สืบค้นงานวิจัย
Genotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristics
เจเรอมี่ เชียร์แมน - สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ชื่อเรื่อง: Genotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristics
ชื่อเรื่อง (EN): Genotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristics
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: เจเรอมี่ เชียร์แมน
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
บทคัดย่อ: เนื่องจากปัญหาการเพิ่มขึ้นของประชากรอย่างต่อเนื่องในปัจจุบัน ทำให้กลุ่มพืชไร่ที่มีความสามารถในการทนแล้งได้ทวีความสำคัญมากขึ้น แต่อย่างไรก็ตามพื้นที่ที่ใช้ในการเพาะปลูกกลับมีจำนวนจำกัด จึงทำให้มีความจำเป็นอย่างยิ่งที่จะต้องมีการปรับปรุงพันธุ์พืชไร่เหล่านี้ ทั้งในแง่การเพิ่มผลผลิตและเพิ่มความสามารถในการทนต่อสภาพแวดล้อมต่างๆ เพื่อรองรับกับความต้องการอาหารของประชากรในอีก 40 ปีข้างหน้า ในปัจจุบันพืชทนแล้งนิยมนำไปปลูกในพื้นที่ที่มีสภาวะแวดล้อมไม่เหมาะสม เช่น พื้นที่ที่ประสบปัญหาภัยแล้งหรือฝนตกไม่ตรงตามฤดูกาล ซึ่งวิธีการหนึ่งที่สามารถใช้คัดเลือกพืชสายพันธุ์ทนแล้ง คือการคัดเลือกจากลักษณะรากที่มีความสามารถในการเข้าถึงน้ำใต้ดินได้ดี ทำให้งานวิจัยนี้มีความต้องการที่จะพัฒนาและศึกษาลักษณะการแสดงออกของประชากรรูปแบบ Chromosome Segment Substitution Lines (CSSL) จากการผสมพันธุ์ระหว่างข้าวที่ปลูกบนที่สูงสายพันธุ์ CT9993 และข้าวที่ปลูกในพื้นที่ลุ่มสายพันธุ์ IR66266 จากนั้นประชากรที่มีลักษณะจีโนไทป์เป็น double haploid จะถูกนำไปผสมกลับกับสายพันธุ์ข้าวขาวหอมมะลิ KDML 105 จากนั้นผลลัพท์ที่ได้สามารถนำมาใช้ประโยชน์ในการศึกษาลักษณะทางปริมาณ (quantitative trait loci; QTL) ซึ่งการใช้ข้อมูลประชากรแบบ CSSL ในการศึกษาจะทำให้สามารถระบุตำแหน่งของ QTL บนจีโนมได้ง่ายกว่าการใช้ประชากรรูปแบบอื่น แต่เนื่องจากวิธีการนี้ต้องการเครื่องหมายโมเลกุลในปริมาณมากบนแผนที่เครื่องหมายโมเลกุลและยังต้องการข้อมูลลำดับเบสของสายพันธุ์พ่อและแม่ ในการระบุว่าลักษณะการแสดงออกใดมาจากสายพันธุ์พ่อหรือแม่ โดยเทคนิค Genotype-By-Sequencing (GBS) จะถูกนำมาใช้ในการค้นหาและระบุจีโนไทป์ของประชากรสายพันธุ์ CSSL ทั้งหมด 139 สายพันธุ์ เพื่อนำไปสร้างแผนที่เครื่องหมายโมเลกุล โดยที่ประชากรสายพันธุ์ CSSL จะถูกนำไปสังเกตลักษณะปรากฎเช่น ความยาวราก ลักษณะการแตกของราก รวมถึงลักษณะทางกายภาพของรากทั้งหมด เนื่องลักษณะปรากฎเหล่านี้ส่งผลถึงปริมาณทรัพยากรที่ต้องใช้ในการผลิต จากนั้นลักษณะทางปริมาณ (QTL) จะถูกศึกษาด้วยข้อมูลจากการทำ GBS และข้อมูลลักษณะการปรากฎ นอกจากนี้ลำดับเบสในสายพันธุ์พ่อและแม่จะถูกนำไปเปรียบเทียบกับลำดับเบสในประชากรสายพันธุ์ CSSL 139 สายพันธุ์ และนำไปใช้ในการค้นหายีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะการปรากฎที่กล่าวมา และเมื่อพบ QTL ในประชากรสายพันธุ์นี้จะสามารถทำให้นำไปใช้ประโยชน์ได้ในการค้นหายีนที่สำคัญ</p>
บทคัดย่อ (EN): Drought tolerance in crop species is of increasing importance in a growing global population with a limited amount of land available for growing food crops. Crop yield and tolerance to less ideal environments will need to increase to match the growing demand for food that we will see within the next 40 years. Tolerance to drought will be needed to allow farming in less ideal climates and to lessen the affects of climate change which are likely to include less consistent rainfall patterns, one way to increase drought tolerance is to select for a root structure that is better able to access ground water. A project to develop and phenotype a set of Chromosome Segment Substitution Lines (CSSL) for a cross between upland japonica, CT9993, and lowland indica, IR66266, in a KDML 105 background has generated a significant amount of information that can be used to identify QTL for a variety of phenotypes. The benefit of CSSL is that QTL can be localised to narrow regions of the genome more easily and with more confidence than other types of crosses. To utilise the results from all of this effort requires a dense marker map of these lines and sequence information of the parents to enable rapid identification of the underlying genetic causes for each QTL. This project will use a Genotype-By-Sequencing (GBS) approach to simultaneously identify and genotype all of the 139 CSSL for informative markers to generate a saturated marker map. The CSSL will be phenotyped for root hair length, root branching and anatomical characteristics since these are traits that affect resource acquisition. A QTL analysis will be performed using the GBS and phenotype data generated from the project. In addition to this, the parental lines will be sequenced allowing for sequence information of all 139 CSSL to be inferred which will facilitate gene discovery of the identified QTL. One significant benefit of this project is that any QTL project centred around these lines, including those already completed, can utilise this information for causative gene discovery.</p>
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
คำสำคัญ: ข้าว; แผนที่ศึกษาลักษณะทางปริมาณ; ลักษณะของราก; การค้นหาลำดับเบสบนจีโนม
คำสำคัญ (EN): Rice; QTL mapping; Root traits; genome sequencing
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

เจเรอมี่ เชียร์แมน. "Genotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristicsGenotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristics". สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. 2561

เจเรอมี่ เชียร์แมน. "Genotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristicsGenotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristics". สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. 2561. Print.



TARR Wordcloud:
Genotyping rice chromosome segment selected lines to facilitate gene discovery for root characteristics
เจเรอมี่ เชียร์แมน
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
2561
Root system architecture influencing cadmium accumulation in rice (Oryza sativa L.) MOLECULAR CHARACTERIZATION OF SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE (SERK) GENE FROM HEVEA BRASILIENSIS (MUELL. ARG.) Phenotypic variation of cassava root traits and their responses to drought Chemical properties and sensory characteristics of tomyum puffed rice Effects of root hair length on potassium acquisition in rice (Oryza sativa L.) Development of functional marker for GS3 gene controlling grain size in rice ROOT ANATOMY OF MODIFIED ROOT TRAINER PLANTS OF HEVEA BRASILIENSIS Phenotypic Evaluation of Root Angle in F2 Segregation by Crossing between Upland and Lowland Rice (Oryza Sativa) Cassava root membrane proteome reveals activities during storage root maturation Characterization of shoot and root traits of KDML105 CSSLs rice population at reproductive stage
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair