สืบค้นงานวิจัย
ความหลากหลายของเชื้อ HIV-1 และ HLA class I : ผลกระทบต่อการออกแบบวัคซีน
Unchalee Visawapoka - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: ความหลากหลายของเชื้อ HIV-1 และ HLA class I : ผลกระทบต่อการออกแบบวัคซีน
ชื่อเรื่อง (EN): HIV-1 variation and HLA class I diversity : impact on vaccine design
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Unchalee Visawapoka
บทคัดย่อ: enzyme-linked immunospot (ELISpot) assay โดยการใช้ overlapping peptide pools 4 กลุ่มที่มี การเรียงลำดับตาม subtype A consensus, isolated strains ของ A, C และ D ของโปรตีน Gag and 3 กลุ่มของ subtypes A, C และ D ของโปรตีน Nef. พบว่าลักษณะของ CTL recognition ต่อ โปรตีน Gag และ Nef ในคนที่ติดเชื้อชนิด subtypes A มีลักษณะเหมือนกับคนที่ติดเชื้อชนิด subtypes B และ C โดยส่วนของโปรตีน p17 และ p24 ของ Gag และส่วนตอนกลางที่อนุรักษ์ ของ Nef เป็นตำแหน่งที่มี epitopes อยู่เป็นจำนวนมาก จากการทดสอบโดยใช้ชุดของเปปไทด์ ผสมที่มีการเรียงลำดับเหมือนกับ subtypes A, C และ D พบว่าชุดของเปปไทด์ที่มีชนิดเดียวกับ autologous infected subtype จะสามารถเพิ่มประสิทธิภาพของตรวจสอบการตอบสนองของ CTL ได้เพียงเล็กน้อย แม้การตอบสนองโดยการใช้ชุดเปปไทด์ที่ต่างกันจะมีลักณะเหมือนกัน แต่ในแต่ละชุดเปปไทด์จะสามารถตรวจพบการตอบสนองแบบเฉพาะที่ไม่สามารถตรวจพบได้ ด้วยเปปไทด์ชุดอื่น แสดงให้เห็นว่าความแตกต่างของลำดับเบสของไวรัสใน subtypes ที่ต่างกัน มีผลต่อ CTL recognition. ซึ่งข้อสรุปนี้ยืนยันได้จากการศึกษาความเหมือนและความต่างของ ลำดับของกรดอะมิโนระหว่าง autologous infected HIV-1 sequence และลำดับของชุดเปปไทด์ ที่ใช้ในการทดสอบการตอบสนองของ Cytotoxic T lymphocyte (CTL) การศึกษาการตอบสนองแบบ Cumulative Elispot-based CTL ที่สามารถจับได้กับ HLA class I alleles หลายชนิด รวมทั้งข้อมูลที่แสดงความหลากหลายของลำดับเบส จะเป็น ข้อมูลที่ช่วยแสดงลักษณะของตำแหน่งที่เป็น immunodominant ที่อยู่บน HIV-1 genome และ เป็นประโยชน์ในการเลือก epitopes ที่สามารถครอบคลุมในกลุ่มประชากรต่างๆได้ ผลการ ศึกษานี้เสนอแนะว่าการใช้ poly-epitope subtype-specific HIV-1 ร่วมกับ multiple immunodominant CTL epitopes จาก HIV-1 subtypes ชนิดที่แพร่ระบาดอยู่ในพื้นที่ จะเป็น แนวทางที่เหมาะสมเพื่อใช้ในการออกแบบวัคซีนเอดส์
บทคัดย่อ (EN): enzymelinked immunospot (ELIspot) assay using 4 overlapping peptide pools. These peptide pools were based on the sequence of subtype A consensus and isolated strains of A, C and D of Gag and 3 pools of subtypes A, C and D of Nef. The pattern of CTL recognition of Gag and Nef proteins in subtype A infection was similar to that seen in subtypes B and C with the p17 and p24 proteins of Gag and the central conserved of Nef were targeted with high density of defined epitopes. Screening of multiple peptide sets representing subtypes A, C and D revealed that the peptide sets based on the autologous infected subtype slightly improved the capacity to detect CTL response. Although similar numbers and patterns of responses were observed in different peptide sets, each set was capable of detecting the unique response that could not be identified by others indicating that the viral sequence variability between distinct subtypes may be involved in CTL recognition. This result was supported by an investigation of the influence of the matching and mismatching of amino acids between autologous infected HIV-1 sequence and the sequences of reagent peptide sets with cytotoxic T lymphocyte (CTL) response. A comprehensive study of cumulative Elispot-based CTL responses that can bind multiple HLA class I alleles combined with diversity and sequence consensus data provide an additional characterization of immunodominant regions encompassing the HIV-1 genome. This should facilitate the selection of epitopes with an increase of population coverage. Our results suggest that the construction of a poly-epitope subtype-specific HIV-1 that includes multiple immunodominant CTL epitopes from circulating predominant HIV-1 subtypes might be a logical approach in the design of vaccine against AIDS.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=3300&obj_id=4985
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): HLA Antigens
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: enzyme-linked immunospot (ELISpot) assay โดยการใช้ overlapping peptide pools 4 กลุ่มที่มี การเรียงลำดับตาม subtype A consensus, isolated strains ของ A, C และ D ของโปรตีน Gag and 3 กลุ่มของ subtypes A, C และ D ของโปรตีน Nef. พบว่าลักษณะของ CTL recognition ต่อ โปรตีน Gag และ Nef ในคนที่ติดเชื้อชนิด subtypes A มีลักษณะเหมือนกับคนที่ติดเชื้อชนิด subtypes B และ C โดยส่วนของโปรตีน p17 และ p24 ของ Gag และส่วนตอนกลางที่อนุรักษ์ ของ Nef เป็นตำแหน่งที่มี epitopes อยู่เป็นจำนวนมาก จากการทดสอบโดยใช้ชุดของเปปไทด์ ผสมที่มีการเรียงลำดับเหมือนกับ subtypes A, C และ D พบว่าชุดของเปปไทด์ที่มีชนิดเดียวกับ autologous infected subtype จะสามารถเพิ่มประสิทธิภาพของตรวจสอบการตอบสนองของ CTL ได้เพียงเล็กน้อย แม้การตอบสนองโดยการใช้ชุดเปปไทด์ที่ต่างกันจะมีลักณะเหมือนกัน แต่ในแต่ละชุดเปปไทด์จะสามารถตรวจพบการตอบสนองแบบเฉพาะที่ไม่สามารถตรวจพบได้ ด้วยเปปไทด์ชุดอื่น แสดงให้เห็นว่าความแตกต่างของลำดับเบสของไวรัสใน subtypes ที่ต่างกัน มีผลต่อ CTL recognition. ซึ่งข้อสรุปนี้ยืนยันได้จากการศึกษาความเหมือนและความต่างของ ลำดับของกรดอะมิโนระหว่าง autologous infected HIV-1 sequence และลำดับของชุดเปปไทด์ ที่ใช้ในการทดสอบการตอบสนองของ Cytotoxic T lymphocyte (CTL) การศึกษาการตอบสนองแบบ Cumulative Elispot-based CTL ที่สามารถจับได้กับ HLA class I alleles หลายชนิด รวมทั้งข้อมูลที่แสดงความหลากหลายของลำดับเบส จะเป็น ข้อมูลที่ช่วยแสดงลักษณะของตำแหน่งที่เป็น immunodominant ที่อยู่บน HIV-1 genome และ เป็นประโยชน์ในการเลือก epitopes ที่สามารถครอบคลุมในกลุ่มประชากรต่างๆได้ ผลการ ศึกษานี้เสนอแนะว่าการใช้ poly-epitope subtype-specific HIV-1 ร่วมกับ multiple immunodominant CTL epitopes จาก HIV-1 subtypes ชนิดที่แพร่ระบาดอยู่ในพื้นที่ จะเป็น แนวทางที่เหมาะสมเพื่อใช้ในการออกแบบวัคซีนเอดส์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Unchalee Visawapoka. "ความหลากหลายของเชื้อ HIV-1 และ HLA class I : ผลกระทบต่อการออกแบบวัคซีนHIV-1 variation and HLA class I diversity : impact on vaccine design". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2549

Unchalee Visawapoka. "ความหลากหลายของเชื้อ HIV-1 และ HLA class I : ผลกระทบต่อการออกแบบวัคซีนHIV-1 variation and HLA class I diversity : impact on vaccine design". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2549. Print.



TARR Wordcloud:
ความหลากหลายของเชื้อ HIV-1 และ HLA class I : ผลกระทบต่อการออกแบบวัคซีน
Unchalee Visawapoka
มหาวิทยาลัยมหิดล
2549
และความหลากหลายของ Cyt ความหลากหลายทางพันธุกรรมและการเก็บรวบรวมเชื้อพันธุ์ของมะหลอด ผลกระทบของปัจจัยแวดล้อมต่อความไวต่อยาต้านจุลชีพของเชื้อ burkholderia thailandensis ลักษณะทางฟีโนไทป์ของเชื้อ Burkholderia thailandensis ก่อนและหลังจากติดเชื้อ bacteriophage ที่แยกได้จากเชื้อ Burkholder ความหลากหลายของเชื้อรา Cladosporiod ที่พบบนพืชใบเลี้ยงเดี่ยวในจังหวัดเชียงใหม่ การศึกษาสภาวะที่เหมาะสมในการเพิ่มผลผลิตเซลล์ของเชื้อ Clostridium chauvoei เพื่อการผลิตวัคซีนแบลคเลก ความสัมพันธ์ของความหลากหลายทา ความหลากหลายทางชีวภาพและการควบคุมเชื้อไวรัสด่างเหลืองของซุคคินี (ZYMV) ในตระกูลแตง ความหลากหลายการแพร่กระจายและการติดเชื้อแบคทีเรีย Wolbachia ของแมลงกลุ่ม odonate ในนาข้าวในประเทศไทย การวิเคราะห์และการออกแบบกำแพงกันดิน
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair