สืบค้นงานวิจัย
การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ
Manasave Dechklar - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ
ชื่อเรื่อง (EN): Molecular cloning and characterization of a cDNA encoding argonaute protein from Penaeus monodon
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Manasave Dechklar
บทคัดย่อ: Argonaute เป็นโปรตีนที่พบในสิ่งมีชีวิตหลายชนิด โปรตีนชนิดนี้ทำหน้าที่หลากหลายทั้งใน กระบวนการเจริญเติบโตและในกระบวนการยับยั้งการแสดงออกของยีนด้วยอาร์เอ็นเอสายคู่ ที่เรียกว่า RNA interference (RNAi) การศึกษาวิจัยนี้เป็นการโคลนยีน Argonaute ของกุ้งกุลาดำ โดยใช้อาร์เอ็น เอซึ่งสกัดจากต่อมน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำในการสังเคราะห์ชิ้น cDNA ด้วยปฎิกิริยา RT-PCR ซึ่งใช้ไพร์ เมอร์ที่ถูกออกแบบจากลำดับของกรดอะมิโนของโปรตีนชนิดนี้ซึ่งมีความคล้ายคลึงกันในสิ่งมีชีวิตชนิด อื่นๆ ชิ้นของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ของกุ้งกุลาดำ (Pem-AGO) มีขนาด 2,829 นิวคลีโอ ไทด์ และลำดับของกรดอะมิโนที่ถอดรหัสจากลำดับนิวคลีโอไทด์ประกอบด้วยลักษณะสำคัญของโปรตีน Argonaute ได้แก่ส่วนอนุรักษ์ที่เรียกว่า PAZ และ PIWI domain การศึกษาหน้าที่ของโปรตีนชนิดนี้ใน กระบวนการ RNAi ได้ใช้วิธีการนำอาร์เอ็นเอสายคู่ที่สังเคราะห์จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของ Argonaute เข้าสู่เซลล์ปฐมภูมิจากต่อมน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำ จากการทดลองพบว่าอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะต่อ Argonaute มีผลทำให้มีการแสดงออกของ Argonaute ในเซลล์ลดลงประมาณ 30% การศึกษาผลกระทบ ของระดับ Argonaute ในเซลล์ ต่อกระบวนการ RNAi ในการยับยั้งการแสดงออกของยีนในกุ้งกุลาดำ พบว่าอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะต่อตัวตอบรับซีโรโตนินสามารถยับยั้งการแสดงออกของยีนสร้างตัวตอบรับ ซีโรโตนินได้ในเซลล์ที่มี Argonaute ในระดับปรกติ ในทางตรงกันข้ามอาร์เอ็นเอสายคู่ของตัวตอบรับซี โรโตนินไม่สามารถยับยั้งการแสดงออกของยีนเป้าหมายได้เมื่อระดับของArgonaute ลดลง อย่างไรก็ตาม การศึกษาทำนองเดียวกันนี้กับยีนที่สร้างโปรตีนของไวรัสหัวเหลือง ไม่เห็นผลที่ชัดเจนของระดับของ Argonaute ในเซลล์ต่อการยับยั้งการแสดงออกของยีนไวรัสหัวเหลืองด้วยอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะ กล่าว โดยสรุปยีนที่สร้าง Argonaute ที่ศึกษาในงานวิจัยนี้ มีความสำคัญต่อกระบวนการยับยั้งการแสดงออก ของยีนด้วยอาร์เอ็นเอสายคู่หรือ RNAi ในเซลล์ของกุ้งกุลาดำ
บทคัดย่อ (EN): Argonaute proteins are present in diverse organisms ranging from yeast to humans. In addition to their role in developmental control, some Argonautes have been shown to play essential roles in a variety of post-transcriptional RNA-mediated gene silencing pathways, including RNA interference or RNAi mediated by sequencespecific double-stranded RNA. This work is aimed at the characterization of an Argonaute that associates with RNAi in the shrimp Penaeus monodon in order to provide an in-depth understanding of the RNA-mediated gene silencing mechanism in the shrimp. A total of 2,829 bp of the cDNA encoding Argonaute of P. monodon (Pem-AGO) was obtained from RT-PCR and RACE methods, using mRNA from the lymphoid (Oka) organ as a template. The deduced amino acid sequence of Pem-AGO contained the two conserved domains, PAZ and PIWI, which are the signature of the Argonaute family. The requirement for Pem-AGO in RNAi was explored in the primary Oka cell culture of P. monodon. Transfection with three dsRNAs corresponding to different regions in the Pem-AGO sequence resulted in approximately 30% reduction of Pem-AGO expression in the Oka cells. The subsequent effect of the depletion in Pem-AGO mRNA level on the efficacy of RNAi was determined by the amount of silencing in the endogenous 5-HT receptor gene by its specific dsRNA. Pem-AGO depletion led to impaired RNAi as demonstrated by partial restoration of 5-HT receptor gene expression in the cells that acquired dsRNAs, which target both the Pem-AGO and 5-HT receptor genes. By contrast, only slight or no impairment of RNAi was seen when the exogenous gene, the protease gene of yellow head virus, was targeted for silencing in Pem-AGO depleted cells. In summary, the results from this study suggest the involvement of Pem-AGO in RNA-mediated gene silencing by RNAi mechanism in P. monodon
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=4591&obj_id=2747
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Penaeus monodon
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: Argonaute เป็นโปรตีนที่พบในสิ่งมีชีวิตหลายชนิด โปรตีนชนิดนี้ทำหน้าที่หลากหลายทั้งใน กระบวนการเจริญเติบโตและในกระบวนการยับยั้งการแสดงออกของยีนด้วยอาร์เอ็นเอสายคู่ ที่เรียกว่า RNA interference (RNAi) การศึกษาวิจัยนี้เป็นการโคลนยีน Argonaute ของกุ้งกุลาดำ โดยใช้อาร์เอ็น เอซึ่งสกัดจากต่อมน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำในการสังเคราะห์ชิ้น cDNA ด้วยปฎิกิริยา RT-PCR ซึ่งใช้ไพร์ เมอร์ที่ถูกออกแบบจากลำดับของกรดอะมิโนของโปรตีนชนิดนี้ซึ่งมีความคล้ายคลึงกันในสิ่งมีชีวิตชนิด อื่นๆ ชิ้นของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ของกุ้งกุลาดำ (Pem-AGO) มีขนาด 2,829 นิวคลีโอ ไทด์ และลำดับของกรดอะมิโนที่ถอดรหัสจากลำดับนิวคลีโอไทด์ประกอบด้วยลักษณะสำคัญของโปรตีน Argonaute ได้แก่ส่วนอนุรักษ์ที่เรียกว่า PAZ และ PIWI domain การศึกษาหน้าที่ของโปรตีนชนิดนี้ใน กระบวนการ RNAi ได้ใช้วิธีการนำอาร์เอ็นเอสายคู่ที่สังเคราะห์จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของ Argonaute เข้าสู่เซลล์ปฐมภูมิจากต่อมน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำ จากการทดลองพบว่าอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะต่อ Argonaute มีผลทำให้มีการแสดงออกของ Argonaute ในเซลล์ลดลงประมาณ 30% การศึกษาผลกระทบ ของระดับ Argonaute ในเซลล์ ต่อกระบวนการ RNAi ในการยับยั้งการแสดงออกของยีนในกุ้งกุลาดำ พบว่าอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะต่อตัวตอบรับซีโรโตนินสามารถยับยั้งการแสดงออกของยีนสร้างตัวตอบรับ ซีโรโตนินได้ในเซลล์ที่มี Argonaute ในระดับปรกติ ในทางตรงกันข้ามอาร์เอ็นเอสายคู่ของตัวตอบรับซี โรโตนินไม่สามารถยับยั้งการแสดงออกของยีนเป้าหมายได้เมื่อระดับของArgonaute ลดลง อย่างไรก็ตาม การศึกษาทำนองเดียวกันนี้กับยีนที่สร้างโปรตีนของไวรัสหัวเหลือง ไม่เห็นผลที่ชัดเจนของระดับของ Argonaute ในเซลล์ต่อการยับยั้งการแสดงออกของยีนไวรัสหัวเหลืองด้วยอาร์เอ็นเอสายคู่ที่จำเพาะ กล่าว โดยสรุปยีนที่สร้าง Argonaute ที่ศึกษาในงานวิจัยนี้ มีความสำคัญต่อกระบวนการยับยั้งการแสดงออก ของยีนด้วยอาร์เอ็นเอสายคู่หรือ RNAi ในเซลล์ของกุ้งกุลาดำ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Manasave Dechklar. "การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำMolecular cloning and characterization of a cDNA encoding argonaute protein from Penaeus monodon". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2549

Manasave Dechklar. "การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำMolecular cloning and characterization of a cDNA encoding argonaute protein from Penaeus monodon". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2549. Print.



TARR Wordcloud:
การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ
Manasave Dechklar
มหาวิทยาลัยมหิดล
2549
การแสดงออกและการศึกษาคุณลักษณะหน้าที่ทางชีวเคมีของโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ การโคลนชิ้น cDNA ของตัวรับ 5-HT จากกุ้งกุลาดำ การสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลือง การศึกษาบทบาทหน้าที่ของตัวตอบรับซีโรโตนินในกุ้งกุลาดำ การศึกษาแหลมสิงห์ไวรัสในเนื้อเยื่อประสาทของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ การผลิตและลักษณะสมบัติของโมโนโคลนอลแอนติบอดีจำเพาะต่อเม็ดเลือดกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon การศึกษาโปรโมเตอร์ที่สามารถทำงานได้ในเซลล์ปฐมภูมิของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ การศึกษาแนวทางการเลี้ยงกุ้งกุลาดำที่ประสบความสำเร็จของเษตรกร จังหวัดฉะเชิงเทรา
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair