สืบค้นงานวิจัย
การวิเคราะห์ลำดับเบสของ cpDNA trnL-trnF และ nrDNA ITS ในหม่อนพันธุ์อนุรักษ์
บุษรา จงรวยทรัพย์ - กรมหม่อนไหม
ชื่อเรื่อง: การวิเคราะห์ลำดับเบสของ cpDNA trnL-trnF และ nrDNA ITS ในหม่อนพันธุ์อนุรักษ์
ชื่อเรื่อง (EN): DNA Sequence Analysis of cpDNA trnL-trnF and nrDNA ITS in Conservation Mulberry (Morus spp.) Varieties
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: บุษรา จงรวยทรัพย์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Butsara Jongruaysup
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. สำนักอนุรักษ์และตรวจสอบมาตรฐานหม่อนไหม
ชุดเอกสาร: -
บทคัดย่อ: กรมหม่อนไหมได้ดำเนินการอนุรักษ์พันธุ์หม่อนไว้ในศูนย์อนุรักษ์พันธุกรรมหม่อนมากกว่า 200 พันธุ์ แต่ข้อมูล ในกำรจำแนกชนิด (species) ของพันธุ์หม่อนเหล่ำนั้นกลับไม่ชัดเจนเพียงพอต่อกำรปรับปรุงพัฒนำพันธุ์ในรุ่นต่อๆ ไป ซึ่งสิ่งสำคัญลำดับแรกที่จำเป็นต้องดำเนินกำร คือ การตรวจสอบยืนยันกำรจำแนกและระบุชื่อชนิดที่ชัดเจน เพื่อให้ รวบรวมเก็บรักษาพันธุกรรมหม่อนไว้ใช้ได้อย่างถูกต้อง งานวิจัยนี้ดำเนินการในปี 2559 ถึงปี 2561 โดยมีวัตถุประสงค์ เพื่อจำแนกและระบุชนิดของหม่อนพันธุ์อนุรักษ์ จำนวน 30 พันธุ์ ที่ปลูกอนุรักษ์ไว้ ณ ศูนย์หม่อนไหมเฉลิมพระเกียรติฯ ศรีสะเกษ โดยใช้ข้อมูลดีเอ็นเอของคลอโรพลำสต์บริเวณ trnL-trnF intergenic spacer และนิวเคลียร์ไรโบโซมอลบริเวณ internal transcribed spacer (ITS) ในกำรวิเคราะห์ควำมสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของหม่อนทั้ง 30 พันธุ์ เปรียบเทียบ กับหม่อนที่ได้ระบุชื่อชนิดแล้วบนฐานข้อมูลสากลของ National Center for Biotechnology Information (NCBI) ด้วยวิธี Maximum likelihood และ Maximum Parsimony ผลการศึกษาพบว่า หม่อนทั้ง 30 พันธุ์ มีลำดับ นิวคลีโอไทด์บริเวณ trnL-trnF ขนาด 901 คู่เบส และบริเวณ ITS ขนาด 508 คู่เบส ยกเว้นหม่อนป่าพันธุ์โละโคะ 1 และโละโคะ 17 มีขนาด 521 คู่เบส สามารถวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของหม่อนได้ 10 กลุ่ม ดังนี้ กลุ่มที่ (1) พันธุ์หุ่ง แสดงความเป็น sister clade กับหม่อนอีก 29 พันธุ์แยกออกมาอย่างชัดเจน กลุ่มที่ (2) พันธุ์ SKSM 090100, SKSM 090161, SKSM 100262, SKSM 720133, SKSM 720139, SKSM 720181, SKSM 810391, SKSM 820281, SKS 14-13-4 และ SKS 14-13-20 แสดงความใกล้ชิดกับ M. alba var. multicaulis และ M. bombycis กลุ่มที่ (3) หม่อนป่าพันธุ์โละโคะ 1 และโละโคะ 17 แสดงความใกล้ชิดกับ M. wittiorum กลุ่มที่ (4) พันธุ์แก้ว เชียงคำ ตำดำ น้อย ไผ่ โพธิ์ ส้ม จัดกลุ่มอยู่ด้วยกันแต่ไม่แสดงควำมใกล้ชิดกับ M. rotundiloba ซึ่งเป็นชื่อชนิดของพันธุ์เหล่ำนี้ ที่ถูกบันทึกไว้ กลุ่มที่ (5) พันธุ์คุณไพ แสดงควำมใกล้ชิดกับ M. yunnanensis กลุ่มที่ (6) พันธุ์บุรีรัมย์ 60 แสดงควำม ใกล้ชิดกับ M. alba กลุ่มที่ (7) พันธุ์เชียงใหม่, สกลนคร, SKSM 090200 และ SKSM 1001886 แสดงควำมใกล้ชิด กับหม่อนลูกผสม M. alba x M. rubra กลุ่มที่ (8) พันธุ์หมายเลข 44 แสดงความใกล้ชิดกับ M. australis กลุ่มที่ (9) พันธุ์ SKSM 820286 แสดงความใกล้ชิดกับ M. alba var. atropurpurea และกลุ่มที่ (10) พันธุ์ SKSM 100162 และ SKS 14-14-9 จับกลุ่มด้วยกัน แต่ไม่แสดงควำมใกล้ชิดอย่างชัดเจนกับชนิดของหม่อนบนฐานข้อมูล NCBI ทั้งนี้ มีเพียง 4 พันธุ์ที่สามารถระบุความใกล้เคียงกับหม่อนบางชนิดได้ คือ พันธุ์โละโคะ 1 และโละโคะ 17 ระบุได้ว่าเป็นMorus cf. wittiorum พันธุ์เชียงใหม่ และ SKSM 090200 ระบุได้ว่าเป็น Morus cf. nigra L. ซึ่งผลการวิจัยนี้ใช้เป็น แนวทางในการศึกษาลักษณะทางสัณฐานและข้อมูลดีเอ็นเอของหม่อนประกอบกันเพิ่มเติม เพื่อระบุชื่อวิทยาศาสตร์ ของหม่อนให้ถูกต้องและเป็นปัจจุบันตำมหลักอนุกรมวิธานพืช ทั้งนี้ตัวอย่างพรรณไม้แห้งอ้างอิงงานวิจัย (Herbarium voucher specimen) ของหม่อนทั้ง 30 พันธุ์ จำนวน 46 หมายเลข ได้ลงทะเบียนเก็บรักษาไว้ในพิพิธภัณฑ์พืชกรุงเทพ กรมวิชาการเกษตร (Bangkok Herbarium, BK) และข้อมูลดีเอ็นเอบริเวณ trnL-trnF และ ITS จำนวน 60 หมายเลข ได้ลงทะเบียนเก็บรักษาไว้ในฐานข้อมูลของ NCBI เพื่อใช้เป็นหลักฐานทางพันธุกรรมของหม่อนที่สามารถใช้ต่อยอด งำนวิจัยในกำรจำแนกและระบุชนิดของหม่อนให้ถูกต้องชัดเจนมากขึ้นในอนาคต รวมถึงใช้เป็นแนวทางในการวางแผน อนุรักษ์และการใช้ประโยชน์จากหม่อนของประเทศไทยอย่างยั่งยืนสืบไป
บทคัดย่อ (EN): The Queen Sirikit Department of Sericulture has managed to conserve more than 200 cultivars of mulberry (Morus L.) in the genetic conservation centers around the country. However, the unclear identification name information of mulberry cultivars is needed to be solved for future studies. The first priority of those problems was to verify the identification names of mulberry to collect the mulberry cultivars for future use. This research was carried out in 2016 – 2018. The research aimed to classify and identify 30 mulberry cultivars {collected from the Mulberry Genetic Conservation Field, The Queen Sirikit Sericulture Center (Sisaket)} based on DNA data. Both chloroplast trnL- trnF and nuclear ribosomal ITS sequences were used to generate a phylogenetic relationship of Morus taxa, including 19 taxa from the National Center for Biotechnology Information (NCBI). The phylogenetic trees were constructed by the Maximum likelihood and Maximum Parsimony Methods. The results showed that the length of all sequences of trnL-trnF is 901 base pairs (bp) while the length of ITS is 508 bp. except for Loko 1 and Loko 17 is 521 bp. The results of the phylogenetic analyses can be divided the 30 mulberry cultivars into 10 major groups as follows : Group (1) Hung formed a sister clade with other 29 cultivars; Group (2) SKSM 090100, SKSM 720139, SKSM 720181, SKSM 810391, SKSM 820281, SKS 14-13-4 and SKS 14-13-20 show close relationship to M. alba var. multicaulis and M. bombycis ; Group (3) Loko 1 and Loko 17 show close relationship with M. wittiorum ; Group (4) Kaew, Chiang Kam, Tadam, Noi, Pai, Poe, and Som formed a group but show no relationship with M. rotundiloba which is the same species name as them ; Group (5) Kun Pai shows a close relationship with M. yunnanensis ; Group (6) Buriram 60 shows a close relationship with M. alba ; Group (7) Chiang Mai, Sakonnakorn, SKSM 090200 and SKSM 1001886 show a close relationship with the hybrid M. alba x M. rubra ; Group (8) Number 44 shows a close relationship with M. australis ; Group (9) SKSM 820286 shows a close relationship with M. alba var. atropurpurea and Group (10) SKSM 100162 and SKS14-14-9 formed a sister clade. Only of 4 mulberry cultivars could be specified closely to some cultivars as Loco 1 and Loco 17 to be Morus cf. wittiorum while Chiangmai and SKSM 090200 could be specified as Morus cf. nigra L. The results obtained from this research can be used as a guideline for morphology and DNA studies to identify the correct name according to the taxonomy of the genus Morus in the future. Besides, the 46 herbarium voucher specimens of 30 mulberry cultivars were deposited to the Bangkok Herbarium, Department ofAgriculture (BK) and the 60 DNA sequences of trnL-trnF and ITS were submitted to the GenBank, NCBI. Both genetic pieces of evidence of mulberry can be used to further research on mulberry identification and as a guideline for sustainable conservation planning and utilization of mulberry in Thailand.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: กรมหม่อนไหม
คำสำคัญ: แผนภูมิความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ
คำสำคัญ (EN): Phylogenetic tree
หมวดหมู่:
  1. TARR::พืช::อื่นๆ::หม่อน
  2. 276
หมวดหมู่ AGRIS:
  1. A เกษตรทั่วไป (Agriculture)::A50 การวิจัยทางการเกษตร (Agricultural research)
  2. 3
เจ้าของลิขสิทธิ์: กรมหม่อนไหม
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

บุษรา จงรวยทรัพย์. "การวิเคราะห์ลำดับเบสของ cpDNA trnL-trnF และ nrDNA ITS ในหม่อนพันธุ์อนุรักษ์DNA Sequence Analysis of cpDNA trnL-trnF and nrDNA ITS in Conservation Mulberry (Morus spp.) Varieties". กรมหม่อนไหม. 2561

บุษรา จงรวยทรัพย์. "การวิเคราะห์ลำดับเบสของ cpDNA trnL-trnF และ nrDNA ITS ในหม่อนพันธุ์อนุรักษ์DNA Sequence Analysis of cpDNA trnL-trnF and nrDNA ITS in Conservation Mulberry (Morus spp.) Varieties". กรมหม่อนไหม. 2561. Print.



TARR Wordcloud:
การวิเคราะห์ลำดับเบสของ cpDNA trnL-trnF และ nrDNA ITS ในหม่อนพันธุ์อนุรักษ์
บุษรา จงรวยทรัพย์
กรมหม่อนไหม
2561
กรมหม่อนไหม
การวิเคราะห์ลำดับเบสยีน ITS2 และ psbA-trnH ในผักหวานป่า การรวบรวมและอนุรักษ์พันธุ์ข้าว การพัฒนาการเพาะเลี้ยงม้าน้ำเพื่อการอนุรักษ์ การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของหม่อนพันธุ์อนุรักษ์ด้วยลายพิมพ์ดีเอ็นเอ จากเทคนิค SSR การศึกษา และอนุรักษ์บัวหลวงราชินี การศึกษาเบื้องต้นในการเพาะและอนุบาลลูกปูม้าเพื่อการอนุรักษ์ โครงการอนุรักษ์พันธุ์กรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริฯ โครงการวิจัยและอนุรักษ์พันธุกรรมพืช ผลการวิเคราะห์อาหารสัตว์ การอนุรักษ์และใช้ประโยชน์เชื้อพันธุกรรมข้าว: อดีต ปัจจุบัน และอนาคต
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair