สืบค้นงานวิจัย
การตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยโดย microsatellite markers
ณชัย ศราธพันธุ์ - กรมปศุสัตว์
ชื่อเรื่อง: การตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยโดย microsatellite markers
ชื่อเรื่อง (EN): Parentage testing in Thai swamp buffaloes by microsatellite markers
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ณชัย ศราธพันธุ์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Nachai Sarataphan
บทคัดย่อ: การตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยโดย microsatellite markers ณชัย ศราธพันธุ์1 กัลยา เก่งวิกย์กรรม1 สายใจ ชื่นสุข1 ณัฐนันท์ ศิริรัตนธัญญะกุล1 บทคัดย่อ การศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์ เพื่อประเมินผลชุดตรวจเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์ที่เหมาะสมสำหรับตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกกระบือปลักไทย ได้ทำการทดสอบเครื่องหมายไมโคร แซทเทิลไลท์จำนวน 10 เครื่องหมายในตัวอย่างที่ทำการศึกษาจำนวน 195 ตัวอย่าง ประกอบด้วยพ่อกระบือ 23 ตัว แม่กระบือ 67 ตัว ลูกกระบือ 87 ตัว และกระบือที่ไม่มีความสัมพันธ์ทางสายเลือดอีก 18 ตัว ดีเอ็นเอของแต่ละตัวอย่างถูกนำมาเพิ่มจำนวนชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่จำเพาะต่อเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์ ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสแบบมัลติเพลกซ์ 2 ชุด และหาขนาดชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่ได้ (อัลลิล) โดยการแยกด้วยเครื่องหาลำดับเบส ประเมินผลที่ได้ในแต่ละเครื่องหมาย ได้แก่ จำนวนอัลลิล ความถี่ของอัลลิล ค่าความผันแปร ค่าเฮทเทอโรซัยกัสจากการสังเกต จากการคำนวณ และค่าความน่าจะเป็น ผลการวิเคราะห์พบว่า ในแต่ละเครื่องหมายได้อัลลิลจำนวน 5 ถึง 29 อัลลิล ซึ่งมีค่าเฉลี่ยเท่ากับ 16.3 อัลลิล อัลลิลที่ได้มีขนาดอยู่ระหว่าง 110 ถึง 264 คู่เบส ค่าความผันแปรมีค่าสูง (> 0.7) พบใน 9 เครื่องหมาย คิดเป็นค่าเฉลี่ยเท่ากับ 0.811 ค่าเฮทเทอโรซัยกัสจากการสังเกต และจากการคำนวณ มีค่าเฉลี่ยเท่ากับ 0.762 และ 0.834 เมื่อทำการประเมินผลชุดตรวจเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์ทั้ง 10 เครื่องหมาย ได้แก่ INRA006, CSSM47, RM004, BM1706, MAF65, CSSM38, CSSM42, CSSM19, D5S2 และ INRA189 จากตัวอย่างดีเอ็นเอกระบือปลักไทย 195 ตัวอย่าง พบว่ามีค่าความน่าจะเป็นในการตรวจอัตลักษณ์เท่ากับ 1.0000 เมื่อใช้ชุดตรวจเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์ จำนวนตั้งแต่ 7-10 เครื่องหมาย อย่างไรก็ตาม มีค่าความน่าจะเป็นในการตรวจความสัมพันธ์ระหว่าง พ่อ-แม่-ลูกเท่ากับ 0.9951, 0.9983, 0.9992 และ 0.9995 เมื่อใช้ชุดตรวจเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์ จำนวน 7, 8, 9 และ 10 เครื่องหมาย ตามลำดับ ดังนั้น การใช้ชุดตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยด้วยเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์จำนวน 10 เครื่องหมาย จึงเหมาะสมสำหรับทดสอบอัตลักษณ์ และความเป็นพ่อ-แม่-ลูกกระบือปลักไทย คำสำคัญ : เครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์ ความเป็นพ่อ-แม่-ลูก กระบือปลักไทย เลขทะเบียนวิจัย : 52(1)-0208-079 1 สำนักเทคโนโลยีชีวภาพการผลิตปศุสัตว์ กรมปศุสัตว์ ต. บางกะดี อ. เมือง จ. ปทุมธานี 12000
บทคัดย่อ (EN): Parentage Testing in Thai Swamp Buffaloes by Microsatellite Markers Nachai Sarataphan1 Kalaya Kengvikkum1 Saijai Cheunsuk1 Nattanan Sirirattanatanyakul1 The aim of this study was to evaluate a suitable panel of microsatellite markers for parentage verification in Thai swamp buffaloes. Ten markers were tested in 195 Thai swamp buffaloes (23 sires, 67 dams, 87 offspring and 18 unrelated buffaloes), which represented different family structures with known and unknown parents information. Each DNA sample was amplified in two panels of microsatellite loci by multiplex polymerase chain reaction. The size of amplified DNA fragments was measured by automated DNA sequencer. The markers were first evaluated based on the number of alleles, allele frequency, polymorphic information content (PIC), observed heterozygosity (HO), expected heterozygosity (He) and individual exclusion probability (EP). The allele size ranged from 110 to 264 bp. The means of Ho and He were 0.762 and 0.834, respectively. Nine out of ten microsatellite loci revealed relatively high PIC (> 0.7) with mean 0.811. Ten microsatellite markers namely INRA006, CSSM47, RM004, BM1706, MAF65, CSSM38, CSSM42, CSSM19, D5S2 and INRA189 were tested from 195 buffalo’s DNA samples. The result revealed that the combined exclusion probability (CEP) of 7-10 microsatellite loci was 1.0000 for identity testing. However, the CEP of 7, 8, 9 and 10 microsatellite markers were 0.9951, 0.9983, 0.9992 and 0.9995, respectively. In conclusion, the suitable panel of microsatellite markers for identity and parentage verification in Thai swamp buffaloes was 10 microsatellite markers. Keywords: Microsatellite markers, parentage, Thai swamp buffalo Registered No. : 52(1)-0208-079 1 Bureau of Biotechnology in Livestock Production, Department of Livestock Development, Bang Kadi, Muang, Pathumthani 12000
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: กรมปศุสัตว์
คำสำคัญ: ลูกกระบือปลักไทย
คำสำคัญ (EN): Thai swamp buffalo
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ณชัย ศราธพันธุ์. "การตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยโดย microsatellite markersParentage testing in Thai swamp buffaloes by microsatellite markers". กรมปศุสัตว์. 2553

ณชัย ศราธพันธุ์. "การตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยโดย microsatellite markersParentage testing in Thai swamp buffaloes by microsatellite markers". กรมปศุสัตว์. 2553. Print.



TARR Wordcloud:
การตรวจความเป็นพ่อ-แม่-ลูกในกระบือปลักไทยโดย microsatellite markers
ณชัย ศราธพันธุ์
กรมปศุสัตว์
30 กันยายน 2553
กรมปศุสัตว์
ความสำคัญของปลักต่อสวัสดิภาพของกระบือปลัก การประมาณค่าทางพันธุกรรมของลักษณะความสมบูรณ์พันธุ์ในกระบือปลักไทย การโคลนและศึกษาคุณลักษณะของ interferon-gamma จากกระบือปลักของไทย ประสิทธิภาพการผลิตกระบือปลักและกระบือแม่น้ำสายพันธุ์เมซานา การให้ผลผลิตของแม่กระบือและทัศนคติของเกษตรกรต่อพ่อพันธุ์กระบือของกรมปศุสัตว์: กรณีศึกษาในพื้นที่ภาคตะวันออกเฉียงเหนือตอนล่าง การพัฒนาพ่อแม่พันธุ์ลูกผสมที่หนึ่งของพริกเผ็ด การศึกษาการเลี้ยงปลาพลวงหินในบ่อซีเมนต์เพื่อเป็นพ่อแม่พันธุ์ การประเมินพ่อและแม่พันธุ์เพื่อการผลิตลูกผสมชั่วที่ 1 ของผักกาดเขียวปลี การพัฒนาชุดตรวจสอบความเป็นพ่อแม่ลูกโค ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์ เพื่อเพิ่มความเชื่อมั่น การศึกษาการหย่านมลูกโคพันธุ์อเมริกันบราห์มันแดงที่อายุ 3, 4, 5 และ 7 เดือน เพื่อลดช่วงห่างการให้ลูกของแม่โค
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair