สืบค้นงานวิจัย
การศึกษาและทำให้กลายพันธุ์ในยีน D-amino acid dehydrogenase homologue ใน Xanthomonas campestris pv. phaseoli
Rattiya Cheewapat - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การศึกษาและทำให้กลายพันธุ์ในยีน D-amino acid dehydrogenase homologue ใน Xanthomonas campestris pv. phaseoli
ชื่อเรื่อง (EN): Characterization and mutagenesis of D-amino acid dehydrogenase homologue gene in Xanthomonas campestris pv. phaseoli
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Rattiya Cheewapat
บทคัดย่อ: ยีน D-amino acid dehydrogenase (dadA) มีความสำ คัญในกระบวนการเคตาโบลิซึม ของอะลานีนโดยเร่งปฏิกิริยาออกซิเดชันย้ายหมู่อะมิโนจากไอโซเมอร์แบบดีของอะลานีนออกทำ ให้เกิดเป็นไพรูเวทและแอมโมเนียขึ้น ในเชื้อ Xanthomonas campestris pv. phaseoli (Xp)ได้ แยกยีน dadA-homologueโดยวิธี PCR จากพลาสมิด pZLG4 ได้ผลผลิตขนาด 1.4 kb เมื่อนำ ไปวิเคราะห์พบว่ายีน dadA-homologue มีขนาด 1.24 kb ลอกรหัสเป็นเปปไทด์ประกอบด้วย กรดอะมิโน 416 ตัว มีมวลโมเลกุล 47 kDa ยีนนี้มีความคล้าย Escherichia coli DadA 27% ซึ่ง มี FAD-motifs ที่พบได้ในแบคทีเรียชนิดอื่น ใน Xp พบว่ายีน dadA-homologue อยู่หน้ายีน gor ที่สร้างเอนไซม์ glutathione reductase ซึ่งทำ หน้าที่เปลี่ยน glutathione จากสภาพออกซิ ไดส์ให้กลับมาอยู่ในสภาพรีดิวซ์ โดย NADPH เป็นโคเอนไซม์ และยังพบได้ในเชื้อ Xanthomonas อีกหลายสปีชีส์ที่ทดสอบ การถอดรหัสของยีน dadA-homologue เป็นชนิด monocistronic นอกจากนี้เมื่อกระตุ้นการแสดงออกยีนด้วย H2O2, MD และ tBOOH พบว่า ระดับ mRNA ของยีนนี้ไม่เปลี่ยนแปลง เมื่อทำ ให้เกิดการกลายพันธุ์ของยีนนี้พบว่าอัตราการเจริญ เติบโตในอาหารเลี้ยงเชื้อที่เติม tBOOH ทำ ให้เชื้อกลายพันธุ์นี้และเชื้อที่กลายพันธุ์ที่ยีน gor มี อัตราการเจริญช้าลง เมื่อนำ แบคทีเรียกลายพันธุ์ทั้งสองชนิดไปทดสอบคุณสมบัติทางสรีรวิทยาพบ ว่ามีความไวต่อ H2O2 และ tBOOH เมื่อใส่ยีน dadA-homologue และ gor ที่ปกติเข้าไปใน แบคทีเรียกลายพันธุ์ที่ยีน dadA และ gor ตามลำ ดับพบว่าการแสดงออกกลับมาเป็นปกติและ สามารถป้องกันสภาวะเป็นพิษของ tBOOH ได้ โดยที่ความไวต่อ tBOOH ไม่เกี่ยวข้องกับระดับ ของ Ohr ซึ่งฟีโนไทป์นี้อาจจะเป็นผลจากการส่งเสริมของยีน dadA-homologue และ gor
บทคัดย่อ (EN): A gene encoded the homologue of D-amino acid dehydrogenase (dadAhomologue), an enzyme with an important role in oxidative deamination of alanine catabolism, was cloned from Xanthomonas campestris pv. phaseoli (Xp). The objective of this study was to explore the characteristics of dadAhomologue in order to establish the physiological role of dadA-homologue in oxidative stress response. The PCR analysis was used to amplify the 1.4-kp PCR product containing a dadA-homologue from a pZLG4 plasmid. Analysis of the nucleotide sequence revealed a putative ORF of 1.24 kb encoding a peptide with 416-amino acid and had a theoritical molecular mass of 47 kDa. The Xp DadA showed 27% identities to E. coli DadA. Amino acid sequence alignment revealed conserved FAD-motifs among various microorganisms. The phylogenetic tree constructed from DadA of various microorganisms classified Xp dadA-homologue into the same group as Agrobacterium tumefaciens. In Xp, dadA-homologue gene was located immediately upstream of glutathione reductase (gor), an enzyme responsible for generation of reduced glutathione from the oxidized one in a NADPH-dependent manner. The arrangment of dadA-homologue-gor is conserved among Xanthomonas strains. Northern blot analysis showed that dadA-homologue was transcribed as a monocistronic mRNA and could not be induced by exposure to oxidative stress such as H2O2, MD and tBOOH. The Xp dadA-homologue mutant was constructed by insertional inactivation technique. The growth rate of the Xp dadA-homologue and gor mutant was dramatically retarded when cultured in the presense of tBOOH. The plate sensitivity assay was performed and the results clearly showed that these mutants have increased sensitivity to H2O2 and tBOOH but not to MD. The increased sensitivity could be complemented by an expression of dadAhomologue or gor from a plasmid vector containing dadA-homologue and gor, respectively. High expression of dadA-homologue or gor in wild type Xp conferred more resistance against tBOOH killing. To sume up, the level of Ohr in Xp dadA mutant was not differenct compared to Xp-wildtype, suggesting that alteration in the tBOOH resistance level was not due to the changes in Ohr level
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=1632&obj_id=1084
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Xanthomonas
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: ยีน D-amino acid dehydrogenase (dadA) มีความสำ คัญในกระบวนการเคตาโบลิซึม ของอะลานีนโดยเร่งปฏิกิริยาออกซิเดชันย้ายหมู่อะมิโนจากไอโซเมอร์แบบดีของอะลานีนออกทำ ให้เกิดเป็นไพรูเวทและแอมโมเนียขึ้น ในเชื้อ Xanthomonas campestris pv. phaseoli (Xp)ได้ แยกยีน dadA-homologueโดยวิธี PCR จากพลาสมิด pZLG4 ได้ผลผลิตขนาด 1.4 kb เมื่อนำ ไปวิเคราะห์พบว่ายีน dadA-homologue มีขนาด 1.24 kb ลอกรหัสเป็นเปปไทด์ประกอบด้วย กรดอะมิโน 416 ตัว มีมวลโมเลกุล 47 kDa ยีนนี้มีความคล้าย Escherichia coli DadA 27% ซึ่ง มี FAD-motifs ที่พบได้ในแบคทีเรียชนิดอื่น ใน Xp พบว่ายีน dadA-homologue อยู่หน้ายีน gor ที่สร้างเอนไซม์ glutathione reductase ซึ่งทำ หน้าที่เปลี่ยน glutathione จากสภาพออกซิ ไดส์ให้กลับมาอยู่ในสภาพรีดิวซ์ โดย NADPH เป็นโคเอนไซม์ และยังพบได้ในเชื้อ Xanthomonas อีกหลายสปีชีส์ที่ทดสอบ การถอดรหัสของยีน dadA-homologue เป็นชนิด monocistronic นอกจากนี้เมื่อกระตุ้นการแสดงออกยีนด้วย H2O2, MD และ tBOOH พบว่า ระดับ mRNA ของยีนนี้ไม่เปลี่ยนแปลง เมื่อทำ ให้เกิดการกลายพันธุ์ของยีนนี้พบว่าอัตราการเจริญ เติบโตในอาหารเลี้ยงเชื้อที่เติม tBOOH ทำ ให้เชื้อกลายพันธุ์นี้และเชื้อที่กลายพันธุ์ที่ยีน gor มี อัตราการเจริญช้าลง เมื่อนำ แบคทีเรียกลายพันธุ์ทั้งสองชนิดไปทดสอบคุณสมบัติทางสรีรวิทยาพบ ว่ามีความไวต่อ H2O2 และ tBOOH เมื่อใส่ยีน dadA-homologue และ gor ที่ปกติเข้าไปใน แบคทีเรียกลายพันธุ์ที่ยีน dadA และ gor ตามลำ ดับพบว่าการแสดงออกกลับมาเป็นปกติและ สามารถป้องกันสภาวะเป็นพิษของ tBOOH ได้ โดยที่ความไวต่อ tBOOH ไม่เกี่ยวข้องกับระดับ ของ Ohr ซึ่งฟีโนไทป์นี้อาจจะเป็นผลจากการส่งเสริมของยีน dadA-homologue และ gor
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Rattiya Cheewapat. "การศึกษาและทำให้กลายพันธุ์ในยีน D-amino acid dehydrogenase homologue ใน Xanthomonas campestris pv. phaseoliCharacterization and mutagenesis of D-amino acid dehydrogenase homologue gene in Xanthomonas campestris pv. phaseoli". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2547

Rattiya Cheewapat. "การศึกษาและทำให้กลายพันธุ์ในยีน D-amino acid dehydrogenase homologue ใน Xanthomonas campestris pv. phaseoliCharacterization and mutagenesis of D-amino acid dehydrogenase homologue gene in Xanthomonas campestris pv. phaseoli". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2547. Print.



TARR Wordcloud:
การศึกษาและทำให้กลายพันธุ์ในยีน D-amino acid dehydrogenase homologue ใน Xanthomonas campestris pv. phaseoli
Rattiya Cheewapat
มหาวิทยาลัยมหิดล
2547
การศึกษาเกี่ยวกับการควบคุมยีนที่ตอบสนองต่อสาร organic hydroperoxide ในแบคทีเรีย Xanthomonas : การศึกษาระดับโมเลกุลของยีน PKD1 ในผู้ป่วยไทย การศึกษาคุณสมบัติของยีนมะเร็งของไวรัส HPV16 : ความหลากหลายของยีน แหล่งที่อยู่และหน้าที่การกระตุ้นการแสดงออกของยีน การศึกษาและตรวจสอบคุณสมบัติกลุ่มยีนการสร้าง rhamnolipid ในเชื้อ Burkholderia pseudomallei การศึกษาโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับกลไกการควบคุมการถอดรหัสของยีนที่ไม่แสดงออกในพืชที่ผ่านการถ่ายยีน การโคลนยีนจากพยาธิใบไม้ในตับชนิด Opisthorchis Viverrini และการวิเคราะห์โปรตีนที่ได้จากยีนต้นแบบ ผลของการเสริม Recombinant Saccharomyces cerevisiae ที่มียีน Fatty Acid Desaturase 2 (FAD 2) ต่อปริมาณกรดไขมันโอเมก้า 3 ในน้ำนมโค การศึกษาความหลากรูปข การจัดเรียงตัวของยีนและการเกิดดีเอ็นเอเมทิลเลชั่นบนโปรโมเตอร์ในพืชที่ผ่านกระบวนการถ่ายยีน การแยกโปรโมเตอร์ของยีน heat shock จากแบคทีเรียแลคติกโดยใช้ Green Fluorescent Protein (GFP) เป็นยีนแสดงผล
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair