สืบค้นงานวิจัย
การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ
Apiradee Riennukool - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ
ชื่อเรื่อง (EN): Development and conversion of AFLP to scar markers for fast-growing penaeus monodon
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Apiradee Riennukool
บทคัดย่อ: กุ้งกุลาดำเป็นสัตว์น้ำเศรษฐกิจที่มีความสำคัญในประเทศไทย แต่ในการเพาะเลี้ยงกุ้งกุลาดำ ในปัจจุบันนั้นประสบกับปัญหาต่างๆ ที่ส่งผลกระทบต่อปริมาณและคุณภาพของผลผลิต การ ประยุกต์ใช้เทคโนโลยีทางด้านอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์ เพื่อการคัดเลือกพ่อแม่พันธุ์ที่มีลักษณะ สำคัญและเป็นที่ต้องการทางเศรษฐกิจเป็นอีกแนวทางในการแก้ไขปัญหาด้านคุณภาพของกุ้งกุลาดำ ในการวิจัยนี้ได้ใช้เทคนิค AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) มา วิเคราะห์เพื่อพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ และนำ เครื่องหมายพันธุกรรมที่ได้มาพัฒนาต่อเนื่องเป็นเครื่องหมายพันธุกรรมชนิด SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการประยุกต์ใช้เครื่องหมาย พันธุกรรมในการคัดเลือกและพัฒนาสายพันธุ์กุ้งกุลาดำให้มีลักษณะการเจริญเติบโตที่รวดเร็ว จาก การวิเคราะห์ AFLP ในตัวอย่างกุ้งกุลาดำ อายุ 151 วัน ซึ่งถูกแบ่งเป็น 4 กลุ่ม ตามขนาดและเพศ โดยใช้ไพรเมอร์คู่ผสมระหว่าง EcoRI-CNN/MseI-GNN และ EcoRI-TNN/MseI-GNN ทั้งสิ้น 162 คู่ พบเครื่องหมายพันธุกรรม ทั้งสิ้น 56 เครื่องหมาย โดยเป็นเครื่องหมายที่จำเพาะต่อการ เจริญเติบโต 43 เครื่องหมาย จำเพาะต่อเพศเมีย 5 เครื่องหมายและเพศผู้ 8 เครื่องหมาย ซึ่ง เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP 12 เครื่องหมายที่มีความสัมพันธ์กับลักษณะจำเพาะได้ถูกนำมาใช้ใน การพัฒนาเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR จากนั้นจึงนำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้งกุลาดำ และ พบว่าเครื่องหมายพันธุกรรมชนิด SF-E55M47-1 SCAR สามารถตรวจสอบความแตกต่างระหว่าง กุ้งกุลาดำที่มีขนาดใหญ่และขนาดเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 62% ในตัวอย่างดีเอ็นเอกุ้งที่ผ่านขั้นตอน pre-selective amplification แล้ว โดยเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP และ SCAR ที่พัฒนาขึ้นนี้ สามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมของ กุ้งกุลาดำได้ต่อไป
บทคัดย่อ (EN): The black tiger shrimp, Penaeus monodon, is one of the most economically important aquaculture species in Thailand. To overcome a broodstock limitation problem, the application of molecular biology and genetics is a promising method. In this project, the AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) technique was used to generate genetic markers that are specific to fast-growth and sex traits in P. monodon, and the identified AFLPs were converted to SCAR markers. A total of 162 primer combinations of EcoRI-CNN/MseI-GNN and EcoRITNN/ MseI-GNN were used to screen 151-day old shrimp which were classified into 4 different groups according to their weight and sex, resulting in 56 polymorphic loci that were identified from 39 primer pairs. Of these, 29 markers were derived from large shrimp, 14 from small shrimp, and 5 and 8 from female and male shrimp respectively. Within the 56 identified AFLP markers, 12 markers showed correlation between phenotype and genotype of greater than 50% when tested with 24 individual samples which had extreme phenotype and were used to construct the pooled DNA samples. These 12 AFLPs were converted to SCAR markers and the results showed that the SF-E55M47-1 SCAR marker generated a polymorphism that was specific to the growth trait with about 62% accuracy of phenotype prediction in pre-amplification products of the extreme phenotype samples. The genetic markers, AFLPs and SCARs, in this project will be applicable in constructing genetic linkage maps of P. monodon in the future.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=278&obj_id=4363
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Penaeus monodon
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: กุ้งกุลาดำเป็นสัตว์น้ำเศรษฐกิจที่มีความสำคัญในประเทศไทย แต่ในการเพาะเลี้ยงกุ้งกุลาดำ ในปัจจุบันนั้นประสบกับปัญหาต่างๆ ที่ส่งผลกระทบต่อปริมาณและคุณภาพของผลผลิต การ ประยุกต์ใช้เทคโนโลยีทางด้านอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์ เพื่อการคัดเลือกพ่อแม่พันธุ์ที่มีลักษณะ สำคัญและเป็นที่ต้องการทางเศรษฐกิจเป็นอีกแนวทางในการแก้ไขปัญหาด้านคุณภาพของกุ้งกุลาดำ ในการวิจัยนี้ได้ใช้เทคนิค AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) มา วิเคราะห์เพื่อพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ และนำ เครื่องหมายพันธุกรรมที่ได้มาพัฒนาต่อเนื่องเป็นเครื่องหมายพันธุกรรมชนิด SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) เพื่อเพิ่มประสิทธิภาพในการประยุกต์ใช้เครื่องหมาย พันธุกรรมในการคัดเลือกและพัฒนาสายพันธุ์กุ้งกุลาดำให้มีลักษณะการเจริญเติบโตที่รวดเร็ว จาก การวิเคราะห์ AFLP ในตัวอย่างกุ้งกุลาดำ อายุ 151 วัน ซึ่งถูกแบ่งเป็น 4 กลุ่ม ตามขนาดและเพศ โดยใช้ไพรเมอร์คู่ผสมระหว่าง EcoRI-CNN/MseI-GNN และ EcoRI-TNN/MseI-GNN ทั้งสิ้น 162 คู่ พบเครื่องหมายพันธุกรรม ทั้งสิ้น 56 เครื่องหมาย โดยเป็นเครื่องหมายที่จำเพาะต่อการ เจริญเติบโต 43 เครื่องหมาย จำเพาะต่อเพศเมีย 5 เครื่องหมายและเพศผู้ 8 เครื่องหมาย ซึ่ง เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP 12 เครื่องหมายที่มีความสัมพันธ์กับลักษณะจำเพาะได้ถูกนำมาใช้ใน การพัฒนาเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR จากนั้นจึงนำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้งกุลาดำ และ พบว่าเครื่องหมายพันธุกรรมชนิด SF-E55M47-1 SCAR สามารถตรวจสอบความแตกต่างระหว่าง กุ้งกุลาดำที่มีขนาดใหญ่และขนาดเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 62% ในตัวอย่างดีเอ็นเอกุ้งที่ผ่านขั้นตอน pre-selective amplification แล้ว โดยเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP และ SCAR ที่พัฒนาขึ้นนี้ สามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมของ กุ้งกุลาดำได้ต่อไป
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ
Apiradee Riennukool
มหาวิทยาลัยมหิดล
2548
การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายติดภายในและการประมาณค่าอัตราพันธุกรรมต่อการเติบโตของกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon Fabricius, 1798 โดยวิธี Full-sib analysis การสืบค้นเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่จำเพาะต่อเพศในกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon โดยการวิเคราะห์ด้วยเอเอฟแอลพี ผลของปริมาณฟอสฟอรัสในอาหารต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon) ที่เลี้ยงในบ่อดินระบบความเค็มต่ำ การเจริญเติบโตและพัฒนาการของข้าวเหนียวก่าและการสร้างแบบจาลองการเจริญเติบโต อิทธิพลของความเค็มระดับต่ำที่มีการเจริญเติบโตอัตราการรอดตายและสรีรวิทยาการหายใจของลูกกุ้งกุลาดำวัยอ่อน (penaeus monodon fabricius) การศึกษาบทบาทหน้าที่ของตัวตอบรับซีโรโตนินในกุ้งกุลาดำ การประมาณค่าพารามิเตอร์ทางพันธุกรรมและการค้นหาเครื่องหมาย ดีเอ็นเอไมโครแซทเทลไลท์ที่เกี่ยวข้องกับลักษณะการเจริญเติบโต ของกุ้งกุลาด า (Penaeus monodon Fabricius) การย่อยสลายของเสียบางชนิดในบ่อเลี้ยงกุ้งกุลาดำแบบพัฒนาโดยกลุ่มแบคทีเรีย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก