สืบค้นงานวิจัย
Draft genome of neurotropic nematode parasite Angiostrongylus cantonensis, causative agent of human eosinophilic meningitis
Yong H.-S. - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Draft genome of neurotropic nematode parasite Angiostrongylus cantonensis, causative agent of human eosinophilic meningitis
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Yong H.-S.
บทคัดย่อ (EN): Angiostrongylus cantonensis is a bursate nematode parasite that causes eosinophilic meningitis (or meningoencephalitis) in humans in many parts of the world. The genomic data from A. cantonensis will form a useful resource for comparative genomic and chemogenomic studies to aid the development of diagnostics and therapeutics. We have sequenced, assembled and annotated the genome of A. cantonensis. The genome size is estimated to be ~260. Mb, with 17,280 genomic scaffolds, 91X coverage, 81.45% for complete and 93.95% for partial score based on CEGMA analysis of genome completeness. The number of predicted genes of ≥300. bp was 17,482. A total of 7737 predicted protein-coding genes of ≥50 amino acids were identified in the assembled genome. Among the proteins of known function, kinases are the most abundant followed by transferases. The draft genome contains 34 excretory-secretory proteins (ES), a minimum of 44 Nematode Astacin (NAS) metalloproteases, 12 Homeobox (HOX) genes, and 30 neurotransmitters. The assembled genome size (260. Mb) is larger than those of Pristionchus pacificus, Caenorhabditis elegans, Necator americanus, Caenorhabditis briggsae, Trichinella spiralis, Brugia malayi and Loa loa, but smaller than Haemonchus contortus and Ascaris suum. The repeat content (25%) is similar to H. contortus. The GC content (41.17%) is lower compared to P. pacificus (42.7%) and H. contortus (43.1%) but higher compared to C. briggsae (37.69%), A. suum (37.9%) and N. americanus (40.2%) while the scaffold N50 is 42,191. This draft genome will facilitate the understanding of many unresolved issues on the parasite and the disorder it causes. © 2015 Elsevier B.V.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เอกสารแนบ (EN): https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-84928741014&doi=10.1016%2fj.actatropica.2015.04.012&partnerID=40&md5=1c5d2eaab56575f0887b3c9f792233ff
เผยแพร่โดย (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Rats
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Yong H.-S.. "Draft genome of neurotropic nematode parasite Angiostrongylus cantonensis, causative agent of human eosinophilic meningitis". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

Yong H.-S.. "Draft genome of neurotropic nematode parasite Angiostrongylus cantonensis, causative agent of human eosinophilic meningitis". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
Draft genome of neurotropic nematode parasite Angiostrongylus cantonensis, causative agent of human eosinophilic meningitis
Yong H.-S.
มหาวิทยาลัยมหิดล
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Complete mitochondrial genome reveals genetic diversity of Angiostrongylus cantonensis (Nematoda: Angiostrongylidae) Cryptic lineage diversity in the zoonotic pathogen Angiostrongylus cantonensis Complete mitochondrial genome of Angiostrongylus malaysiensis lungworm and molecular phylogeny of Metastrongyloid nematodes Cloning and expression of a 16-kDa recombinant protein from Angiostrongylus cantonensis for use in immunoblot diagnosis of human angiostrongyliasis Cytochrome c oxidase subunit I haplotype diversity of Angiostrongylus cantonensis (Nematoda: Angiostrongylidae) Angiostrongylus mackerrasae and A. cantonensis (Nematoda: Metastrongyloidea) belong to same genetic lineage: Evidence from mitochondrial protein-coding genes Molecular phylogeography of Angiostrongylus cantonensis (Nematoda: Angiostrongylidae) and genetic relationships with congeners using cytochrome b gene marker Genetic differences in the rat lungworm, Angiostrongylus cantonensis (Nematoda: Angiostrongylidae), in Thailand Mitochondrial genome supports sibling species of Angiostrongylus costaricensis (Nematoda: Angiostrongylidae) Hurdles in the evolutionary epidemiology of Angiostrongylus cantonensis: Pseudogenes, incongruence between taxonomy and DNA sequence variants, and cryptic lineages
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair