สืบค้นงานวิจัย
การสร้างต้นแบบการผลิตชีวมวลของสไปรูลิน่าในสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ โดยการวิเคราะห์เชิงระบบด้วยข้อมูลระดับโปรตีโอม และวิธีวิเคราะห์ฟลักซ์บาลานซ์
อภิรดี หงส์ทอง - สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ชื่อเรื่อง: การสร้างต้นแบบการผลิตชีวมวลของสไปรูลิน่าในสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ โดยการวิเคราะห์เชิงระบบด้วยข้อมูลระดับโปรตีโอม และวิธีวิเคราะห์ฟลักซ์บาลานซ์
ชื่อเรื่อง (EN): Systematic analyses of cyanobacterial model in response to temperature stresses by integration of proteome-wide and flux balance analyses for Spirulina-biomass production modeling
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: อภิรดี หงส์ทอง
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
บทคัดย่อ: Spirulina เป็นไซยาโนแบคทีเรียเพียงชนิดเดียว ที่เพาะเลี้ยงในบ่อเลี้ยงกลางแจ้ง (Outdoor mass cultivation) ซึ่งเป็นรูปแบบการเพาะเลี้ยงที่มีต้นทุนต่ำได้ เแต่เนื่องจาก Spirulina ที่ใช้การเพาะเลี้ยงแบบในบ่อเลี้ยงกลางแจ้งนั้น มีปัญหาหนึ่งที่พบคือการผันผวนของอุณหภูมิของการเพาะเลี้ยงในช่วงกลางวันและกลางคืน ซึ่งส่งผลกระทบต่อการสร้างชีวมวล (Biomass) ที่ลดลง เครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน (PPI networks) ที่ระดับ Translational และ Post-translational สร้างขึ้นมาจากข้อมูลที่ได้จากการวิเคราะห์ด้าน Proteome-wide ที่ระดับการแสดงออกของโปรตีนและใน Phosphorylation ของโปรตีนในการตอบสนองต่อสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ โดยเครือข่ายปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนทั้งสองระดับนี้ได้นำมา Align และเปรียบเทียบเพื่อระบุหาเครือข่ายย่อยปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนที่แสดงในทั้งสองระดับ ซึ่งโปรตีนในเครือข่ายย่อยที่มีการควบคุมทั้งสองระดับนี้มีชื่อว่า &ldquo;Bi-level regulated proteins&rdquo; จากสมมติฐานที่ว่าโปรตีนถูกควบคุมทั้งในระดับ Translational และ Post-translational และโปรตีนที่เกี่ยวข้องน่าจะเป็นส่วนประกอบสำคัญของกระบวนการตอบสนองต่อสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ เพื่อสร้าง Metabolic flux model ที่ต่างจากวิธีเดิม เนื่องจากเป็นการใช้ข้อมูลจากผลการทดลองจริงในระดับ Proteome-wide ของ Spirulina และในโครงการนี้จะทำการ Verify model เบื้องต้นโดยการเลี้ยง Spirulina สายพันธุ์ดั้งเดิมใน Bioreactor ประมาณ 2 การทดลองตามผลที่ได้จากการวิเคราะห์ FBA เพื่อ Verify model ซึ่งคาดว่าจะนำไปสู่ Knowledge-to-process เพื่อปรับปรุงสภาวะการเลี้ยงและปรับปรุงสายพันธุ์ Cyanobacteria ให้มีความทนทานต่อการเปลี่ยนแปลงอุณหภูมิ และนำไปสู่การผลิต Biomass ให้ได้ในระดับสูงสุด (Maximum yield) แบบคงที่ตลอดทั้งปี</p>
บทคัดย่อ (EN): Photosynthetic organisms including algae and cyanobacteria have been studied extensively for their feasibility to use as a source for production of value-added bio-product(s) due to their ability to absorb greenhouse gas (carbon dioxide) and to be grown in large outdoor cultures. Spirulina (Arthrospira sp.) is the only cyanobacterium that can be mass cultivated in outdoor ponds, thus it can be a model organism for bio-factory. Proteome-wide analyses of Spirulina and a cyanobacterial model, Synechococcus elongatus PCC7942, under temperature stresses for protein expression level and post-translational modification lead to information required for understanding of cellular response and regulation under the condition of interest. In our previous studies where large-scale datasets are generated, bioinformatics plays a critical role in data mining and integration for in-depth analyses. Bi-level regulated proteins, of which regulation occurred at the translational and post-translational levels, were identified by using a bioinformatic tool, SpirPro. Flux balance analysis (FBA) model will be constructed by using proteome-wide data obateined from our previous works, thus the model will be constructed differently from the typical FBA model. Then, the model will be verified by growing Spirulina (wild type) in bioreactor (2 experiments) according to the conditions obtained from the analyses.<br />This reseach proposal aims for knowledge-to-process by connected basic knowledge, proteome-wide data and bi-level analysis, to process, mass cultivation, by using FBA to construct metabolic flux model. In the near future, the model can be applied for maximizing biomass yield throughout the year.</p>
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
คำสำคัญ: ต้นแบบการเลี้ยงเพื่อชีวมวล
คำสำคัญ (EN): Biomass production
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

อภิรดี หงส์ทอง. "การสร้างต้นแบบการผลิตชีวมวลของสไปรูลิน่าในสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ โดยการวิเคราะห์เชิงระบบด้วยข้อมูลระดับโปรตีโอม และวิธีวิเคราะห์ฟลักซ์บาลานซ์Systematic analyses of cyanobacterial model in response to temperature stresses by integration of proteome-wide and flux balance analyses for Spirulina-biomass production modeling". สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. 2561

อภิรดี หงส์ทอง. "การสร้างต้นแบบการผลิตชีวมวลของสไปรูลิน่าในสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ โดยการวิเคราะห์เชิงระบบด้วยข้อมูลระดับโปรตีโอม และวิธีวิเคราะห์ฟลักซ์บาลานซ์Systematic analyses of cyanobacterial model in response to temperature stresses by integration of proteome-wide and flux balance analyses for Spirulina-biomass production modeling". สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ. 2561. Print.



TARR Wordcloud:
การสร้างต้นแบบการผลิตชีวมวลของสไปรูลิน่าในสภาวะเครียดจากอุณหภูมิ โดยการวิเคราะห์เชิงระบบด้วยข้อมูลระดับโปรตีโอม และวิธีวิเคราะห์ฟลักซ์บาลานซ์
อภิรดี หงส์ทอง
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
2561
การผลิต Inulin และ Oligofructose จากกล้วยเพื่อใช้เป็นสารเสริมอาหาร การวิเคราะห์ระบบนิเวศเกษตร การผลิตไฮโดรเจนจากชีวมวลสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินสกุล Hapalosiphon sp. โดยวิธี three-step microbial hydrogen-producing system การพัฒนาวิธีวิเคราะห์หาแอมโมเนียไนโตรเจนในดิน การศึกษาการผลิตอาหารสุนัข ศักยภาพของป่าริมน้ำในแถบลุ่มน้ำชีเพื่อใช้เป็นแหล่งพลังงานชีวมวล ในครัวเรือนชนบท กรณีศึกษาจังหวัดขอนแก่น ผลการอบไม้ยางพาราภายใต้ระดับอุณหภูมิที่แตกต่างกัน ที่มีต่อการทำลายของปลวกใต้ดิน Coptotermes gestroi (Wasmann) การผลิตน้ำยาขนมจีนกึ่งสำเร็จรูป การวิเคราะห์แนวทางการจัดระบบการผลิตและการตลาดมันสำปะหลัง ปี 2537-2541 การวิเคราะห์ปัญหาชุมชนชนบทในเชิงระบบ
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair