สืบค้นงานวิจัย
การทำข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โคดิ้งของลำไยในประเทศไทย
สุภารัตน์ ลีธนัชอุดม - มหาวิทยาลัยแม่โจ้
ชื่อเรื่อง: การทำข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โคดิ้งของลำไยในประเทศไทย
ชื่อเรื่อง (EN): DNA barcoding for Longan (Dimocarpus longan Lour.) in Thailand
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สุภารัตน์ ลีธนัชอุดม
บทคัดย่อ: งานวิจัยนี้ได้ดาเนินการวิเคราะห์ลาดับเบสโดยใช้คู่ไพรเมอร์สาหรับดีเอ็นเอบาร์โคดิ้ง จานวน 3 คู่ไพรเมอร์ ได้แก่ matK, rbcL และ psbA-trnH ในตัวอย่างดีเอ็นเอลาไยสายพันธุ์ต่าง ๆ รวมทั้งสิ้น 26 สายพันธุ์ ร่วมกับตัวอย่างดีเอ็นเอจากลิ้นจี่ 2 สายพันธุ์ เมื่อนา ข้อมูลลา ดับนิวคลีโอ ไทด์มาวิเคราะห์พบว่ามีความแตกต่างของลาดับนิวคลีโอไทด์ในยีน psbA-trnH ระหว่างตัวอย่างดี เอ็นเอจากลาไย 26 สายพันธุ์และลิ้นจี่ 2 สายพันธุ์ โดยผลของการวิเคราะห์ด้วยวิธี multiple sequence alignment analysis เปรียบเทียบในทุกตัวอย่างแสดงให้เห็นว่า มีการกลายพันธุ์ชนิดการ ขาดหายไปของลาดับเบสจานวน 70 เบส ในตัวอย่างลาไยสายพันธุ์เถา การขาดหายไปของลาดับ เบสจา นวน 6 เบส ในตัวอย่างลา ไยสายพันธุ์เถา ดอแก้วหยี บ้านโฮ่ง 60 พื้นเมือง และลิ้นจี่ทั้ง 2 ตัวอย่าง นอกจากนี้พบว่ามีการเพิ่มเบสชนิดอะดินีนในตัวอย่างลา ไยสายพันธุ์เถา ดอแก้วหยี บ้าน โฮ่ง 60 และพื้นเมือง ข้อมูลดังกล่าวสามารถนามาวิเคราะห์เพื่อหาความสัมพันธ์ทางวิวัฒนาการ ระหว่างลา ไย 26 สายพันธุ์ ลิ้นจี่ 2 สายพันธุ์ และลา ดับเบสของลา ไย 7 ตัวอย่างจากฐานข้อมูล NCBI โดยในงานวิจัยนี้สามารถให้ข้อมูลความสัมพันธ์และความหลากหลายทางพันธุกรรมระหว่างลา ไย ที่เพาะปลูกในประเทศไทยกับลิ้นจี่ และลาไยที่เพาะปลูกในประเทศจีนโดยข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โคดิ้ง จากการศึกษานี้สามารถนามาใช้ในการระบุและจัดจา แนกชนิดลา ไยสายพันธุ์ในประเทศไทย โดยเฉพาะสายพันธุ์เถา คา สา คัญ: ลา ไย?ดีเอ็นเอบาร์โคดิ้ง?ความสัมพันธ์และความหลากหลายทางพันธุกรรม?ความสัมพันธ์ทาง วิวัฒนาการ
บทคัดย่อ (EN): This study used 3 DNA barcoding primers to amplified matK, rbcL and psbA-trnH genes from total 26 longan varieties and 2 types of lychee. The nucleotide diversity was identified in the psbA-trnH region among 26 longan and lychee samples. The multiple sequence alignment analysis showed three locations of base InDel mutation consisted of 70 bp deletion which found only in Thao variety, 6 bp deletion found in Thao, Daw Kaew Yee, Baan Hong 60, Phuen Mueang and 2 lychee varieties, and adenine base insertion in 4 longan varieties which are Thao, Daw Kaew Yee, Baan Hong 60 and Phuen Mueang. The phylogenetic tree show genetic relationship between 26 longan varieties with 2 lychee cultivar and 7 accession numbers of longan psbA-trnH sequence from NCBI database. This study is the first report of genetic diversity and relationship of longan cultivar planted in Thailand with lychee and longan cultivar in China. Moreover, the DNA barcoding was successfully used to discriminate the variety of longan. A unique genetic character which found in this study can be used as the genetic marker for identification of some longan variety in Thailand especially Thao variety.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยแม่โจ้
คำสำคัญ: ดีเอ็นเอบาร์โคดิ้งของลำไย
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุภารัตน์ ลีธนัชอุดม. "การทำข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โคดิ้งของลำไยในประเทศไทยDNA barcoding for Longan (Dimocarpus longan Lour.) in Thailand". มหาวิทยาลัยแม่โจ้. 2558

สุภารัตน์ ลีธนัชอุดม. "การทำข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โคดิ้งของลำไยในประเทศไทยDNA barcoding for Longan (Dimocarpus longan Lour.) in Thailand". มหาวิทยาลัยแม่โจ้. 2558. Print.



TARR Wordcloud:
การทำข้อมูลดีเอ็นเอบาร์โคดิ้งของลำไยในประเทศไทย
สุภารัตน์ ลีธนัชอุดม
มหาวิทยาลัยแม่โจ้
30 กันยายน 2558
การศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของลำไยด้วยเทคนิคไอดีอาร์เอพีดี อนุกรมวิธานของฟิล์มมี่เฟิร์นสกุล Hymenophyllum s.l. (Hymenophyllaceae) ในประเทศไทย การทำไอศกรีมลำไย เกษตรอินทรีย์และมาตรฐานการส่งออกของประเทศไทย การจัดการธุรกิจลำไยอินทรีย์ในเขตภาคเหนือตอนบนของไทย การประยุกต์ใช้ข้อมูลจากดาวเทียม VIIRS เพื่อศึกษาการทำประมงประกอบแสงไฟในน่านน้ำไทย การประยุกต์ใช้ข้อมูลระยะไกลและข้อมูลภาคสนามเพื่อประเมินสภาวะการขาดน้ำของลำไย การบริหารจัดการเทคโนโลยีเพื่อผลิตลำไยนอกฤดูในพื้นที่ภาคเหนือของประเทศไทย ระยะที่ 1 บทบาทของศาสนาพุทธในการพัฒนาชนบทของประเทศไทย การศึกษาโครโมโซมของลำไย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair