สืบค้นงานวิจัย
วิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ ในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์
พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข - กรมประมง
ชื่อเรื่อง: วิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ ในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์
ชื่อเรื่อง (EN): Microsatellite-based analysis of genetic variation among different hatchery stocks of barramundi, Lates calcarifer (Bloch, 1790)
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Panom K. Sodsuk
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. กรมประมง
บทคัดย่อ: ดำเนินการวิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์ 5 ประชากร คือ ประชากรพ่อแม่พันธุ์ของศูนย์วิจัยและพัฒนาประมงชายฝั่งกระบี่ ตรัง นครศรีธรรมราช และระยอง และประชากรลูกพันธุ์กระบี่ โดยใช้เทคนิคเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ จากการวิเคราะห์ที่จำนวน 12 ไมโครแซทเทลไลท์โลไซ พบความหลากหลายของยีนอัลลีลสูงสุด 13 อัลลีล ที่โลกัส LcaM27F (AF404089) และพบว่าโลกัส LcaM06 (AF404075) เป็น monomorphic ข้อมูลความแปรปรวนหรือความหลากหลายทางพันธุกรรม ซึ่งประกอบด้วยค่าเฉลี่ยต่อโลกัสต่อประชากรของจำนวนอัลลีล (Na), effective number of alleles (Ae), allelic richness (R) และเฮตเตอโรไซโกซิตีในรูปค่าสังเกต (Ho) และค่าคาดคะเน (He) มีค่า Na = 4.0000 – 4.9167, Ae = 2.5567 – 3.0947, R = 3.4510 – 3.8841, Ho = 0.5627 – 0.6278 และ He = 0.5391 – 0.6092 ตามลำดับ ผลการวิเคราะห์รวมทุกโลไซ (12 โลไซ) ระบุว่าบางประชากรมีการเบี่ยงเบนจากสมดุลฮาร์ดีไวน์เบิร์ก (PHWE>0.05) ขณะที่ปริมาณความแปรปรวนทางพันธุกรรมที่วิเคราะห์ได้อยู่ในระดับเดียวกันทั้ง 5 ประชากร และอยู่ในระดับต่ำกว่าที่เคยมีการศึกษาในปลากะพงขาวของไทย ไม่ว่าจะเป็นในประชากรธรรมชาติ หรือประชากรเพาะเลี้ยง การวิเคราะห์โครงสร้างความสัมพันธ์ทางพันธุกรรม และผลการวิเคราะห์ความแตกต่างระหว่างประชากร ระบุว่าทั้ง 5 ประชากรมีพันธุกรรมอยู่ในกลุ่มเดียวกันโดยมีความแตกต่างทางพันธุกรรมระหว่างประชากรภายในกลุ่มเดียวกันนั้น และจากการวิเคราะห์ความแตกต่างในทุกคู่ประชากร ผนวกกับข้อมูลพันธุ์ประวัติของแต่ละประชากร ทำให้ทราบความแตกต่างระหว่างประชากรโดยละเอียด และเข้าใจถึงสาเหตุที่ประชากรมีการเปลี่ยนแปลงในองค์ประกอบทางพันธุกรรม จากผลการศึกษาที่ระบุว่าความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์ 5 ประชากรมีปริมาณต่ำกว่าในประชากรธรรมชาติ จึงสมควรสร้างประชากรพ่อแม่พันธุ์เพื่อยกระดับความหลากหลายทางพันธุกรรมให้สูงขึ้น และมีคุณภาพทางพันธุกรรมที่สมบูรณ์สำหรับการเพาะเลี้ยงในประเทศไทย คำสำคัญ : ปลากะพงขาว ความแปรปรวนทางพันธุกรรม ไมโครแซทเทลไลท์
บทคัดย่อ (EN): Genetic variation based on microsatellite markers was comparatively analysed among 5 hatchery populations of Asian seabass, Lates calcarifer (BLOCH, 1790). Four samples were from the broodstocks of Krabi, Trang, Nakhon Si Thammarat and Rayong Coastal Fisheries Research and Development Center, and one sample from the Krabi progeny population. On the 12 microsateliite loci screened, LcaM27F (AF404089) was found to be the most polymorphic locus with 13 variant alleles, while only the locus LcaM06 (AF404075) was found to be monomorphic. Genetic variabilities including per locus and population averages of number of averaged alleles (Na), effective number of alleles (Ae), allelic richness (R), observed heterozygosity (Ho) and expected heterozygosity (He) were respectively as Na = 4.0000 – 4.9167, Ae = 2.5567 – 3.0947, R = 3.4510 – 3.8841, Ho = 0.5627 – 0.6278 and He = 0.5391 – 0.6092. Deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (PHWE>0.05) were found in some populations when the analyses were done over all loci. However, the amounts of genetic variation observed in the 5 populations were in the same level, and were lower than the level of wild and hatchery populations in Thailand reported by previous studies. The relative analyses of genetic structure and differences between populations showed that the 5 populations were genetically in the same group, with genetic differences between the populations within this group. Results from the analyses in each pair of populations together with the populations descriptive information made understanding in details of the populations and their genetic composition changes. Due to genetic diversity level in the 5 hatchery populations of Asian seabass resulting from this study lower than the wild level, a recommendation is that broodstock populations of Asian seabass should be founded with higher level of genetic diversity to obtain the good quality and high potential broodstock for Thai aquaculture. Key words: Asian seabass (Lates calcarifer), genetic variation, microsatellite
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: https://www.thaiscience.info/Journals/Article/TJOG/10890074.pdf
เผยแพร่โดย: กรมประมง
คำสำคัญ: ความหลากหลายทางพันธุกรรม
คำสำคัญ (EN): genetic diversity
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข. "วิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ ในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์Microsatellite-based analysis of genetic variation among different hatchery stocks of barramundi, Lates calcarifer (Bloch, 1790)". กรมประมง. 2554

พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข. "วิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ ในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์Microsatellite-based analysis of genetic variation among different hatchery stocks of barramundi, Lates calcarifer (Bloch, 1790)". กรมประมง. 2554. Print.



TARR Wordcloud:
วิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ ในประชากรปลากะพงขาวจากแหล่งเพาะพันธุ์
พนม กระจ่างพจน์ สอดศุข
กรมประมง
31 ธันวาคม 2554
กรมประมง
วิเคราะห์เปรียบเทียบความแปรปรวนทางพันธุกรรมโดยเครื่องหมายพันธุกรรมอัลโลไซม์ในพันธุ์ปลาช่อนจาก 3 แหล่งเพาะเลี้ยง ความแปรปรวนทางพันธุกรรมในประชากรปลายี่สกเทศของไทยที่มาจากการเพาะเลี้ยง ปรับปรุงพันธุ์ และแหล่งน้ำธรรมชาติ โครงการฝึกอบรมและถ่ายทอดเทคโนโลยีการเพาะเลี้ยงปลากะพงขาว การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรปลาพลวงหินในประชากรธรรมชาติ บริเวณแม่น้ำน่าน โดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์เพื่อศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของปลาท้องถิ่นบางชนิดในแม่น้ำน่าน การใช้ข้อมูลจากเครื่องหมายพันธุกรรมเพื่อพัฒนาการเพาะเลี้ยงปลาหมอไทย ตรวจประเมินความแปรปรวนทางพันธุกรรมในประชากรพ่อแม่พันธุ์ปลานิลของศูนย์วิจัยและพัฒนาพันธุกรรมสัตว์น้ำ 5 แห่ง การทดสอบยืนยันเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ในปูม้าโดยใช้วิเคราะห์ระหว่างพ่อ-แม่-ลูก การตรวจสอบความแปรปรวนทางพันธุกรรมของพันธุ์ข้าวขาวดอกมะลิ 105 ด้วยเครื่องหมายโมเลกุล การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซททัลไลท์ และการทดสอบยืนยันโดยใช้วิเคราะห์ระหว่างพ่อ-แม่-ลูก ในกุ้งก้ามกราม
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair