สืบค้นงานวิจัย
Prevalence and extent of heteroresistance by next generation sequencing of multidrug-resistant tuberculosis
Operario D.J. - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Prevalence and extent of heteroresistance by next generation sequencing of multidrug-resistant tuberculosis
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Operario D.J.
บทคัดย่อ (EN): Amplicon-based Next Generation Sequencing (NGS) is an emerging method for Mycobacterium tuberculosis drug susceptibility testing (DST) but has not been well described. We examined 158 clinical multidrug-resistant M. tuberculosis isolates via NGS of 11 resistance-associated gene regions covering 3519 nucleotides. Across these gene regions, complete resistance or heteroresistance (defined as 1%-99% mutation) was present in at least one isolate in 6.3% of loci. The number of isolates with heteroresistance was highest for gyrA codon 94, rpoB codons 526 and 531, and embB codons 306, 372 and 406 (range 11-26% of isolates exhibited heteroresistance). 57% of MDR strains had heteroresistance of one or more recognized resistance-associated mutation. Heteroresistant loci generally exhibited high or low degrees of mutation (>90% or <10%). The deep sensitivity of NGS for detecting low level pncA heteroresistance appeared to improve genotypic-phenotypic PZA susceptibility correlations over that of Sanger. NGS demonstrates that heteroresistance in TB in the regions of key genes is common and will need to be bioinformatically managed. The clinical significance of such heteroresistance is unclear, and further study of pncA should be pursued. © 2017 Operario et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เอกสารแนบ (EN): https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85019745364&doi=10.1371%2fjournal.pone.0176522&partnerID=40&md5=46230176c41074a6a0efd91e8399ea21
เผยแพร่โดย (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Tuberculosis, Multidrug-Resistant
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Operario D.J.. "Prevalence and extent of heteroresistance by next generation sequencing of multidrug-resistant tuberculosis". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

Operario D.J.. "Prevalence and extent of heteroresistance by next generation sequencing of multidrug-resistant tuberculosis". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
Prevalence and extent of heteroresistance by next generation sequencing of multidrug-resistant tuberculosis
Operario D.J.
มหาวิทยาลัยมหิดล
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Risk factors for multidrug-resistant tuberculosis among patients with pulmonary tuberculosis at the central chest institute of Thailand จีโนมของไวรัสซิกาที่ติดเชื้อในยุงรำคาญจากการเพาะเลี้ยงในห้องปฏิบัติการโดย Next-generation sequencing Complete genome sequences of Zika virus from infected laboratory strains of Culex quinquefasciatus Genotypic diversity of multidrug-, quinolone- and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates in Thailand การเปรียบเทียบการตรวจหาเชื้อเอชไอวีดื้อยาต้านไวรัสอินทีเกรสด้วยวิธี In-house HIV Genotype Assay และ Next Generation Sequencing Comparison of In-house HIV Integrase Genotype Assay and Next Generation S Rapid molecular detection of multidrug- resistant tuberculosis by PCR-nucleic acid lateral flow immunoassay Delay in treatment initiation and treatment outcomes among adult patients with multidrug-resistant tuberculosis at Yangon Regional Tuberculosis Centre, Myanmar: A retrospective study Whole-genome sequencing analysis of serially isolated multi-drug and extensively drug resistant Mycobacterium tuberculosis from Thai patients การประยุกต์ใช้เทคโนโลยี Next-generation sequencing ในการศึกษาความหลากหลายและความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการของหิ่งห้อยที่พบในภาคใต้ของประเทศไทย Drug-resistant Mycobacterium tuberculosis and its genotypes isolated from an outbreak in western Thailand. Aedesin: Structure and antimicrobial activity against multidrug resistant bacterial strains
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair