาย และสามารถสร้างสายวิวัฒนาการของจระเข้ต่างๆ ในอันดับ Crocodylia นอกจากนี้จากการทำ genomic in situ hybridization ยังพบว่าจีโนมของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) กับจีโนมของจระเข้น้ำเค็ม (C. porosus) มีความคล้ายคลึงกันมาก ตัวอย่างเลือดจระเข้ทำที่เก็บจากแหล่งต่างๆของประเทศไทยทั้งแหล่งธรรมชาติและฟาร์มเลี้ยงต่างๆแล้วทำการสกัดดีเอ็นเอ ในส่วนของไมโทคอนเดรียนั้น นำข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของจระเข้ชนิดต่างๆจำนวน 7 สปีชีส์ที่มีอยู่ใน GenBank ซึ่งได้แก่ Alligator sinensis, Aligator mississippiensis, Caiman crocodile, Crocodylus ninoticus, Crocodylus porosus, Gavialis gangeticus และ Tomistoma schlegelii มาเปรียบเทียบหาส่วนอนุรักษ์ของจระเข้ทั้ง 7 ชนิด โดยใช้โปรแกรม Clustal W แล้วออกแบบไพร์เมอร์จากส่วนดังกล่าวให้ครอบคลุมทั้งจีโนมของไมโทคอนเดรีย สังเคราะห์ไพร์เมอร์ ทำปฏิกิริยาลูกโซ่จนกระทั่งได้แถบดีเอ็นเอที่คาดไว้ หลังจากนั้นโคลนชิ้นดีเอ็นเอดังกล่าวในพลาสมิด pGEM-T ทรานสฟอร์มเข้าสู่ E. coli หาลำดับยีนที่สมบูรณ์พร้อมทั้งกำหนดรหัสเริ่มต้นและรหัสหยุด จีโนมไมโทคอนเดรียที่สมบูรณ์ของจระเข้มีจำนวน 13 ยีน อยู่บนสาย H และ 8 ยีนอยู่บนสาย L รวมเป็นขนาดประมาณ 17 กิโลเบส หลังจากนั้นพัฒนายีนดังกล่าวเป็นเครื่องหมายดีเอ็นเอสำหรับใช้ในการบ่งชี้จีโนมไมโทคอนเดรียของจระเข้ไทยได้ทั้งสิ้น 7 เครื่องหมาย และสามารถสร้างสายวิวัฒนาการของจระเข้ต่างๆ ในอันดับ Crocodylia นอกจากนี้จากการทำ genomic in situ hybridization ยังพบว่าจีโนมของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) กับจีโนมของจระเข้น้ำเค็ม (C. porosus) มีความคล้ายคลึงกันมาก
บทคัดย่อ (EN): Blood samples of crocodiles were collected from many places in natural habitats and farms. DNA were extracted from blood samples, while mitochondrial genome data were obtained from 7 species, Alligator sinensis, Aligator mississippiensis, Caiman crocodile, Crocodylus ninoticus, Crocodylus porosus, Gavialis gangeticus and Tomistoma schlegelii, which are available in the GenBank. All sequences were aligned using the Clustal W open source software and some conserved sequences were selected for primer sites. Primers were designed for expected whole mitochondrial genome. PCR was performed and genomic DNAs were used as templates. Amplified PCR fragments of all genes and regions were cloned into the pGEM-T plasmid and transformed into E. coli host cell. All genes were pointed out the start and stop codons. There were 13 genes on H-strand and 7 genes on the L-strand. These mitochondrial genes could be used for constructing phylogenetic tree of Crocodylian order. Genomic in situ hybridization was performed and it revealed the closedly relative between both Siamese and Salt water crocodiles.Blood samples of crocodiles were collected from many places in natural habitats and farms. DNA were extracted from blood samples, while mitochondrial genome data were obtained from 7 species, Alligator sinensis, Aligator mississippiensis, Caiman crocodile, Crocodylus ninoticus, Crocodylus porosus, Gavialis gangeticus and Tomistoma schlegelii, which are available in the GenBank. All sequences were aligned using the Clustal W open source software and some conserved sequences were selected for primer sites. Primers were designed for expected whole mitochondrial genome. PCR was performed and genomic DNAs were used as templates. Amplified PCR fragments of all genes and regions were cloned into the pGEM-T plasmid and transformed into E. coli host cell. All genes were pointed out the start and stop codons. There were 13 genes on H-strand and 7 genes on the L-strand. These mitochondrial genes could be used for constructing phylogenetic tree of Crocodylian order. Genomic in situ hybridization was performed and it revealed the closedly relative between both Siamese and Salt water crocodiles.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
คำสำคัญ: โครโคดิเลีย
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

อมรา ทองปาน. "การถอดรหัสพันธุกรรมของจีโนมไมโทคอนเดรีย ของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) และการเปรียบเทียบจีโนมในนิวเคลียสของจระเข้ไทยกับจระเข้น้ำเค็ม (Crocodylus porosus)Decoding of mitochondrial genome in Siamese Crocodile (Crocodylus siamensis) and comparison of nuclear genomes in Siamease crocodile to those of salt water crocodile (Crocodylus porosus)". มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 2552

อมรา ทองปาน. "การถอดรหัสพันธุกรรมของจีโนมไมโทคอนเดรีย ของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) และการเปรียบเทียบจีโนมในนิวเคลียสของจระเข้ไทยกับจระเข้น้ำเค็ม (Crocodylus porosus)Decoding of mitochondrial genome in Siamese Crocodile (Crocodylus siamensis) and comparison of nuclear genomes in Siamease crocodile to those of salt water crocodile (Crocodylus porosus)". มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 2552. Print.



TARR Wordcloud:
การถอดรหัสพันธุกรรมของจีโนมไมโทคอนเดรีย ของจระเข้ไทย (Crocodylus siamensis) และการเปรียบเทียบจีโนมในนิวเคลียสของจระเข้ไทยกับจระเข้น้ำเค็ม (Crocodylus porosus)
อมรา ทองปาน
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
30 กันยายน 2552
ปัจจัยการเจริญเติบโตชนิดใหม่ในเลือดจระเข้น้ำจืดพันธุ์ไทย สถานการณ์การค้าจระเข้น้ำจืด (Crocodylus siamensis Schneider, 1801) ภายใต้อนุสัญญาไซเตสของประเทศไทยในช่วงปี 2548-2555 การถอดรหัสจีโนมในไมโทคอนเดรียของปูแสม 3 ชนิดในสกุล Episesarma (E. mederi, E. versicolor และ E. singaporense) และการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลสำหรับระบุชนิดและวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม เพื่อการจัด การพัฒนาน้ำดีจระเข้เป็นอาหารเพื่อสุขภาพ โปรติโอมิกส์ของไข่ขาวของสัตว์เลื้อยคลาน(จระเข้ และตะพาบน้ำ) เวร่า โกลด์ น้ำว่านหางจระเข้ ความหลากหลายและการกระจายตัวทางชีวภูมิศาสตร์ของจระเข้ในสกุล Theriosuchus โครงการวิจัยและพัฒนาผลิตภัณฑ์โยเกิร์ตผสมว่านหางจระเข้ การพัฒนาผลิตภัณฑ์เครื่องสำอางจากว่านหางจระเข้สำหรับ ชุมชนตำบลหนองตาแต้ม จังหวัดประจวบคีรีขันธ์ ประสิทธิภาพของสารสกัดจากเปลือกว่านหางจระเข้ในการควบคุมหนอนใยผัก
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair