สืบค้นงานวิจัย
(ภาษาอังกฤษ) Functional characterization of a novel C-type lectin gene in the black tiger shrimp, Penaeus monodon
ราตรี วงศ์ปัญญา - มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
ชื่อเรื่อง: (ภาษาอังกฤษ) Functional characterization of a novel C-type lectin gene in the black tiger shrimp, Penaeus monodon
บทคัดย่อ: เลคตินชนิดซี (C-type lectin) เป็นโปรตีนในกลุ่มเลคติน ซึ่งสามารถจับกับน้ำตาลที่จำเพาะโดยมีบทบาทสำคัญในระบบภูมิคุ้มกันตามธรรมชาติของสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลัง จากการศึกษาลำดับนิวคลีไทด์ของยีน C-type lectin ในกุ้งกุลาดำ พบว่า open reading frame (ORF) ของยีนประกอบด้วย 657 คู่เบส แปลรหัสเป็นกรดอะมิโน 218 ตัว พบ signal peptide อยู่ทางด้านปลายอะมิโนมีความยาว 24 กรดอะมิโน จากผลการวิเคราะห์ด้วยโปรแกรม ScanProsite เพื่อหาบริเวณอนุรักษ์ พบว่า C-type lectin มี carbohydrate recognition domain (CRD) จำนวน 1 โดเมน (E-value = 1.18e-12) และพบ conserved cysteine จำนวน 4 ตำแหน่ง คือ Cys58, Cys126, Cys141 และ Cys149 ที่คาดว่าสามารถสร้างพันธะไดซัลไฟด์ภายในโครงสร้างได้ แต่ไม่พบบริเวณจับกับน้ำตาลที่จำเพาะ การผลิตรีคอมบิแนนท์ C-type lectin ในระบบแบคทีเรีย E.coli สายพันธุ์ Rosetta (DE3) โดยใช้เวคเตอร์ 2 ชนิด คือ pET28b และ pET32a ซึ่งทั้ง 2 ระบบเวคเตอร์ พบว่าสามารถผลิตรีคอมบิแนนท์โปรตีนที่มีขนาด 24 กิโลดาลตัน และ 39 กิโลดาลตัน ตามที่คาดไว้ ตามลำดับ แต่ปริมาณโปรตีนที่ได้มีจำนวนน้อยและอยู่ในรูปตะกอน จึงไม่เพียงพอต่อการนำไปทำบริสุทธิ์และศึกษาลักษณะสมบัติได้ และเมื่อนำมาผลิตในระบบยีสต์ก็พบว่ายังไม่สามารถสร้างรีคอมบิแนนท์โปรตีนเลคตินได้ ดังนั้นการผลิตรีคอมบิแนนท์โปรตีนเลคตินจึงยังคงมีความพยายามต่อไป เช่น คัดเลือกแบคทีเรียสายพันธุ์อื่นๆ ที่อาจเหมาะสมในการสร้างรีคอมบิแนนท์โปรตีนเลคติน ผลที่ได้จากการศึกษาครั้งนี้อาจเป็นข้อมูลพื้นฐานสำคัญในการเพิ่มความเข้าใจในระบบภูมิคุ้มกันของกุ้งกุลาดำ ซึ่งอาจนำไปสู่การประยุกต์ใช้เพื่อการพัฒนาและส่งเสริมอุตสาหกรรมการเลี้ยงกุ้งกุลาดำที่ยั่งยืนต่อไปเลคตินชนิดซี (C-type lectin) เป็นโปรตีนในกลุ่มเลคติน ซึ่งสามารถจับกับน้ำตาลที่จำเพาะโดยมีบทบาทสำคัญในระบบภูมิคุ้มกันตามธรรมชาติของสัตว์ไม่มีกระดูกสันหลัง จากการศึกษาลำดับนิวคลีไทด์ของยีน C-type lectin ในกุ้งกุลาดำ พบว่า open reading frame (ORF) ของยีนประกอบด้วย 657 คู่เบส แปลรหัสเป็นกรดอะมิโน 218 ตัว พบ signal peptide อยู่ทางด้านปลายอะมิโนมีความยาว 24 กรดอะมิโน จากผลการวิเคราะห์ด้วยโปรแกรม ScanProsite เพื่อหาบริเวณอนุรักษ์ พบว่า C-type lectin มี carbohydrate recognition domain (CRD) จำนวน 1 โดเมน (E-value = 1.18e-12) และพบ conserved cysteine จำนวน 4 ตำแหน่ง คือ Cys58, Cys126, Cys141 และ Cys149 ที่คาดว่าสามารถสร้างพันธะไดซัลไฟด์ภายในโครงสร้างได้ แต่ไม่พบบริเวณจับกับน้ำตาลที่จำเพาะ การผลิตรีคอมบิแนนท์ C-type lectin ในระบบแบคทีเรีย E.coli สายพันธุ์ Rosetta (DE3) โดยใช้เวคเตอร์ 2 ชนิด คือ pET28b และ pET32a ซึ่งทั้ง 2 ระบบเวคเตอร์ พบว่าสามารถผลิตรีคอมบิแนนท์โปรตีนที่มีขนาด 24 กิโลดาลตัน และ 39 กิโลดาลตัน ตามที่คาดไว้ ตามลำดับ แต่ปริมาณโปรตีนที่ได้มีจำนวนน้อยและอยู่ในรูปตะกอน จึงไม่เพียงพอต่อการนำไปทำบริสุทธิ์และศึกษาลักษณะสมบัติได้ และเมื่อนำมาผลิตในระบบยีสต์ก็พบว่ายังไม่สามารถสร้างรีคอมบิแนนท์โปรตีนเลคตินได้ ดังนั้นการผลิตรีคอมบิแนนท์โปรตีนเลคตินจึงยังคงมีความพยายามต่อไป เช่น คัดเลือกแบคทีเรียสายพันธุ์อื่นๆ ที่อาจเหมาะสมในการสร้างรีคอมบิแนนท์โปรตีนเลคติน ผลที่ได้จากการศึกษาครั้งนี้อาจเป็นข้อมูลพื้นฐานสำคัญในการเพิ่มความเข้าใจในระบบภูมิคุ้มกันของกุ้งกุลาดำ ซึ่งอาจนำไปสู่การประยุกต์ใช้เพื่อการพัฒนาและส่งเสริมอุตสาหกรรมการเลี้ยงกุ้งกุลาดำที่ยั่งยืนต่อไป
บทคัดย่อ (EN): C-type lectins are Ca2+ dependent carbohydrate-recognition proteins that play crucial roles in invertebrate innate immunity. The aims of this study are to clone, express and characterize a novel C-type lectin of the black tiger shrimp, Penaeus monodon. A 657-bp open reading frame was found to encode a putative protein comprising 218 amino acids and a signal peptide of 24 amino acids. The deduced amino acid sequence contains a single carbohydrate recognition domain (CRD) and possesses four conserved cysteine residues (Cys58, Cys126, Cys141, Cys149) involved in the formation of disulphide bridges, however, no specific sugar domain was found. The C-type lectin without signal sequence was then cloned in to expression vectors, pET-28b and pET-32a, for a recombinant production in Escherichia coli strain Rosetta (DE3). The result showed the recombinant proteins with molecular mass of 24 and 38 kDa, respectively by SDS–PAGE. However, the proteins were expressed as inclusion bodies in a small amount in both vector systems. Therefore, the production in yeast, Pichia pastoris, was further carried out. Nevertheless, the latter system could not produce the recombinant protein. Consequently, other appropriate expression system needs to be adopted for the protein production. Information from this investigation might provide basic knowledge to understand the function of C-type lectin in shrimp innate immunity and would be helpful for sustainable shrimp aqualculture and disease control.C-type lectins are Ca2+ dependent carbohydrate-recognition proteins that play crucial roles in invertebrate innate immunity. The aims of this study are to clone, express and characterize a novel C-type lectin of the black tiger shrimp, Penaeus monodon. A 657-bp open reading frame was found to encode a putative protein comprising 218 amino acids and a signal peptide of 24 amino acids. The deduced amino acid sequence contains a single carbohydrate recognition domain (CRD) and possesses four conserved cysteine residues (Cys58, Cys126, Cys141, Cys149) involved in the formation of disulphide bridges, however, no specific sugar domain was found. The C-type lectin without signal sequence was then cloned in to expression vectors, pET-28b and pET-32a, for a recombinant production in Escherichia coli strain Rosetta (DE3). The result showed the recombinant proteins with molecular mass of 24 and 38 kDa, respectively by SDS–PAGE. However, the proteins were expressed as inclusion bodies in a small amount in both vector systems. Therefore, the production in yeast, Pichia pastoris, was further carried out. Nevertheless, the latter system could not produce the recombinant protein. Consequently, other appropriate expression system needs to be adopted for the protein production. Information from this investigation might provide basic knowledge to understand the function of C-type lectin in shrimp innate immunity and would be helpful for sustainable shrimp aqualculture and disease control.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
คำสำคัญ: เลคติน
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ราตรี วงศ์ปัญญา. "(ภาษาอังกฤษ) Functional characterization of a novel C-type lectin gene in the black tiger shrimp, Penaeus monodon". มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 2554

ราตรี วงศ์ปัญญา. "(ภาษาอังกฤษ) Functional characterization of a novel C-type lectin gene in the black tiger shrimp, Penaeus monodon". มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 2554. Print.



TARR Wordcloud:
(ภาษาอังกฤษ) Functional characterization of a novel C-type lectin gene in the black tiger shrimp, Penaeus monodon
ราตรี วงศ์ปัญญา
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
30 กันยายน 2554
ผลของการเสริมกลีบดอกดาวเรืองในอาหารต่อความเข้มสีในกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon การศึกษาเบื้องต้นการเลี้ยงพ่อแม่พันธุ์กุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon Fabricius, 1798) รุ่น F5 ในบ่อคอนกรีต อิทธิพลร่วมของอุณหภูมิและความเค็มต่อการตอบสนองทางสรีรวิทยาและยอมรับเชื้อไวรัสตัวแดงดวงขาวในกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon Fabricius, 1798) การทดลองเลี้ยงกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon Fabricius, 1798) ร่วมกับกุ้งแชบ๊วย (Penaeus merguiensis De Man, 1888) และกุ้งขาวแปซิฟิค (Litopenaeus vannamei Boone, 1931) ในบ่อดิน ด้วยระบบน้ำหมุนเวียน การแทนที่ปลาป่นด้วยวัตถุดิบโปรตีนจากพืชที่มีศักยภาพในอาหารสำหรับกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon (Fabricius, 1798) การใช้ Aurantiochytrium limacinum BCC52274 เป็นอาหารสำหรับลูกกุ้งวัยอ่อนของกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon) เพื่อเป็นแหล่งสารอาหารกรดไขมันไม่อิ่มตัวสูง การใช้น้ำนึ่งปลาทูน่าเข้มข้นเป็นสารดึงดูดการกินอาหารที่ใช้พืชเป็นแหล่งโปรตีนหลักสำหรับกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon (Fabricius, 1798) ผลของการใช้โปรตีนไฮโดรไลเสตจากเศษทิ้งกุ้งเพื่อเป็นสารดึงดูดการกินสำหรับการแทนที่ปลาป่นด้วยวัตถุดิบจากพืชในอาหารกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon (Fabricius, 1798) การทดลองเลี้ยงกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon Fabricius, 1978) ตามมาตรฐานการเพาะเลี้ยงกุ้งทะเลระบบอินทรีย์ ประสิทธิภาพการย่อยโปรตีนจากวัตถุดิบโปรตีนจากพืชในกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon (Fabricus, 1798) และปลากะพงขาว Lates calcarifer (Bloch, 1790)
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair