สืบค้นงานวิจัย
AP4 method for two-tube nested PCR detection of AHPND isolates of Vibrio parahaemolyticus
Dangtip S. - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): AP4 method for two-tube nested PCR detection of AHPND isolates of Vibrio parahaemolyticus
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Dangtip S.
บทคัดย่อ (EN): Our previous work on the mechanism of virulence for the unique isolates of Vibrio parahaemolyticus that cause acute hepatopancreatic necrosis disease (VPAHPND) revealed that it was mediated by a binary Pir-like toxin pair ToxA and ToxB. These toxins are located on the pVA plasmid, a plasmid carried by AHPND-causing strain of V. parahaemolyticus with a size of approximately 69 kbp. Using the coding sequences of ToxA, a one-step PCR detection method for VPAHPND was introduced in June 2014 but had the limitation that attempts to adapt it into a nested PCR protocol were unsuccessful. As a result, low levels of VPAHPND in shrimp or other samples could not be detected without first preparing an enrichment broth culture to allow bacterial growth before extraction of template DNA. Here, we describe the AP4 (abbreviation of AHPND detection version 4) method, a two-tube nested PCR method that targets the tandem genes ToxA and ToxB, including the 12 bp spacer that separates them on pVA plasmid. Testing of the method revealed that it gave 100% positive and negative predictive values for VPAHPND using a panel of 104 bacterial isolates including 51 VPAHPND isolates and 53 non-AHPND isolates, the latter including 34 isolates of V. parahaemolyticus and 19 isolates of other bacteria found in shrimp ponds, including other Vibrio species. The AP4 nested PCR method was 100 times more sensitive (100 fg total DNA template) than the one-step AP3 (10 pg total DNA template) method, and it could detect VPAHPND in experimentally challenged shrimp by 6 h post immersion (n = 2/3), while AP3 could not detect is until 12 h post immersion (n = 1/3). Thus, the AP4 method may be useful in detecting VPAHPND isolates in samples where target material is limited (e.g., small tissue quantity or archived DNA) and enrichment cannot be employed (i.e., frozen samples or samples preserved in alcohol). © 2015 The Authors.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เอกสารแนบ (EN): https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-84946551221&doi=10.1016%2fj.aqrep.2015.10.002&partnerID=40&md5=0abf39c0541426e37ed0bd19f0fe51eb
เผยแพร่โดย (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Toxin
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Dangtip S.. "AP4 method for two-tube nested PCR detection of AHPND isolates of Vibrio parahaemolyticus". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

Dangtip S.. "AP4 method for two-tube nested PCR detection of AHPND isolates of Vibrio parahaemolyticus". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
AP4 method for two-tube nested PCR detection of AHPND isolates of Vibrio parahaemolyticus
Dangtip S.
มหาวิทยาลัยมหิดล
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Characterization and PCR detection of binary, pir-like toxins from vibrio parahaemolyticus isolates that cause acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) in shrimp Development of laboratory test for differentiation of Dengue, Chikungunya and Zika viruses by multiplex real-time RT-PCR method Development of monoclonal antibodies specific to ToxA and ToxB of Vibrio parahaemolyticus that cause acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) Variation in Vibrio parahaemolyticus isolates from a single Thai shrimp farm experiencing an outbreak of acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) ความไวต่อยาต้านจุลชีพและสภาวะการดื้อยาของเชื้อ Vibrio parahaemolyticus จากกุ้งทะเลที่เป็นโรคและแหล่งน้ำธรรมชาติในพื้นที่เลี้ยงกุ้งทะเลจังหวัดสงขลา PirA & B toxins discovered in archived shrimp pathogenic Vibrio campbellii isolated long before EMS/AHPND outbreaks Vibrio parahaemolyticus and Its Specific Bacteriophages as an Indicator in Cockles (Anadara granosa) for the Risk of V. parahaemolyticus Infection in Southern Thailand Protein extract from red seaweed Gracilaria fisheri prevents acute hepatopancreatic necrosis disease (AHPND) infection in shrimp Development of Zika virus detection method by real time RT-PCR for using in Thailand Emergence of tilapia lake virus in Thailand and an alternative semi-nested RT-PCR for detection
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair