สืบค้นงานวิจัย
การแยกยีน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ depudecin จาก Xylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170
จีรนันท์ กล่อมนรา - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
ชื่อเรื่อง: การแยกยีน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ depudecin จาก Xylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170
ชื่อเรื่อง (EN): Identification of NADPH Cytochrome P450 Oxidoreductase (XyCPR) Involving in Depudecin Biosynthesis Pathway f
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: จีรนันท์ กล่อมนรา
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Cheeranun Klomnara
บทคัดย่อ: รา Xylaria sp. BCC1067 มีความสามารถในการผลิตสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพได้หลายชนิดที่มีศักยภาพในการพัฒนาเป็นสารต้านมะเร็งได้ เช่น depudecin เป็นสารประกอบกลุ่ม polyketide มีคุณสมบัติยับยั้งเอนไซม์ histone deacetylase ในเซลล์มะเร็งได้ ในการศึกษาครั้งนี้ได้ทำการศึกษายีนที่เกี่ยวข้องกับวิธีการสังเคราะห์สาร depudecin โดยการโคลนยีนบางส่วนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์สาร depudecin จากราXylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170 ที่พัฒนาขึ้นโดยเทคนิค DNA mediated tagged mutagenesis ให้มีความบกพร่องในการสังเคราะห์สารนี้ โดยอาศัยเทคนิค partial library และใช้บางส่วนของยีนที่โคลนได้เป็นตัวติดตามหาส่วนที่เหลือของยีนจาก wild type genomic library ของรา Xylaria sp.BCC1067 จากผลการศึกษาสามารถโคลน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่มีขนาด 2,178 คู่เบส สามารถถอดรหัสได้ 713 กรดอะมิโน เมื่อทำการวิเคราะห์โครงสร้างของยีน พบว่าประกอบด้วย 3 domain คือ FAD binding FMN binding และ NADPH binding เป็นที่น่าสังเกตว่า XyCPR มีความเหมือนกับ CPR ในพีชสูงถึง (60-70%) ในขณะที่เหมือนกัน CPR ในราเพียง (30-40%) เมื่อทำการศึกษาหน้าที่ของยีนด้วยเทคนิค gene disruption แล้วเปรียบเทียบความสามารถในการผลิต metabolite ของ type กับ mutant โดยใช้เทคนิค HPLC พบว่า mutant มีการผลิต depudecin ลดลงซึ่งสอดคล้องกับที่คุณสมบัติของสายพันธุ์กลายพันธุ์ T170 ซึ่งแสดงให้เห็นว่า NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] เป็นยีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการสังเคราะห์ depudecin
บทคัดย่อ (EN): The wood-decaying fungus, Xylaria sp. BCC1067 possess the capability of synthesizing various types of bioactive compounds, which could be useful for pharmaceutical development. Among them, a polyketide compound, depudecin, has potential as an anticancer agent with anti-histone deacetylase activity. To understand the biosynthesis pathway of depudecin by studying its biosynthetic gene(s) will provide more information for further pathway modification to generate novel compounds or increase compound activity. In this work, a suitable blocked mutant T170 with defective depudecin production was selected from the DNA mediated tagged mutagenesis Xylaria sp. BCC1067 mutant collection. A DNA fragment, derived from the interrupted gene was cloned from a partial library of mutant T170 and used as probe to screen the full length of the gene in wild type genomic library. The corresponding gene of 2,178 bp, designted XyCPR, was sequenced and analysed, revealing a putative protein of 713 amino acid residues. The XyCPR protein sequence showed high similarity to a range of NADPH cytochrome P450 oxidoreductase (CPR) genes consisting of 3 unique domains: FAD binding, FMN binding and NADPH binding. Interestingly, the gene possesses higher similarity (60 - 70%) to the CPR gene of various plants but less similarity to (30 - 40%) those of fungi. The gene was further studied using gene disruption technique and depudecin production profiles among the disruptant, mutant T170 and wild type were compared by HPLC analysis. The depudecin production profile of the disruptant showed similar pattern to that of the mutant T170, with a decreased in the depudecin production comparing to wildtype strain, suggesting the involvement of XyCPR gene in the depudecin biosynthesis pathway.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=54&RecId=8893&obj_id=25278
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
คำสำคัญ: การกลายพันธุ์
คำสำคัญ (EN): NADPH Cytochrome P450 Oxidoreductase
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
รายละเอียด: The wood-decaying fungus, Xylaria sp. BCC1067 possess the capability of synthesizing various types of bioactive compounds, which could be useful for pharmaceutical development. Among them, a polyketide compound, depudecin, has potential as an anticancer agent with anti-histone deacetylase activity. To understand the biosynthesis pathway of depudecin by studying its biosynthetic gene(s) will provide more information for further pathway modification to generate novel compounds or increase compound activity. In this work, a suitable blocked mutant T170 with defective depudecin production was selected from the DNA mediated tagged mutagenesis Xylaria sp. BCC1067 mutant collection. A DNA fragment, derived from the interrupted gene was cloned from a partial library of mutant T170 and used as probe to screen the full length of the gene in wild type genomic library. The corresponding gene of 2,178 bp, designted XyCPR, was sequenced and analysed, revealing a putative protein of 713 amino acid residues. The XyCPR protein sequence showed high similarity to a range of NADPH cytochrome P450 oxidoreductase (CPR) genes consisting of 3 unique domains: FAD binding, FMN binding and NADPH binding. Interestingly, the gene possesses higher similarity (60 - 70%) to the CPR gene of various plants but less similarity to (30 - 40%) those of fungi. The gene was further studied using gene disruption technique and depudecin production profiles among the disruptant, mutant T170 and wild type were compared by HPLC analysis. The depudecin production profile of the disruptant showed similar pattern to that of the mutant T170, with a decreased in the depudecin production comparing to wildtype strain, suggesting the involvement of XyCPR gene in the depudecin biosynthesis pathway.
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

จีรนันท์ กล่อมนรา. "การแยกยีน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ depudecin จาก Xylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170Identification of NADPH Cytochrome P450 Oxidoreductase (XyCPR) Involving in Depudecin Biosynthesis Pathway f". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2548

จีรนันท์ กล่อมนรา. "การแยกยีน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ depudecin จาก Xylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170Identification of NADPH Cytochrome P450 Oxidoreductase (XyCPR) Involving in Depudecin Biosynthesis Pathway f". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2548. Print.



TARR Wordcloud:
การแยกยีน NADPH cytochrome P450 oxidoreductase [XyCPR] ที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์ depudecin จาก Xylaria sp. BCC1067 สายพันธุ์กลายพันธุ์ T170
จีรนันท์ กล่อมนรา
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
2548
การโคลนยีน polyketide synthase จากรา Xylaria sp. BCC 1067 ผลของ PDJ (n-propyl dihydro jasmonate) ต่อการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการสังเคราะห์ที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการสังเคราะห์แอนโทไซยา แบบจำลองทางคณิตศาสตร์ของผู้ป่วยโรคไข้หวัดนกในประเทศไทยโดยจำแนกตามโครงสร้างอายุและสายพันธุ์ที่มีการกลายพันธุ์ การศึกษาความหลากหลายของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์ reduced polyketides จากราที่แยกได้ในประเทศไทย การโคลนและการแสดงออกของยีนกลูโคสไอโซเมอเรส จาก streptomyces sp.190-1 ใน escherichia coli การศึกษาการถ่ายยีนและการแสดงออกของยีนโปรตีนนมผึ้งในข้าวญี่ปุ่นพันธุ์ Kitaake และข้าวเหนียวพันธุ์ กข 6 การหาลักษณะจำเพาะของยีนเซลลูเลสและไซลาเนสจากแบคทีเรีย ในกระเพาะหมักของวัว การโคลนและการแสดงออกของยีนไคติเนสที่แยกได้จาก Beauveria bassiana ใน Escherichia Coli การศึกษาสัณฐานวิทยา และยีนต้านทานโรคไหม้ของข้าวไร่ภาคเหนือในประเทศไทย ความสัมพันธ์ของยีนคอมพลีเมนต์แฟคเตอร์บีกับลักษณะจำนวนต่อครอกในสุกรสายพันธุ์ทางการค้า
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair