สืบค้นงานวิจัย
การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ
Supajit Sraphet - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ
ชื่อเรื่อง (EN): (Penaeus monodon)‬
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Supajit Sraphet
บทคัดย่อ: กุ้งกุลาดำเป็นสัตว์เศรษฐกิจที่มีความสำคัญของประเทศไทย ปัจจุบันปัญหาการเพาะเลี้ยงรวมถึงการคัดเลือกพ่อ-แม่พันธุ์ได้ส่งผลกระทบต่อผลผลิตกุ้งกุลาดำเป็นอย่างมาก จึงได้มีการนำเอาความรู้ทางด้านอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์มาประยุกต์ใช้ในการแก้ปัญหาดังกล่าว งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรม AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ และเปลี่ยนเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR โดยได้ทำการสุ่มตัวอย่างกุ้งกุลาดำอายุ 151 วัน และจำแนกเป็น 4 กลุ่มตามขนาดและเพศเพื่อนำมาใช้ในการวิเคราะห์โดยใช้เทคนิค AFLPโดยใช้ไพรเมอร์ทั้งสิ้น 101 คู่ ระหว่าง EcoRI-CNN หรือ TNN และ MseI-CNN และผลการวิเคราะห์ พบ 25 โพลีมอร์ฟิซึม จากไพรเมอร์ 20 คู่ ซึ่งแบ่งเป็น 2 โพลีมอร์ฟิซึมที่พัฒนาได้จากกุ้งขนาดใหญ่ 14 โพลีมอร์ฟิซึมจากกุ้งขนาดเล็ก 3 โพลีมอร์ฟิซึมจากกุ้งเพศผู้ และ 6 โพลีมอร์ฟิซึมจากกุ้งเพศเมีย เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP ที่พัฒนาได้ทั้งหมดถูกนำมาพัฒนาเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR จากนั้นจึงนำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้งกุลาดำที่ใช้ในการวิเคราะห์ AFLP และพบว่าเครื่องหมายพันธุกรรม SF-E51M29 สามารถตรวจสอบความแตก ต่างระหว่างกุ้งกุลาดำขนาดใหญ่และขนาดเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 83% โดยโพลีมอร์ฟิซึมที่พบนั้นเป็นผลมาจากการเกิดเพิ่มและ/หรือขาดหายของนิวคลีโอไทด์ และเครื่องหมายพันธุกรรม SF-E20M24 สามารถตรวจสอบความแตกต่างระหว่างกุ้งกุลาดำขนาดใหญ่และขนาดเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 83% เมื่อวิเคราะห์กับตัวอย่างดีเอ็นเอกุ้งที่ผ่านขั้นตอน pre-selective amplification แล้ว ส่วนเครื่องหมายพันธุกรรมอื่นๆ ที่เหลือไม่สามารถตรวจสอบโพลีมอร์ฟิซึมได้แม้ทดสอบโดยวิธี SSCP (Single Strand Conformational Polymorphism) เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP และ SCAR ที่พัฒนาขึ้นทั้งหมดนี้สามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการคัดเลือกและพัฒนาสายพันธุ์ รวมถึงการสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมของกุ้งกุลาดำได้
บทคัดย่อ (EN): Although Penaeus monodon is the most economically important shrimp species in Thailand, broodstock selection is limited: molecular biology and genetics seem to be a promising method to overcome the problem. The objectives of this study were to develop AFLP markers specific to the growth trait of the P. monodon and to convert all identified AFLP markers to SCAR markers. A total of 101 primer combinations of EcoRI-CNN or TNN and MseI-CNN were used to screen 151 day old shrimp which were classified into 4 different groups according to their weight and sex. A total of 25 AFLP markers were identified from 20 primer pairs. Of these, 16 markers were specific to the growth trait, while the other 3 markers were specific to male sex and 6 markers were specific to female sex. All polymorphic AFLP bands were converted to SCAR markers. The SCAR primers were tested against pooled and individual genomic DNAs. The results showed that one SCAR marker designated SF-E51M29 was identified with a polymorphism specific to the fast-growing trait with about 83% accuracy of phenotype prediction. The differences among polymorphic bands of the SF-E51M29 were due to insertion/deletions of nucleotides within the amplified region. Moreover, the SF-E20M24 showed the polymorphism specific to the fast growing trait with about 83% accuracy of phenotype prediction after testing with individual pre-amplified products. The PCR products from the rest of the SCAR primers showed no polymorphism even after further analysis using the Single Strand Conformational Polymorphism (SSCP) technique. However, the AFLP markers that were not converted to SCARs will be used in the construction of a genetic linkage map and the SF-E51M29 and SF-E20M24 markers will be useful for a marker assisted selection program of fast-growing P. monodon
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=2343&obj_id=1361
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Penaeus monodon
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: กุ้งกุลาดำเป็นสัตว์เศรษฐกิจที่มีความสำคัญของประเทศไทย ปัจจุบันปัญหาการเพาะเลี้ยงรวมถึงการคัดเลือกพ่อ-แม่พันธุ์ได้ส่งผลกระทบต่อผลผลิตกุ้งกุลาดำเป็นอย่างมาก จึงได้มีการนำเอาความรู้ทางด้านอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์มาประยุกต์ใช้ในการแก้ปัญหาดังกล่าว งานวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรม AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ และเปลี่ยนเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR โดยได้ทำการสุ่มตัวอย่างกุ้งกุลาดำอายุ 151 วัน และจำแนกเป็น 4 กลุ่มตามขนาดและเพศเพื่อนำมาใช้ในการวิเคราะห์โดยใช้เทคนิค AFLPโดยใช้ไพรเมอร์ทั้งสิ้น 101 คู่ ระหว่าง EcoRI-CNN หรือ TNN และ MseI-CNN และผลการวิเคราะห์ พบ 25 โพลีมอร์ฟิซึม จากไพรเมอร์ 20 คู่ ซึ่งแบ่งเป็น 2 โพลีมอร์ฟิซึมที่พัฒนาได้จากกุ้งขนาดใหญ่ 14 โพลีมอร์ฟิซึมจากกุ้งขนาดเล็ก 3 โพลีมอร์ฟิซึมจากกุ้งเพศผู้ และ 6 โพลีมอร์ฟิซึมจากกุ้งเพศเมีย เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP ที่พัฒนาได้ทั้งหมดถูกนำมาพัฒนาเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR จากนั้นจึงนำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้งกุลาดำที่ใช้ในการวิเคราะห์ AFLP และพบว่าเครื่องหมายพันธุกรรม SF-E51M29 สามารถตรวจสอบความแตก ต่างระหว่างกุ้งกุลาดำขนาดใหญ่และขนาดเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 83% โดยโพลีมอร์ฟิซึมที่พบนั้นเป็นผลมาจากการเกิดเพิ่มและ/หรือขาดหายของนิวคลีโอไทด์ และเครื่องหมายพันธุกรรม SF-E20M24 สามารถตรวจสอบความแตกต่างระหว่างกุ้งกุลาดำขนาดใหญ่และขนาดเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 83% เมื่อวิเคราะห์กับตัวอย่างดีเอ็นเอกุ้งที่ผ่านขั้นตอน pre-selective amplification แล้ว ส่วนเครื่องหมายพันธุกรรมอื่นๆ ที่เหลือไม่สามารถตรวจสอบโพลีมอร์ฟิซึมได้แม้ทดสอบโดยวิธี SSCP (Single Strand Conformational Polymorphism) เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP และ SCAR ที่พัฒนาขึ้นทั้งหมดนี้สามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการคัดเลือกและพัฒนาสายพันธุ์ รวมถึงการสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมของกุ้งกุลาดำได้
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Supajit Sraphet. "การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ(Penaeus monodon)‬". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2547

Supajit Sraphet. "การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ(Penaeus monodon)‬". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2547. Print.



TARR Wordcloud:
การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ
Supajit Sraphet
มหาวิทยาลัยมหิดล
2547
การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายติดภายในและการประมาณค่าอัตราพันธุกรรมต่อการเติบโตของกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon Fabricius, 1798 โดยวิธี Full-sib analysis การสืบค้นเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่จำเพาะต่อเพศในกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon โดยการวิเคราะห์ด้วยเอเอฟแอลพี ผลของปริมาณฟอสฟอรัสในอาหารต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon) ที่เลี้ยงในบ่อดินระบบความเค็มต่ำ การย่อยสลายของเสียบางชนิดในบ่อเลี้ยงกุ้งกุลาดำแบบพัฒนาโดยกลุ่มแบคทีเรีย การเจริญเติบโตและพัฒนาการของข้าวเหนียวก่าและการสร้างแบบจาลองการเจริญเติบโต อิทธิพลของความเค็มระดับต่ำที่มีการเจริญเติบโตอัตราการรอดตายและสรีรวิทยาการหายใจของลูกกุ้งกุลาดำวัยอ่อน (penaeus monodon fabricius) อิทธิพลของสารควบคุมการเจริญเติบโตต่อการเจริญพัฒนาเนื้อเยื่อใบของดาวเรืองชนิดต้นสูงที่เพาะเลี้ยงในสภาพปลอดเชื้อ ผลของความเค็มที่มีต่อการเจริญเติบโตและการเกิดปมรากของวัชพืชตระกูลถั่วบางชนิด
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair