สืบค้นงานวิจัย
ความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่ในโคพื้นเมืองไทยด้วยการวิเคราะห์ไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอ
ณชัย ศราธพันธุ์ - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง: ความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่ในโคพื้นเมืองไทยด้วยการวิเคราะห์ไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอ
ชื่อเรื่อง (EN): Genetic diversity of maternal lineages in Thai-native cattle by mitochondrial DNA analysis
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ณชัย ศราธพันธุ์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Nachai Sarataphan
บทคัดย่อ: ไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอเป็นสารพันธุกรรมที่ได้รับการถ่ายทอดมาจากแม่เท่านั้น จึงนำมาใช้ศึกษาวิวัฒนาการ และความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่ของคนและสัตว์ ในการศึกษานี้เพื่อหาความหลากหลายทางพันธุกรรมสาย แม่และวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมในโคขาวลำพูน 30 ตัว โคลาน 35 ตัว โคชนใต้ 15 ตัว โคอีสาน 18 ตัวและ โคลูกผสมแองกัสxพื้นเมืองไทย 7 ตัว รวมทั้งสิ้น 105 ตัว ด้วยการวิเคราะห์ลำดับเบสของไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอบริเวณ D-loop ที่มีความผันแปรสูงจำนวน 297 คู่เบส เปรียบเทียบกับลำดับเบสของโคสายพันธุ์ต่างๆ พบว่ามีตำแหน่งคู่เบสที่ แตกต่างกันจำนวน 50 ตำแหน่ง สามารถจำแนกได้ 21 Haplotype ซึ่ง Haplotype10 พบมากที่สุด โคขาวลำพูน โคลาน โคชนใต้ โคอีสานและโคลูกผสมแองกัสxพื้นเมืองไทย มี 8, 11, 6, 4 และ 4 Haplotype ตามลำดับ ความหลากหลายของ Haplotype เท่ากับ 1.5599 ความหลากหลายทางพันธุกรรมรวมและภายในแต่ละสายพันธุ์โดยมีค่า Nucleotide diversity เท่ากับ 0.3997 และ 0.4351 ตามลำดับ ส่วนค่าสัมประสิทธิ์ของความแตกต่างพันธุกรรมมีค่าเท่ากับ -0.0885 แสดงว่าโคพื้นเมืองไทยมีความหลากหลายของ Haplotype ความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่สูงมาก และมีพันธุกรรมสายแม่ ไม่แตกต่างกัน ผลการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมพบว่าโคพื้นเมืองไทยส่วนใหญ่มีพันธุกรรมสายแม่จัดอยู่ในกลุ่ม Bos indicus จากการศึกษาทางวิวัฒนาการพบว่า โคลานที่อยู่ใน Haplotype22 เป็นต้นกำเนิดส่วนใหญ่ของโคพื้นเมืองไทย รวมทั้งโค Red Chittagong, Tharparkar, Hariana และ Sahiwal ในประเทศบังคลาเทศ ปากีสถาน และอินเดีย ตามลำดับ
บทคัดย่อ (EN): Mitochondrial DNA which inherited only from maternal lineages had been used in evolution and genetic diversity study in human and animals. The objective of this study was to verify genetic diversity and phylogenetic tree based on mitochondrial DNA (mtDNA) of Thai-native cattle and Thai-native crossbred cattle. A total of 105 animals including 30 Khao Lamphun (KLP) cattle, 35 racing cattle (LAN), 15 Southern fighting cattle (CHON), 18 Northeastern cattle (E-SAN) and 7 Angus x Thai-native crossbred (AgxTNT) cattle were used in this study. D-loop mtDNA of high variable region (297 bp) was aligned with different cattle breeds. The result revealed that 50 single nucleotide polymorphisms (SNPs) was found and classified into 21 haplotypes. Haplotype10 was found in high frequency. The numbers of haplotype in KLP, LAN, CHON, E-SAN and AgxTNT were 8, 11, 6, 4 and 4 haplotypes respectively. Haplotype diversity of cattle in this study was 1.5599. Nucleotide diversity of entire population and within population were 0.3997 and 0.4351 respectively. Coefficient of differentiation among animals in this study was -0.0885. The result indicated that haplotype and nucleotide diversity were very high in Thai-native cattle and Angus x Thai-native crossbred cattle, whereas maternal lineages was closely related among them. Phylogenetic tree revealed most of Thai-native cattle located in Bos indicus clade. Evolution study based on D-loop mtDNA revealed that the Haplotype22 of LAN cattle was origin of the most Thai-native cattle as well as Red Chittagong, Tharparkar, Hariana and Sahiwal cattle in Bungaladesh, Pakistan and India, respectively.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
จำนวนหน้า: 12
เอกสารแนบ: https://ag2.kku.ac.th/kaj/PDF.cfm?filename=04 Nachai.pdf&id=2956&keeptrack=1
คำสำคัญ: สายแม่
คำสำคัญ (EN): maternal lineages
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ณชัย ศราธพันธุ์. "ความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่ในโคพื้นเมืองไทยด้วยการวิเคราะห์ไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอGenetic diversity of maternal lineages in Thai-native cattle by mitochondrial DNA analysis". ไม่ระบุหน่วยงาน. 2560

ณชัย ศราธพันธุ์. "ความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่ในโคพื้นเมืองไทยด้วยการวิเคราะห์ไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอGenetic diversity of maternal lineages in Thai-native cattle by mitochondrial DNA analysis". ไม่ระบุหน่วยงาน. 2560. Print.



TARR Wordcloud:
ความหลากหลายทางพันธุกรรมสายแม่ในโคพื้นเมืองไทยด้วยการวิเคราะห์ไมโทคอนเดรียลดีเอ็นเอ
ณชัย ศราธพันธุ์
ไม่ระบุผู้เผยแพร่
2560
ความหลากหลายทางพันธุกรรมและจำแนกกลุ่มพันธุกรรมไก่พื้นเมืองในจังหวัดน่านด้วยไมโครแซทเทิลไลท์ การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไก่พื้นเมืองในพื้นที่ภาคเหนือ ประโยชน์จากความหลากหลายทางพันธุกรรมของไผ่สายพันธุ์ที่พบ ณ ศูนย์การศึกษามหาวิทยาลัยเชียงใหม่ หริภุญชัย จังหวัดลำพูน การวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยในจังหวัดนครสวรรค์ การใช้ประโยชน์จากความหลากหลายทางพันธุกรรมของต้นหนอนตายหยาก รถนะการผลิตของโคพื้นเมืองไทยที่ได้รับหญ้ารูซี่แห้งหรือฟางข้าวเป็นแหล่งของอาหารหยาบหลัก ผลของระดับการกินได้พลังงานต่อการผลิตแก๊สมีเทนในโคเนื้อพื้นเมืองไทย และโคพันธุ์บราห์มันลูกผสม ผลของฮอร์โมนเพรกแนนท์แมร์ซีรั่มโกนาโดโทรปินต่อการกระตุ้น เพิ่มจำ นวนฟอลลิเคิลในรังไข่โคพื้นเมืองไทย (Bos indicus) การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมมะม่วงโดยเทคนิคเครื่องหมายโมเลกุลเอส เอส อาร์ การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของพืชสกุลฮ้อม (Strobilanthes sp.) ด้วยเทคนิคเซลล์พันธุศาสตร์และชีววิทยาระดับโมเลกุล
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair