คลังข้อมูลการวิจัยการเกษตรไทย

ผู้แต่ง ศิริกานดา วิมล

เผยแพร่โดย

สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science

เผยแพร่เมื่อ 2563

หน่วยงาน สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science

งานวิจัยที่แนะนำ จำแนก และคัดเลือกโปรโมเตอร์จากพืชโดยเฉพาะตระกูล Poaceae เพื่อใช้ในการเพิ่มประสิทธิภาพการแสดงออกของยีนเป้าหมายในระบบท่อลำเลียงของอ้อย การเพาะเลี้ยงกบจาน การจำแนกเชื้อเลปโตสไปรา ด้วยเทคนิคทางอณูชีววิทยา วิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงปลานวลจันทร์น้ำจืด ชุดโครงการวิจัยและพัฒนาการเพาะเลี้ยงกุ้งทะเล การเพาะเลี้ยงปูม้าในบ่อดินแบบครบวงจร การพัฒนาเทคนิค Multiplex PCR เพื่อตรวจสอบอุบัติการณ์การติดเชื้อและการจำแนกพยาธิใบไม้ Opisthorchis viverrini และ Haplorchis taichui ในปลาเกล็ดขาว และในคน โครงการฝึกอบรมและถ่ายทอดเทคโนโลยีการเพาะเลี้ยงปลากะพงขาว การใช้เทคนิค PCR ตรวจสอบลักษณะพันธุกรรม Malignant Hyperthermia ในสุกรพันธุ์เปียแตรง การพัฒนาวิธีการจำแนกเชื้อเลปโตสไปรา ด้วยเทคนิคทางอณูชีววิทยา

คัดลอก URL

ชื่อเรื่อง:	ผลของสภาวะการเพาะเลี้ยงต่อการจำแนกเชื้อบาซิลลัสแอนทราซิสด้วยเทคนิค MALDI-TOF MS Effects of culture conditions for Bacillus anthracis identification based on MALDI-TOF MS
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ:	ศิริกานดา วิมล
บทคัดย่อ:	Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) เป็นเทคนิคจำแนกเชื้อแบคทีเรียด้วยการวิเคราะห์โปรตีนแมสสเปกตรัม ซึ่งมีประสิทธิภาพ น่าเชื่อถือ และสามารถได้ผลการวิเคราะห์ภายใน 1 ชั่วโมง การบ่มเพาะเชื้อบาซิลลัสในสภาวะที่แตกต่างกันทำให้มีการสร้างเอนโดสปอร์ในปริมาณที่แตกต่างกัน ซึ่งส่งผลเชื่อมโยงถึงรูปแบบโปรตีนแมสสเปกตรัม การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินผลของอาหารเลี้ยงเชื้อที่แตกต่างกันต่อรูปแบบแมสสเปกตรัม และเพื่อทดสอบวิธีการเตรียมตัวอย่างที่เหมาะสมในการทำให้เชื้ออ่อนฤทธิ์และเพิ่มความสามารถในการทดสอบด้วย MALDI-TOF ผลการวิเคราะห์เชื้อบาซิลลัสแอนทราซิส จำนวน 6 สายพันธุ์ สามารถจำแนกได้ชัดเจนโดยขนาดของโปรตีนสเปคตรัมอยู่ในขอบเขต 1,000 –20,000 ดาลตัน การทดสอบเชื้อบาซิลลัสแอนทราซิสที่เลี้ยงบน nutrient agar แสดงผลแมสสเปคตรัมที่สอดคล้องกับฐานข้อมูล SARAMIS มากกว่าเชื้อที่เลี้ยงบน blood agar นอกจากนี้ยังพบว่าการเตรียมตัวอย่างโดยวิธีสกัดด้วยกรดฟอร์มิก 70% ช่วยให้ได้ตัวอย่างเชื้อแบคทีเรียที่มีความละเอียดเป็นเนื้อเดียวกัน ช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการจำแนก สรุปได้ว่า การควบคุมสภาวะการเพาะเชื้อ และวิธีการเตรียมตัวอย่างทดสอบ MALDI มีความสำคัญต่อการจำแนกเชื้อบาซิลลัสแอนทราซิสด้วย MALDI-TOF MS วิธีนี้สามารถทำได้ง่าย รวดเร็ว ความแม่นยำสูง ช่วยให้การจำแนกเชื้อแบคทีเรียเป็นไปอย่างรวดเร็ว Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) has been used to identify bacteria based on protein mass spectra. The technique is highly efficient and reliable and results are obtained within an hour. Incubating Bacillus spp. under different conditions influences the protein percentages due to different extents of endospore-formation that affect mass spectra. In this study, we evaluated the effects on the mass spectrum of different culture conditions and an optimized sample preparation method was developed to inactivate and enhance the MALDI-TOF performance. The results showed that 6 different strains of Bacillus anthracis could be discriminated clearly by their peak profiles in a mass range of 1,000 to 20,000 Da. The two common media; nutrient agar and blood agar, it demonstrated that nutrient agar can resulted in clearly mass spectra profiles. In addition, we found that the solvent extraction method enhanced the performance of the MALDI detection. In summary, control of culture conditions and sample preparations are vital for B. anthracis identification by MALDI-TOF MS. This protocol is simple and rapid; has excellent reproducibility; and helps in fast bacterial identification
บทคัดย่อ:	ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN):	th
เอกสารแนบ:	http://nih.dmsc.moph.go.th/research/showimgdetil.php?id=721
เผยแพร่โดย:	สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science
คำสำคัญ:	Mass spectra
เจ้าของลิขสิทธิ์:	สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุขกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์