สืบค้นงานวิจัย
การตรวจสอบยีนควบคุมความหอมของข้าวด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเวลาจริง
สมทรง โชติชื่น - กรมการข้าว
ชื่อเรื่อง: การตรวจสอบยีนควบคุมความหอมของข้าวด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเวลาจริง
ชื่อเรื่อง (EN): Detection of fragrant gene in rice by real-time PCR
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: สมทรง โชติชื่น
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Somsong Chotechuen
บทคัดย่อ: ข้าวหอมเป็นกลุ่มข้าวเฉพาะที่มีราคาสูงในตลาดการค้าข้าวโลก ลักษณะความหอมจึงเป็นเป้าหมายสำคัญของการผลิตและการปรับปรุงพันธุ์ ยีนควบคุมความหอมของข้าวเป็นยีนด้อยอยู่บนโครโมโซม 8 มีลำดับเบสตรงกับยีนที่สร้างเอ็นไซม์ betaine aldehyde dehydrogenase (BADH2) โดย exon 7 เกิด 8 bp deletion จึงมีการสะสมของสาร 2-acetyl-1-pyrroline (2AP) ในการทดลองนี้ได้ทำการทดสอบ BADEX7-5 primer ซึ่งเฉพาะเจาะจงต่อยีนควบคุมความหอมของข้าว (badh2) ด้วยวิธี PCR แบบดั้งเดิม และวิธี Real-time PCR พบว่าได้ PCR product ของข้าวหอมและไม่หอมขนาด 95 และ 103 bp ตามลำดับ เมื่อวิเคราะห์ High Resolutions Melting พบว่าข้าวหอมและไม่หอมให้ค่า Tm ต่างกันประมาณ 1 องศาเซลเซียส อย่างชัดเจน การทดลองสามารถปรับสภาพการทำปฏิกิริยา Real-time PCR ที่เหมาะสมจนถึงปริมาตร 10 ไมโครลิตร เมื่อนำวิธีการนี้มาใช้ตรวจสอบข้าวจากศูนย์ปฏิบัติการและเก็บเมล็ดเชื้อพันธุ์ข้าวแห่งชาติที่มีคำว่า “หอม” อยู่ในชื่อพันธุ์ จำนวน 339 พันธุ์ พบว่า มีทั้งข้าวหอมและไม่หอม โดยกลุ่มข้าวหอมมีจำนวน 243 พันธุ์ และกลุ่มข้าวไม่หอมมีจำนวน 96 พันธุ์ วิธี Real-time PCR สามารถทำได้รวดเร็ว แม่นยำ และทำได้จำนวนมาก (high-throughput) ดังนั้นจึงอาจประยุกต์ใช้วิธีนี้มาค้นหายีนควบคุมความหอมของเชื้อพันธุกรรมข้าว ในศูนย์ปฏิบัติการและเก็บเมล็ดเชื้อพันธุ์ข้าวแห่งชาติ
บทคัดย่อ (EN): Aromatic rice is a specific group of rice having high price in the world rice market. Fragrant trait is therefore included in the principal goal for rice production and improvement. A recessive gene on chromosome 8 has been elucidated to be homology with the gene encoded for betaine aldehyde dehydrogenase (BADH2). In fragrant rice this gene was mutated by 8 bp deletion in exon 7 resulting in accumulation of 2-acetyl-1-pyrroline (2AP). In this study, BADEX7-5 primer which is specific for fragrant gene (badh2) was tested by conventional PCR and Real-time PCR. Both methods showed the same PCR product size of 95 and 103 bp in fragrant and non-fragrant rice, respectively. High Resolutions Melting analysis demonstrated that the fragrant and non-fragrant rice were clearly separated by 1 oC difference in Tm. Further experiment could validate the Real-time PCR condition and components at 10 µl reaction mixture. The method was applied to detect rice varieties containing “Hom” in their names from the National Rice Seed Storage Laboratory for Genetic Resources. The total of 339 tested accessions was found to have two genotypes including 243 accessions of fragrant rice and 96 accessions of non-fragrant rice. Real-time PCR is a high-throughput method and can be used to survey fragrant genotype in rice.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://anchan.lib.ku.ac.th/agnet/bitstream/001/5685/1/2555C-PCR-OP02-p.13-25.pdf
เผยแพร่โดย: กรมการข้าว
คำสำคัญ: ศูนย์ปฏิบัติการและเก็บเมล็ดเชื้อพันธุ์ข้าวแห่งชาติ
คำสำคัญ (EN): Genotype
เจ้าของลิขสิทธิ์: กรมการข้าว
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สมทรง โชติชื่น. "การตรวจสอบยีนควบคุมความหอมของข้าวด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเวลาจริงDetection of fragrant gene in rice by real-time PCR". กรมการข้าว. ม.ป.ป.

สมทรง โชติชื่น. "การตรวจสอบยีนควบคุมความหอมของข้าวด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเวลาจริงDetection of fragrant gene in rice by real-time PCR". กรมการข้าว. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
การตรวจสอบยีนควบคุมความหอมของข้าวด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเวลาจริง
สมทรง โชติชื่น
กรมการข้าว
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
กรมการข้าว
การตรวจสอบยีนควบคุมความหอมของข้าว ด้วยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบเวลาจริง เปรียบเทียบความเข้มข้นของปริมาณดีเอ็นเอที่สกัดจากเลือดโคในการตรวจแยกเพศ ด้วยวิธี PCR โดยใช้ TSPY GENE ผลของการใช้รังสีแกมมาต่อคุณภาพของข้าว ศึกษาชีววิธีในการควบคุมปริมาณจุลินทรีย์วิบริโอด้วยจุลินทรีย์บาซิลลัสในห้องปฏิบัติการ การพัฒนาการถ่ายยีนเข้าสู่ข้าวโดยวิธี floral dip ปฏิกิริยาของถั่วเขียวสายพันธุ์ต่าง ๆ ต่อไอโซเลท (isolate) ของเชื้อ Cercospora canescens ผลการตอบสนองต่อความเครียดจากปฏิกิริยาออกซิเดชั่นที่เกิดจากความเค็มในสายพันธุ์ต่าง ๆ ของข้าวไทย การวิเคราะห์การทำงานของยีนที่ใช้ในการสังเคราะห์สารเคอร์คูมินอยด์ในขมิ้นชันโดย RNA interference การแข่งขันระหว่างข้าวกับวัชพืชจากการใส่ปุ๋ยรองพื้นระยะเวลาต่างๆ ในนาหว่านข้าวแห้ง โรคไหม้ในข้าวและสถานการณ์ปัจจุบันของงานวิจัยด้านยีนต้านทานโรคไหม้ในข้าว
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair