สืบค้นงานวิจัย
การทำฐานข้อมูลดีเอ็นเอมะขามเพื่อหาความสัมพันธ์กับยีนต้านเชื้อราด้วยเทคนิคไมโครแซทเทลไลท์
สุรเชษฐ เอี่ยมสำอาง - มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบูรณ์
ชื่อเรื่อง: การทำฐานข้อมูลดีเอ็นเอมะขามเพื่อหาความสัมพันธ์กับยีนต้านเชื้อราด้วยเทคนิคไมโครแซทเทลไลท์
ชื่อเรื่อง (EN): Data Mining of Expression of Antifungal Genes Database of DNA-based Markers in Tamarind indica Using by Microsatellite
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สุรเชษฐ เอี่ยมสำอาง
บทคัดย่อ: จากการศึกษาหาความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของมะขามแต่ละพันธ์ปลูก มะขามถูกจัดกลุ่ม ความสัมพันธ์ของวิวัฒนาการโดยการศึกษาดีเอ็นเอบริเวณไมโครแซทเทลไลท์ พบว่า สามารถจัดกลุ่ม มะขามได้ดังนี้คือ กลุ่มที่ 1 มะขามพันธุ์ปลูก สีทอง เปรี้ยวยักษ์ เปรี้ยวพื้นเมือง กลุ่มที่ 2 มะขามพันธุ์ ปลูก ขันตี น้ำผึ้ง อินทผาลัม นาศรีนวล กลุ่มที่ 3 มะขามพันธุ์ปลูกหมื่นจง และ นิ่มนวล กลุ่มที่ 4 มะขามพันธุ์ปลูกศรีชมพู และเมื่อทดสอบความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการด้วยวิธีการวิเคราะห์ลำดับเบส บริเวณยีน r๖๕ จากมะขามทั้งหมดจำนวน 19 พันธุ์ปลูก โดยใช้โปรแกรม BioEdit ด้วยวิธี Neigh bor-Joining/ UPGMA method ได้ผลคือ มะขามถูกแบ่งออกเป็น 2 กลุ่ม และในการหา ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการด้วยเทคนิคไมโครแซทเทลไลท์ และเทคนิคการวิเคราะห์ลำดับยีนด้วย การใช้ยืน r๖๔( ร่วมกัน พบว่า มีมะขามพันธุ์ปลูกบางส่วนที่มีลักษณะความสัมพันธ์ที่คล้ายกันในการ วิเคราะห์ทั้งสองแบบ เช่นในพันธุ์ปลูกขันตรี น้ำผึ้ง และอินทผาลัม ถูกจัดอยู่ในกลุ่มเดียวกัน พันธุ์ปลูก เปรี้ยวยักษ์และเปรี้ยวพื้นเมืองถูกจัดอยู่ในกลุ่มเดียวกัน แต่มีบางส่วนที่ให้ข้อมูลไม่สัมพันธ์กันเช่น เทคนิคไมโครแซทเทลไลท์จัดพันธุ์ปลูกสีทอง น้ำผึ้งและหมื่นจง อยู่คนละกลุ่ม ในขณะที่การใช้เทคนิค การวิเคราะห์ลำดับยีนด้วยการใช้น r๖c จัดกลุ่มมะขามพันธุ์ดังกล่าวอยู่ในกลุ่มเดียวกัน ซึ่งจากสิ่งที่ เกิดขึ้นดังกล่าว อาจเกิดข้อจำกัดขึ้นบางประการเกี่ยวกับระสิทธิภาพของเครื่องมือทางโมเลกุลที่ใช้ เช่น การเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอในบริเวณที่มีความแปรปรวนน้อยในวิธีหนึ่ง แต่กลับมีการเพิ่มปริมาณได้ ในบริเวณที่มีความแปรปรวนมากในอีกวิธีหนึ่ง จึงทำให้ผลการทดลองอาจไม่สามารถให้คำตอบได้ อย่างชัดเจน จึงต้องมีการทบทวนและวางแผนเพื่อค้นหาวิธีการในการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุล เพื่อให้สอดคล้องกับการศึกษาแผนที่ทางพันธุกรรมให้มีความเหมาะสมและสามารถจัดจำแนก ความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการของมะขามให้มีประสิทธิภาพมากยิ่งขึ้นต่อไป
บทคัดย่อ (EN): The study evolutionary relationships of each species planted tamarind. Tamarind is grouped relationship of evolution by studying DNA in microsatellite that can be grouped tamarind as follows: group 1, tamarind cultivated See tong, Preao yak and Preao puen muang, group 2 tamarind cultivated Khuntee, Num pueng, Intapalum, and Na Sre Nuan cultivated. Group 3 Muen jung and Nim Nun. Group 4 Sri chom poo cultivars. When testing evolutionary relationship with the sequence analysis in rbcl gene of tamarind total of 19 cultivars using BioEdit by Neighbor- Joining / UPGMA method works is tamarind were divided into 2 groups, and in the relationship. Phylogenetic with microsatellite. And technical analysis using gene sequences showed a tamarind rbcl together some cultivars are characterized by similar relationship to analyze both. As in cultivated Khuntee, Num pueng and Intapalum are in the same group. Planting native species Preao puen muang and Preao yak are in the same group. But there are some that do not correlate such information. Microsatellite be cultivated See tong, Num pueng and Muen jung Different groups While the use of gene sequence analysis using gene clustering rbcl tamarind seeds are in the same group. Which of these things happen. Potential limitations on the effectiveness of some of the tools used, such as the DNA molecule in a minor variability in the way. But were increased in areas with considerable variability in another way. Therefore, the results may not be able to answer clearly. We need to review and plan to find ways to develop molecular markers to comply with genetic studies to be appropriate and phylogenetic classification of tamarind efficiency even further.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบูรณ์
คำสำคัญ: เทคนิคไมโครแซทเทไลท์
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุรเชษฐ เอี่ยมสำอาง. "การทำฐานข้อมูลดีเอ็นเอมะขามเพื่อหาความสัมพันธ์กับยีนต้านเชื้อราด้วยเทคนิคไมโครแซทเทลไลท์Data Mining of Expression of Antifungal Genes Database of DNA-based Markers in Tamarind indica Using by Microsatellite". มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบูรณ์. 2557

สุรเชษฐ เอี่ยมสำอาง. "การทำฐานข้อมูลดีเอ็นเอมะขามเพื่อหาความสัมพันธ์กับยีนต้านเชื้อราด้วยเทคนิคไมโครแซทเทลไลท์Data Mining of Expression of Antifungal Genes Database of DNA-based Markers in Tamarind indica Using by Microsatellite". มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบูรณ์. 2557. Print.



TARR Wordcloud:
การทำฐานข้อมูลดีเอ็นเอมะขามเพื่อหาความสัมพันธ์กับยีนต้านเชื้อราด้วยเทคนิคไมโครแซทเทลไลท์
สุรเชษฐ เอี่ยมสำอาง
มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบูรณ์
30 กันยายน 2557
การสำรวจเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ในปลาตระกูลตะเพียน โดยวิธีการทดสอบพีซีอาร์ข้ามชนิด การวิเคราะห์การทำงานของยีนที่ใช้ในการสังเคราะห์สารเคอร์คูมินอยด์ในขมิ้นชันโดย RNA interference การศึกษายีนที่สร้างสารเอ็นเทอโรท็อกซินในเชื้อ S. aureus ที่แยกได้จากโคที่เป็นโรคเต้านมอักเสบในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย การจัดการเชื้อราแบบผสมผสานในสวนมะขามหวานของเกษตรกรเครือข่ายวิสาหกิจชุมชนมะขามหวาน จังหวัดเพชรบูรณ์ การประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์ การพัฒนาคุณภาพมะขามหวานโดยการป้องกันกำจัดเชื้อรา ตามแนวเศรษฐกิจพอเพียง ด้วยภูมิปัญญาท้องถิ่นของชุมชนบ้านซับแล้ง ต.ยางงาม อ.หนองไผ่ จ.เพชรบูรณ์ การแยกความแตกต่างของเชื้อราไรซอคโทเนียสาเหตุโรครากเน่าของสตรอเบอรี่โดยใช้เทคนิคลายพิมพ์ดีเอ็นเอ การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของหม่อนพันธุ์อนุรักษ์ด้วยลายพิมพ์ดีเอ็นเอ จากเทคนิค SSR ความหลากหลายทางพันธุกรรมของปลาชะโอน 6 กลุ่มประชากร โดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ดีเอ็นเอ การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมัน
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair