สืบค้นงานวิจัย
Genotypic antimicrobial resistance assays for use on E. Coli isolates and stool specimens
Pholwat S. - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Genotypic antimicrobial resistance assays for use on E. Coli isolates and stool specimens
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Pholwat S.
บทคัดย่อ (EN): Antimicrobial resistance (AMR) is an emerging public health problem and methods for surveillance are needed. We designed 85 sequence-specific PCR reactions to detect 79 genes or mutations associated with resistance across 10 major antimicrobial classes, with a focus on E. coli. The 85 qPCR assays demonstrated >99.9% concordance with sequencing. We evaluated the correlation between genotypic resistance markers and phenotypic susceptibility results on 239 E. coli isolates. Both sensitivity and specificity exceeded 90% for ampicillin, ceftriaxone, cefepime, imipenem, ciprofloxacin, azithromycin, gentamicin, amikacin, trimethoprim/sulfamethoxazole, tetracycline, and chloramphenicol phenotypic susceptibility results. We then evaluated the assays on direct stool specimens and observed a sensitivity of 97% ± 5 but, as expected, a lower specificity of 75% ± 31 versus the genotype of the E. coli cultured from stool. Finally, the assays were incorporated into a convenient TaqMan Array Card (TAC) format. These assays may be useful for tracking AMR in E. coli isolates or directly in stool for targeted testing of the fecal antibiotic resistome. © 2019 Pholwat et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เอกสารแนบ (EN): https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-85065834888&doi=10.1371%2fjournal.pone.0216747&partnerID=40&md5=692a3f237c76755960cd801b1d894feb
เผยแพร่โดย (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): EMTREE medical terms
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Pholwat S.. "Genotypic antimicrobial resistance assays for use on E. Coli isolates and stool specimens". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

Pholwat S.. "Genotypic antimicrobial resistance assays for use on E. Coli isolates and stool specimens". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
Genotypic antimicrobial resistance assays for use on E. Coli isolates and stool specimens
Pholwat S.
มหาวิทยาลัยมหิดล
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Antimicrobial resistance, extended-spectrum b-Lactamase productivity, and class 1 integrons in Escherichia coli from healthy swine Prevalence of primary HIV drug resistance in Thailand detected by short reverse transcriptase genotypic resistance assay Use of dried blood spot specimens for in-house HIV drug resistance genotyping assay among infants in Thailand Molecular assays for antimalarial drug resistance surveillance: A target product profile The Use of covariance Technique in Screening Mungbean Accessions for Wterlogging Resistance Characterization of antibiotic resistance in Escherichia coli isolated from shrimps and their environment Implementation of global antimicrobial resistance surveillance system (GLASS) in patients with bacteremia Etiologic features of diarrheagenic microbes in stool specimens from patients with acute diarrhea in Thailand Performance of TaqMan array card to detect TB drug resistance on direct specimens Prevalence and antimicrobial resistance of Campylobacter spp. isolated from retail chicken products in central Thailand
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair