สืบค้นงานวิจัย
การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อนในประเทศไทย
Parichart Praipue - จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
ชื่อเรื่อง: การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อนในประเทศไทย
ชื่อเรื่อง (EN): Development of genetic markers of tropical abalone in Thailand
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Parichart Praipue
บทคัดย่อ: ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อในประเทศไทย 3 ชนิดคือ Haliotis asinina, H. ovina, และ H. varia โดยเทคนิค RAPD-PCR และ PCR-RFLP ของ 18S และ 16S rDNAs พบชิ้น RAPD ที่จำเพาะต่อชนิดหอยเป๋าฮื้อจากการใช้ไพรเมอร์ INS, YN73 และ M13 การวิเคราะห์โดยการตัดของ 18S rDNA (nuclear marker) ด้วย Alu I, Taq I และ Hae III และ 16S rDNA (mitochondrial marker) ด้วย BamH I, EcoR I, Hae III และ Alu I ให้ 12 และ 13 แบบการตัด สำหรับ 18S rDNA และ 16S rDNA ตามลำดับ พบ composite haplotype ทั้งหมดจำนวน 49 haplotypes โดยค่าระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่างคู่ composite haplotypes ภายในสปีชีส์ต่ำกว่าระหว่างสปีชีส์ จากการสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ในเชิงวิวัฒนาการโดยใช้วิธี UPGMA ที่สร้างจากค่า divegence ระหว่าง composite haplotypes ระหว่างกลุ่มตัวอย่างและระหว่างชนิด แสดงให้เห็นความแตกต่างของ gene pools ของหอยเป๋าฮื้อแต่ละชนิด โดย H. asinina มีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ใกล้เคียงกับ H. ovina มากกว่า H. varia การวิเคราะห์ geographic heterogeneity และการประมาณค่า Fst ชี้ให้เห็นถึงโครงสร้างประชากรในหอยเป๋าฮื้อแต่ละชนิด และพบโครงสร้างประชากร (population structure) ที่ชัดเจนระหว่าง H. ovina ที่มาจากทะเลอันดามันและอ่าวไทย (P<0.0001) ในขณะที่พบความแตกต่างระหว่าง H.asinina จาก Philippines กับกลุ่มตัวอย่างที่เหลือทั้งหมด (p<0.0021) โคลนชิ้น 16S rDNA จากตัวแทนหอยเป๋าฮื้อที่มี composite haplotype ทั้ง 10 haplotypes นำมาหาลำดับเบส แผนภูมิความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการที่สร้างจาก divergence ของลำดับเบสของ 16S rDNA แสดงความสัมพันธ์ที่ใกล้เคียงกันภายในแต่ละชนิดของหอยเป๋าฮื้อ นอกจากนั้นการหาลำดับนิวคลีโอไทด์ยังแสดงถึงความเป็นไปได้ที่จะพัฒนา PCR ที่จำเพาะต่อชนิดของหอยเป๋าฮื้ออีกด้วย
บทคัดย่อ (EN): Haliotis asinina, H. ovina, and H. varia were analyzed by RAPD-PCR and PCR-RFLP of 18S and 16S rDNAs. Several species-specific RAPD fragment was found using primers INS, YN73, and M13. Restriction analysis of 18S rDNA (nuclear marker) with Alu I, Tag I and Hae III and 16S rDNA (mitochondrial marker) with BamH I, EcoR I, Hae III and Alu I gave 12 and 13 digestion patterns for 18S rDNA and 16S rDNA, respectively. A total of 49 composite haplotype were observed. Genetic distances between pairs of composite haplotypes within species were lower than those between species. A UPGMA dendogram constructed from divergence between composite haplotypes, samples and species revealed separate gene pools of these abalones. The H. asinina alone showed closer genetic relationships with H. ovina than H. varia. Geographic heterogeneity analysis and Fst estimate indicated the existence of population structure of each abalone. Disregarding H. varia due to small sample sizes, strong genetic differentiation was observed in H. ovina whereas partial differentiation was observed between the Philippines and the remaining sample (P<0.0021). The 16S rDNA of individual representing 10 composite haplotypes of three abalone species were cloned. Comparing and sequenced. The aligned sequences indicated the possibility to develop species-specific PCR from these sequences. A neighbor-joining tree constructed from sequence divergence of these sequences allocted relationships of sequences according to species origins of abalone
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://thailis-db.car.chula.ac.th/CU_DC/August2004/thesis/Parichart.pdf
เผยแพร่โดย: จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
คำสำคัญ (EN): Abalones
เจ้าของลิขสิทธิ์: จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
รายละเอียด: ในการวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อในประเทศไทย 3 ชนิดคือ Haliotis asinina, H. ovina, และ H. varia โดยเทคนิค RAPD-PCR และ PCR-RFLP ของ 18S และ 16S rDNAs พบชิ้น RAPD ที่จำเพาะต่อชนิดหอยเป๋าฮื้อจากการใช้ไพรเมอร์ INS, YN73 และ M13 การวิเคราะห์โดยการตัดของ 18S rDNA (nuclear marker) ด้วย Alu I, Taq I และ Hae III และ 16S rDNA (mitochondrial marker) ด้วย BamH I, EcoR I, Hae III และ Alu I ให้ 12 และ 13 แบบการตัด สำหรับ 18S rDNA และ 16S rDNA ตามลำดับ พบ composite haplotype ทั้งหมดจำนวน 49 haplotypes โดยค่าระยะห่างทางพันธุกรรมระหว่างคู่ composite haplotypes ภายในสปีชีส์ต่ำกว่าระหว่างสปีชีส์ จากการสร้างแผนภูมิความสัมพันธ์ในเชิงวิวัฒนาการโดยใช้วิธี UPGMA ที่สร้างจากค่า divegence ระหว่าง composite haplotypes ระหว่างกลุ่มตัวอย่างและระหว่างชนิด แสดงให้เห็นความแตกต่างของ gene pools ของหอยเป๋าฮื้อแต่ละชนิด โดย H. asinina มีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม ใกล้เคียงกับ H. ovina มากกว่า H. varia การวิเคราะห์ geographic heterogeneity และการประมาณค่า Fst ชี้ให้เห็นถึงโครงสร้างประชากรในหอยเป๋าฮื้อแต่ละชนิด และพบโครงสร้างประชากร (population structure) ที่ชัดเจนระหว่าง H. ovina ที่มาจากทะเลอันดามันและอ่าวไทย (P
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Parichart Praipue. "การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อนในประเทศไทยDevelopment of genetic markers of tropical abalone in Thailand". จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. 2544

Parichart Praipue. "การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อนในประเทศไทยDevelopment of genetic markers of tropical abalone in Thailand". จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย. 2544. Print.



TARR Wordcloud:
การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อนในประเทศไทย
Parichart Praipue
จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
2544
การสืบค้นเครื่องหมายโมเลกุลที่เกี่ยวข้องกับการเติบโตของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อน Haliotis asinina ในประเทศไทย สำหรับประเทศไทย การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ ลักษณะทางพันธุกรรมของเชื้อ Toxoplasma gondii จากไก่เลี้ยงปล่อยในประเทศไทย การ ศึกษาผลการนำเข้าและส่งออกสินค้าเกษตรก่อนและหลังการทำข้อตกลงเขตการค้าเสรี ระหว่างประเทศไทยกับประเทศจีน : กรณีศึกษา ด่านศุลกากรเชียงแสน การศึกษาแบบตัดขวางของคุณภาพทางจุลินทรีย์ของไส้อั่ว ในเขตจ้งหวัดเชียงใหม่ ประเทศไทย อิทธิพลของสิ่งแวดล้อมต่อการพัฒนาสายพันธุ์ถั่วเหลืองโปรตีนสูงในประเทศไทย การอนุรักษ์และการจัดการช้างในประเทศไทย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair