สืบค้นงานวิจัย
การตรวจหาและวิเคราะห์ระบบเอนไซม์ restriction-modification ในจีโนมของ Spirulina platensis C1
สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์ - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
ชื่อเรื่อง: การตรวจหาและวิเคราะห์ระบบเอนไซม์ restriction-modification ในจีโนมของ Spirulina platensis C1
ชื่อเรื่อง (EN): Genome-wide Analysis of Restriction-modification System in Spirulina platensis C1
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Sudarat Dulsawat
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
บทคัดย่อ: ระบบเอนไซม์ restriction-modification เป็นปัญหาสำคัญที่ส่งผลต่อประสิทธิภาพการส่งถ่ายดี เอ็นเอใน Spiruina เพื่อปรับปรุงระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอของ Spirlina ให้มีประสิทธิภาพเพิ่มขึ้น ใน การทดลองได้ทำการตรวจหายีนสร้งระบบเอนไซม์ restriction-modification ทั้งหมดในจีโนม Spirulina C1 ด้วยการทำนายจากระบบคอมพิวเตอร์ (computational annotation) และการทำ similarity search กับยืนในฐานข้อมูลชีววิทยาต่าง ๆ พบว่า Spiruina C! มีขีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้างเอนไซมั restriction-modification กรบทุกชนิด คือ I I! I! และ IV โดขนสร้างเอนไซมัชนิดที่ I มีจำนวน 6 cluster ยืนสร้างเอนไซมัชนิดที่ แ มีจำนวน 9 คู่ ซึ่งประกอบด้วยยืนสร้างเอนไซม์ methylase และ restriction SnaBI Nhel NspHI Pvull HindIl! NspV HindVP NiaIV และ Aval และเอนไซม์ solitary methylase enzyme ซึ่งเป็นยีนที่ไม่มีขืนสร้าง restriction cnzyme ที่เป็นคู่กันจำนวน 15 ยืน เอนไซม์ชนิด ที่ แ และ IV จำนวน 3 และ 2ยืน ตามลำดับ จากการตรวจสอบโครงสร้างของยืนสร้างเอนไซม์ restriction-modification ด้วยโปรแกรม atemis พบว่า มีขีนที่มีตำแหน่ง star/stop codon ไม่ถูกต้อง และมียีนที่เกิด frameshif ซึ่งมีผลทำให้ยืนเดียวกัน แยกออกจากกันเป็นหลายยืน เมื่อทำการเปรียบเทียบ ข้อมูลยีนสร้างเอนไซม์ restriction-modification ในจีโนม Spirulina C1 กับจีโนมของไซยาโนแบคทีเรีย สายพันธุ์อื่น ๆ พบว่า Spiruina C1 และไซยาโนแบคที่เรียที่เป็นเส้นสายมียีนสร้างเอนไซม์ restriction- modification มากกว่าไซยาโนแบคที่เรียที่เป็นเซลเดียว โดยนสร้างเอนไซม์ของ Spirulina C1 มี homology สูง และมีการจัดเรียงตัวของยืนคล้ายคลึงกับยืนสร้างเอนไซม์ในกลุ่ม Spirulina คือ Arthrospira CS-328 และ Spiruina platensis (ประเทศจีน) มากที่สุด ซึ่งจากข้อมูลที่พบว่า Spirulina Cl มีเอนไซม์ restriction-modification อยู่มากมาย จะเป็นประโยชน์ต่อการนำไปใช้ในการปรับปรุงระบบ การส่งถ่ายดีเอ็นเอของ Spirulina ให้มีประสิทธิภาพเพิ่มขึ้น ด้วยการป้องกันดีเอ็นเอที่ต้องการส่งถ่าย ไม่ให้ถูกย่อยด้วยเอนไซม์ที่ตรวจพบใน Spirulina ซึ่งข้อมูลที่ได้สามารถนำมาเชื่อมโยงกับงานพัฒนา ระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอใน Spirulina เพื่อนำไปสู่การพัฒนาระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอที่มีประสิทธิภาพและมีความเสถียรได้ต่อไปในอนากต
บทคัดย่อ (EN): No information found from agency.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
คำสำคัญ: การส่งถ่ายดีเอ็นเอ
คำสำคัญ (EN): DNA transfer
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์. "การตรวจหาและวิเคราะห์ระบบเอนไซม์ restriction-modification ในจีโนมของ Spirulina platensis C1Genome-wide Analysis of Restriction-modification System in Spirulina platensis C1". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2552

สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์. "การตรวจหาและวิเคราะห์ระบบเอนไซม์ restriction-modification ในจีโนมของ Spirulina platensis C1Genome-wide Analysis of Restriction-modification System in Spirulina platensis C1". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2552. Print.



TARR Wordcloud:
การตรวจหาและวิเคราะห์ระบบเอนไซม์ restriction-modification ในจีโนมของ Spirulina platensis C1
สุดารัตน์ ดุลสวัสดิ์
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
30 กันยายน 2552
การค้นหาและศึกษาการทำงานของยีนสร้างเอนไซม์ restriction-modification ที่ยังไม่สามารถตรวจพบได้ในจีโนมของ Spirulina เพื่อใช้นำมาใช้ประโยชน์สำหรับงานวิจัยทางด้านอณูชีววิทยา (ระยะที่ 2) การพัฒนาการตรวจหา เชื้อสเตรปโตคอคคัส ซูอิส และยีนที่จำเพาะต่อ ซีโรไทป์โดยใช้เทคนิค multiplex PCR การพัฒนายีนคัดเลือกเพื่อใช้ในการปรับปรุงระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอในสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินสไปรูลินาให้มีความเสถียร การโคลนยีนไฟเตสทนร้อนจากแอคติโนไมซีท Thermomonospora sp. RC7 เพื่อพัฒนาการผลิตเอนไซม์ไฟเตสทดแทนการนำเข้าจากต่างประเทศ การวิเคราะห์จีโนมและความหลากหลายทางพันธุกรรมของแก่นตะวัน (Helianthus tuberosus L.) โดยใช้ ISSR markers สภาวะกดดันจากเกลือความเข้มข้นสูงต่อการสังเคราะห์ลิปิดใน Spirulina platensis สายพันธุ์ C1 การใช้เทคนิคการวิเคราะห์อัตราการไหลผ่านของคาร์บอนในแต่ละปฏิกิริยาชีวเคมีเพื่อทำนายการเพิ่มผลผลิตของชีวมวลและ GLA ใน Spirulina platensis C1 ระบบ ISO คืออะไร? การประยุกต์ใช้ระบบ Vessel Monitoring System (VMS) เพื่อวิเคราะห์สภาวะทรัพยากรและกิจกรรมทำประมงปลาผิวน้ำทางฝั่งทะเลอันดามันของประเทศไทย การใช้ระบบ Fisheries Map เพื่อการบริหารจัดการข้อมูลเชิงพื้นที่จับสัตว์น้ำ
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair