สืบค้นงานวิจัย
Rubber tree powdery mildew genome and transcriptome sequencing, and effect proteins predicting
He Qiguan - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Rubber tree powdery mildew genome and transcriptome sequencing, and effect proteins predicting
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): He Qiguan
บทคัดย่อ (EN): Powdery mildew is one of the most important rubber tree diseases, caused by obligate biotroph fungal Oidium heveae whose molecular mechanism of the pathogen is still not clear.We clear the complete infection process of O. heveae by microscopic observation. At the sametime, we used an Illumina sequencing approach to sequence the haploid O. heveae isolateHO-73 genome for the first time. The total de novo assembly sizes are 53.4 Mb, scaffolds N50length is 82.3kbp. However, based on depth of coverage of contigs, we estimated the genomesize of O. heveae at 107Mb. The O. heveae genome harbors 12,625 protein-coding genes and311 KEGG pathways. We also applied RNA-seq and assembled the O. heveae transcripts expressed during the interaction with rubber leaves at 0hpi, 24hpi, 3dpi, 30 dpi stages, and the rubber leaves transcripts. In total, 2169 differentially expressed genes were found in O. heveae. According to the genome and transcriptome of O. heveae which had been sequenced by former research work in our Lab, we screening to 233 candidate secreted effector proteins (CSEPs), and7among them are conservative for powdery mildew. In addition, 106 effector proteinsshare a three-amino acid motif, which named "Y/F/WxC", in the N-terminal of the mature proteins and 14 RxLR effector proteins.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เผยแพร่โดย (EN): การยางแห่งประเทศไทย
คำสำคัญ (EN): effector proteins
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): การยางแห่งประเทศไทย
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

He Qiguan. "Rubber tree powdery mildew genome and transcriptome sequencing, and effect proteins predicting". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

He Qiguan. "Rubber tree powdery mildew genome and transcriptome sequencing, and effect proteins predicting". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
Rubber tree powdery mildew genome and transcriptome sequencing, and effect proteins predicting
He Qiguan
การยางแห่งประเทศไทย
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Transcriptome Analyses Reveal Molecular Mechanism Underlying Tapping Panel Dryness of Rubber Tree (Hevea brasiliensis) De novo transcriptome sequencing of abiotic stress responsive transcripts of Hevea brasiliensis Functional analysis of HbMlo12 in powdery mildew infection and stress response in the rubber tree Hevea brasiliensis Muell Arg. จีโนมของไวรัสซิกาที่ติดเชื้อในยุงรำคาญจากการเพาะเลี้ยงในห้องปฏิบัติการโดย Next-generation sequencing Complete genome sequences of Zika virus from infected laboratory strains of Culex quinquefasciatus Phylogenetic Relationships and rDNA-ITS Sequence Analyses of Oidium heveae, a Powdery Mildew of Rubber Tree Rubber Particles Proteins and Sensitivity to the Tapping Panel Dryness at Hevea brasiliensis Effect of Three Rootstocks on the Same Scion PR107 of Hevea brasiliensis การศึกษา whole genome sequence ของไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อย ที่เกิดการระบาดในประเทศไทย Whole-genome sequence analysis of Zika virus isolated from the plasma of an infected patient in Thailand การศึกษา whole genome sequence ของไวรัสโรคปากและเท้าเปื่อย ที่เกิดจากการระบาดในประเทศไทย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair