สืบค้นงานวิจัย
การค้นหาเครื่องหมายสนิปในยีน Perforin และ MHC class I alpha ที่สัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรค สเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล
สุวรักษ์ วงษ์โท - กรมประมง
ชื่อเรื่อง: การค้นหาเครื่องหมายสนิปในยีน Perforin และ MHC class I alpha ที่สัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรค สเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สุวรักษ์ วงษ์โท
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Suwarak Wongtho
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. กองวิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์
ชุดเอกสาร: -
บทคัดย่อ: การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อค้นหาสนิป (Single Nucleotide Polymorphism: SNP) ในยีนภูมิคุ้มกัน Perforin และยีน MHC class I alpha ที่สัมพันธ์กับความต้านทานโรคสเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล โดยดำเนินการออกแบบไพรเมอร์ในยีน Perforin และ MHC class I alpha แล้วนำมาทำปฏิกิริยาพีซีอาร์ (Polymerase chain reaction: PCR) กับดีเอ็นเอปลานิลกลุ่มที่ตายและกลุ่มที่รอดตายจากการทดสอบความต้านทานเชื้อแบคทีเรีย Streptococcus agalactiae ซึ่งเป็นเชื้อก่อโรคสเตรปโตคอคโคซิสที่พบมากในประเทศไทย จากนั้นทำการวิเคราะห์ลำดับเบสเพื่อค้นหาเครื่องหมายสนิปที่สัมพันธ์กับความต้านทานโรคสเตรปฯ ผลการศึกษาพบ สนิปในยีน Perforin จำนวน 13 ตำแหน่ง โดยมี 2 ตำแหน่ง คือ 1911C/G และ 2134A/G ที่มีจีโนไทป์แสดงนัยสำคัญในความสัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรคสเตรปฯ (P<0.05) โดยสนิปตำแหน่ง 1911C/G แสดงนัยสำคัญในความสัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรคสเตรปฯ ทั้งในโมเดล (model) แบบข่มร่วม (codominant) และแบบด้อย (recessive) แต่ยังไม่สามารถสรุปได้แน่ชัดว่าโมเดลใดเป็นโมเดลที่มีความเหมาะสมมากที่สุด สำหรับสนิปตำแหน่ง 2134A/G พบว่า โมเดลแบบด้อยมีความสัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรคสเตรปฯ โดยการเข้าคู่กันของอัลลีลด้อย G กับ G บน โฮโมโลกัสโครโมโซมเป็นจีโนไทป์ GG มีแนวโน้มว่าจะส่งผลต่อความต้านทานต่อโรค (รอด) มากกว่าจีโนไทป์รูปแบบอื่น ในส่วนของยีน MHC class I alpha พบสนิป จำนวน 2 ตำแหน่ง ได้แก่ 1698A/G และ 2001C/T อย่างไรก็ตามไม่พบตำแหน่งใดที่แสดงนัยสำคัญในความสัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรคสเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล (P>0.05
บทคัดย่อ (EN): The aim of this study was to detect Single Nucleotide Polymorphism (SNP) in Perforin and MHC class I alpha immune genes related to Streptococcosis resistance in Nile tilapia (Oreochromis niloticus). The primers designed for Perforin and MHC class I alpha genes were used to amplify with DNA from dead fish and survival fish from Streptococcus agalactiae resistant test in Nile tilapia. The sequence analysis was performed to find the SNP associated with the resistance. Thirteen SNPs in the Perforin gene were detected and two of them, 1911C/G and 2134A/G, were significantly associated (P<0.05) with the Streptococcosis resistance. The 1911C/G was found of codominant and recessive models that were significantly associated with the Streptococcosis resistance but still cannot conclude which model is the most suitable model. The 2134A/G was found of recessive model being significantly associated with the Streptococcosis resistance by pairing recessive alleles of G and G on homologous chromosomes as GG genotype, which is likely to affect the disease resistance (survival) rather than other genotypes. For the MHC class I alpha gene, two SNPs of 1698A/G and 2001C/T were found but none of them were significantly associated (P>0.05) with the Streptococcosis resistance in tilapia
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เลขที่อ้างอิง: -
เผยแพร่โดย: กรมประมง
คำสำคัญ: วิเคราะห์ลำดับเบส
คำสำคัญ (EN): Seq
หมวดหมู่ AGRIS:
  1. A เกษตรทั่วไป (Agriculture)::A50 การวิจัยทางการเกษตร (Agricultural research)
  2. 3
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุวรักษ์ วงษ์โท. "การค้นหาเครื่องหมายสนิปในยีน Perforin และ MHC class I alpha ที่สัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรค สเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล". กรมประมง. 2561

สุวรักษ์ วงษ์โท. "การค้นหาเครื่องหมายสนิปในยีน Perforin และ MHC class I alpha ที่สัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรค สเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล". กรมประมง. 2561. Print.



TARR Wordcloud:
การค้นหาเครื่องหมายสนิปในยีน Perforin และ MHC class I alpha ที่สัมพันธ์กับลักษณะต้านทานโรค สเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล
สุวรักษ์ วงษ์โท
กรมประมง
2561
กรมประมง
การค้นหาเครื่องหมายสนิปที่มีความสัมพันธ์กับลักษณะทนเค็มในปลานิล การศึกษาโครงสร้างอณูวิทยาของ Complementary DNAs (cDNAs) และการแสดงออกของยีน Caspase-3 และ Granzyme ในปลานิล การพัฒนาพันธุ์ปลานิลทนโรคสเตรปโตคอคโคซิส โดยใช้เทคโนโลยีการปรับปรุงพันธุ์ด้วยเครื่องหมายโมเลกุล[ระยะที่ 1] การใช้เทคโนโลยี bio-flocs ในการเลี้ยงกุ้งขาวและปลานิลแบบผสมผสาน การศึกษายีนที่สร้างสารเอ็นเทอโรท็อกซินในเชื้อ S. aureus ที่แยกได้จากโคที่เป็นโรคเต้านมอักเสบในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย การใช้พืชสมุนไพรเพื่อการควบคุมโรคสเตรปโตคอคโคซิสในปลานิล การกระตุ้นภูมิคุ้มกันต่อโรคสเตรปโตคอคโคซิสในปลานิลวัยอ่อน การระบาดของโรคสเตปโตคอคโคซิสในปลานิล การศึกษายีนควบคุมความรุนแรงของแบคทีเรียก่อโรคชนิด Streptococcus agalactiae ที่แยกจากฟาร์มเลี้ยงปลานิล การวิเคราะห์การทำงานของยีนที่ใช้ในการสังเคราะห์สารเคอร์คูมินอยด์ในขมิ้นชันโดย RNA interference
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair