สืบค้นงานวิจัย
การโคลนนิ่งยีนเคอราติเนสจาก Fervidobacterium spp.ชอบร้อนสูงที่แยกได้จากน้ำพุร้อนในประเทศไทย สำหรับกำจัดขยะขนสัตว์ปีกจากโรงฆ่าสัตว์
วิโรจน์ กนกศิลปธรรม - มหาวิทยาลัยศิลปากร
ชื่อเรื่อง: การโคลนนิ่งยีนเคอราติเนสจาก Fervidobacterium spp.ชอบร้อนสูงที่แยกได้จากน้ำพุร้อนในประเทศไทย สำหรับกำจัดขยะขนสัตว์ปีกจากโรงฆ่าสัตว์
ชื่อเรื่อง (EN): Cloning of a gene encoding keratinase from hyperthermophilic Fervidobacterium species isolated from hot springs in Thailand, for feather waste treatment from slaughterhouses
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: วิโรจน์ กนกศิลปธรรม
บทคัดย่อ: Fervidobacterium sp. FC2004 และ Fervidobacterium sp. FA004 เป็นแบคทีเรียชอบร้อนสูงใน order Thermotogalesที่สามารถย่อยขนสัตว์ปีกงนวิจัยนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อคันหายีนผลิตเอนไชม์ทนร้อน เคอราติเนส จากจีโนมของ Fervidobacterium sp. และเพื่อโคลนนิ่งยืน สำหรับการประยุกต์ใช้ประโยชน์ต่อไป ใน การศึกษานี้คันพบยืนผลิต serine protease (522 กรดอะมิโน) จากโครโมโชมของ Fervidobacterium sp. FC2004 ด้วยวิธี shortgun sequencing และตั้งชื่อยืนว่า "pr0A1" (เรียกโปรตีนว่า "Pr0A1 ") การวิเคราะห์ด้วย BlastP analysis แสดงว่โปตื่น ProA1 มีลำดับกรดอะมิโนคล้ายกับ large S8_subtilase superfamilies of serine proteases (ขนาด 682 - 710 กรตอะมิโน) จาก Fervidobacterium pennivorans DSM 9078 (WP 064012406.1; 52 %), F. islandicum Aw-1 (WP 052107197.1, 48 %6) และ F. nodosum Rt17-B1T (WP 011994230.1; 48 %) แต่มีขนาดเล็กกว่า โมเดล 3 มิติของ ProA1 คล้ายกับ fervidolysin (large S8_subtilase ชนิดหนึ่ง) โมเลกุล ProA 1 ประกอบต้วย signal peptide (ประมาณ 20 กรดอะมิโน) โดเมน PD(propeptide domain), CD (catalytic domain) และโดเมนที่คล้ายกับ SD หรือ SD-like (substrate binding domain) 1 ชุด แต่ไม่พบ SD2 (substrate binding domain ชุดที่ 2) บริเวณ CD ของ ProA1 มี catalytic tiad คือ D169, H207 และ S379 และมี calcium binding site ประกอบด้วย E136, D178, D220, K222 และ V224 ผลการศึกษาแสดงว่า ProA1 อาจถูกสังเคราะห์เป็น ProA1 precursor (proProA, ไม่มีกิจกรรมเอนไซม์) ซึ่ง PD ถูก ตัดออกก่อนเพื่อเปลี่ยนเป็น ProA1 เต็มวัย (มีกิจกรรมเอนไซม์ ในการศึกษานี้ชิ้น DNA ที่มีรหัสของ ProA1, CD และ sD-like ถูกจำลองต้วยไพร์เมอร์ ยืนยันการมีอยู่ของยืน proA1 ในโครโมโชมของ Fervidobacterium sp. FC2004 อุปสรรคในการโคลนนิ่งยีนนี้เข้าสู่ expression vector อาจเนื่องมาจาก ProA1 เต็มวัยเป็นพิษต่อเซลล์ และอาจมี ปัจจัยภายในที่ไม่ทราบสาเหตุต่าง ๆ จากตัวยีนและเจ้าบ้าน ถึงแม้ว่า Fervidobacterium sp. FC2004 สามารถย่อย ขนเป็ดไต้ และโตเมน SD-like ของ Pro1 คล้ายกับโตเมนที่ทำหน้าที่เกาะกับโปรตีนเป้าหมายของ collagen binding protein และ fibronectin binding protein อย่างไรก็ตามบทบาทหน้าที่ของ SD-ike ในการเกาะกับ สับสเตรทเคอ ราติน ยังไม่ใต้รับการพิสูจน์แน่ชัด
บทคัดย่อ (EN): Fervidobacterium sp. FC2004 and Fervidobacterium sp. FA004 are extreme thermophilic bacteria belonging to order Thermotogales which can degrade feathers. This research aims to search a gene encoding keratinase from genomic DNA of a Fervidobacterium sp., and to clone the gene for future applications. In this study, a putative gene encoding a serine protease (522 amino acids) named proA1 (named protein as ProA1) is identified in chromosome of Fervidobacterium sp. FC2004 using shortgun sequencing methods. BlastP analysis reveals that amino acid sequence of ProA1 is similar to large peptidase S8_subtilase superfamilies of serine proteases (size range of 682 – 710 amino acids) of Fervidobacterium pennivorans DSM 9078T (WP_064012406.1; 52 %), F. islandicum AW-1 (WP_052107197.1; 48 %) and F. nodosum Rt17-B1T (WP_011994230.1; 48 %). 3-D model of ProA1 is similar to fervidolysin (a large S8_subtilase). ProA1 molecule is composed of a signal peptide (approx. 20 amino acids), PD (propeptide domain), CD (catalytic domain) and a domain similar to SD or SD-like (substrate binding domain), but the second substrate binding domain (SD2) was not detected. The CD region of ProA1 contains a catalytic triad of D169, H207 and S379, and a calcium binding site that is composed of E136, D178, D220, K222 and V224. The results suggest that ProA1 might be produced as ProA1 precursor (proProA, inactive enzyme) that requires cleavage off PD to become mature ProA1 (active enzyme). In this study, DNA segments encoding ProA1, CD and SD-like are amplified using primers confirming the existing of proA1 gene sequence in the chromosome of Fervidobacterium sp. FC2004. Difficulty in cloning the gene into an expression vector might result from toxicity of the mature ProA1 and unknown intrinsic factors from the gene and host. Although, Fervidobacterium sp. FC2004 is able to degrade native feather and SD-like of ProA1 has similar 3D-structure to target specific binding domain of collagen binding protein and fibronectin binding protein, function of SD-like in binding to its keratin substrate is unclear.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยศิลปากร
คำสำคัญ: อิสแลนดิซิน
คำสำคัญ (EN): thermostable enzyme
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

วิโรจน์ กนกศิลปธรรม. "การโคลนนิ่งยีนเคอราติเนสจาก Fervidobacterium spp.ชอบร้อนสูงที่แยกได้จากน้ำพุร้อนในประเทศไทย สำหรับกำจัดขยะขนสัตว์ปีกจากโรงฆ่าสัตว์Cloning of a gene encoding keratinase from hyperthermophilic Fervidobacterium species isolated from hot springs in Thailand, for feather waste treatment from slaughterhouses". มหาวิทยาลัยศิลปากร. 2559

วิโรจน์ กนกศิลปธรรม. "การโคลนนิ่งยีนเคอราติเนสจาก Fervidobacterium spp.ชอบร้อนสูงที่แยกได้จากน้ำพุร้อนในประเทศไทย สำหรับกำจัดขยะขนสัตว์ปีกจากโรงฆ่าสัตว์Cloning of a gene encoding keratinase from hyperthermophilic Fervidobacterium species isolated from hot springs in Thailand, for feather waste treatment from slaughterhouses". มหาวิทยาลัยศิลปากร. 2559. Print.



TARR Wordcloud:
การโคลนนิ่งยีนเคอราติเนสจาก Fervidobacterium spp.ชอบร้อนสูงที่แยกได้จากน้ำพุร้อนในประเทศไทย สำหรับกำจัดขยะขนสัตว์ปีกจากโรงฆ่าสัตว์
วิโรจน์ กนกศิลปธรรม
มหาวิทยาลัยศิลปากร
30 กันยายน 2559
การโคลนและศึกษาลักษณะสมบัติยีนสร้างเอนไซม์อะไมเลสเลสทนร้อนจากน้ำพุร้อนควนแคง จังหวัดตรัง การสร้างแบคทีเรียบาซิลัสดัดแปลงพันธุกรรมเพื่อผลิตเอนไซม์เคราติเนสและการประยุกต์ใช้เอนไซม์เคราติเนสในการเพิ่มมูลค่าเศษขนไก่จากอุตสาหกรรมการแปรรูปสัตว์ปีก การศึกษายีนที่สร้างสารเอ็นเทอโรท็อกซินในเชื้อ S. aureus ที่แยกได้จากโคที่เป็นโรคเต้านมอักเสบในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย อนุกรมวิธานของฟิล์มมี่เฟิร์นสกุล Hymenophyllum s.l. (Hymenophyllaceae) ในประเทศไทย การวิเคราะห์การทำงานของยีนที่ใช้ในการสังเคราะห์สารเคอร์คูมินอยด์ในขมิ้นชันโดย RNA interference การโคลน การศึกษาลักษณะเฉพาะ และการแสดงออกของยีน XYL1 จากเมทิลโลโทรฟิกยีสต์ทนอุณหภูมิสูงที่แยกได้ในประเทศไทย การโคลนและศึกษาคุณลักษณะของ interferon-gamma จากกระบือปลักของไทย ความชุกและชนิดของพันธุกรรมเชื้อ Cryptosporidium spp. ที่สัมพันธ์กับความหลากหลายของสัตว์ฟันแทะในประเทศไทย แนวทางการดำเนินความร่วมมือทางด้านวิชาการประมงระหว่างประเทศไทยและสาธารณรัฐสังคมนิยมเวียดนามในอนาคต การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมัน
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair