สืบค้นงานวิจัย
การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้า
สุวรรณา ผลใหม่ - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลศรีวิชัย
ชื่อเรื่อง: การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้า
ชื่อเรื่อง (EN): Construction of Genetic Linkage map for relationship with tail patterns in guppy (Poecilia reticulata) for improvement in commercialized guppy
บทคัดย่อ: การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้า สุวรรณา ผลใหม่1 สุวิทย์ วุฒิสุทธิเมธาวี2 และสุไหลหมาน หมาดโหยด3 บทคัดย่อ การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้า โดยมีขั้นตอนการดำเนินการ 2 ขั้นตอนคือ (1) การวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของปลาหางนกยูง และ (2) การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่ที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง โดยคัดเลือกปลาหางนกยูงจำนวน 5 สายพันธุ์ที่มีรูปแบบหางต่างกัน คือ Spear tail (แบบจอบ) Round tail (หางกลม) Top sword tail (หางดาบเดี่ยวข้างบน) Double sword tail (หางกรรไกร) และ Swallow fin (หางเป็นริ้ว) ซึ่งเทคนิคทาง ชีวเมโลกุลที่ใช้ในการศึกษาครั้งนี้ คือเทคนิคการวิเคราะห์ดีเอ็นเอ AFLP จำนวน 10 คู่ไพรเมอร์ วิเคราะห์แถบดีเอ็นเอที่มีขนาดระหว่าง 100-500 คู่เบส พบแถบดีเอ็นเออยู่ระหว่าง 43-98 แถบ ดีเอ็นเอต่อคู่ไพรเมอร์ มีจำนวนแถบดีเอ็นเอที่แสดงความแตกต่างอยู่ระหว่าง 15-77 แถบดีเอ็นเอ คิดเป็นค่าเปอร์เซ็นต์ polymorphism อยู่ระหว่าง 34.9-87.6 เปอร์เซ็นต์ เมื่อวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมโดยวิธี UPGMA ด้วยโปรแกรม NTSYSpc version 2.0 พบว่าสายพันธ์ปลาหางนกยูงทั้ง 5 สายพันธุ์มีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมใกล้ชิดกันซึ่งมีค่าระหว่าง 70-78 เปอร์เซ็นต์ และเมื่อจัดกลุ่มตามความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมสามารถแบ่งออกเป็น 3 กลุ่มคือ กลุ่มที่1 ประกอบด้วยลักษณะหางแบบ Round tail กับ Top sword tail กลุ่มที่ 2 ประกอบด้วยรูปแบบหาง Double sword tail กับ Swallow fin และกลุ่มที่ 3 ลักษณะหางแบบ Spear tail และการสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง โดยการผสมพันธุ์ระหว่างพ่อพันธุ์ที่มีหางแบบ Spear tail และแม่พันธุ์ที่มีหางแบบ Double sword tail ผสมพันธุ์จนได้ประชากรรุ่นที่ 2 ได้ลูกปลาทั้งหมด 80 ตัว เป็นเพศเมีย 50 ตัวและเพศผู้ 30 ตัว ซึ่งเพศผู้มีหางแบบ Wide tail และ Double sword tail เมื่อวิเคราะห์ตัวอย่างดีเอ็นเอโดยใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอ AFLP จำนวน 20 คู่ไพรเมอร์ ได้แถบดีเอ็นเอ 1,023 แถบ เป็นแถบดีเอ็นเอที่แสดงพอลิมอร์ฟิซึม 332 แถบ (32.4 เปอร์เซ็นต์) เมื่อนำไปวิเคราะห์การถ่ายทอดทางพันธุกรรมของแถบดีเอ็นเอในสัดส่วน 1:1 ด้วยการทดสอบไคสแควร์ ได้แถบดีเอ็นเอที่แสดงการถ่ายทอดทางพันธุกรรมในสัดส่วน 1:1 (P>0.01) ของเครื่องหมายดีเอ็นเอ AFLP จำนวน 187 แถบดีเอ็นเอ และเมื่อนำแถบดีเอ็นเอของเครื่องหมายดีเอ็นเอ AFLP ที่แสดงการถ่ายทอดทางพันธุกรรมในสัดส่วน 1:1 ไปสร้างแผนที่พันธุกรรมด้วยโปรแกรม MapMaker/Exp v.3.0 โดยกำหนดค่า LOD ที่ 2.5 และมีระยะห่างระหว่างแถบดีเอ็นเอน้อยกว่า 50 cM ได้แผนที่พันธุกรรมในปลาหางนกยูง 2 ชุด คือแผนที่พันธุกรรมพ่อปลาและแผนที่พันธุกรรมแม่ปลา โดยแผนที่พันธุกรรมพ่อปลาประกอบด้วยแถบดีเอ็นเอ AFLP จำนวน 38 แถบ ได้จำนวนกลุ่มลิงเกจทั้งหมด 13 กลุ่ม และมีขนาดของจีโนมครอบคลุมทั้งหมด 891.6 cM สำหรับแถบดีเอ็นเอจากพ่อปลาอีก 65 แถบ ไม่พบการเชื่อมโยงกันระหว่างแถบดีเอ็นเอ ส่วนแผนที่พันธุกรรมแม่ปลา ประกอบด้วยแถบดีเอ็นเอ AFLP ทั้งหมด 21 แถบ โดยได้จำนวนกลุ่มลิงเกจ 6 กลุ่ม และมีขนาดของจีโนมครอบคลุมทั้งหมด 531.2 cM สำหรับแถบดีเอ็นเอจากแม่ปลาอีก 63 แถบ ไม่พบการแสดงการเชื่อมโยงกันระหว่างแถบดีเอ็นเอ สำหรับการสร้างแผนที่พันธุกรรมที่เชื่อมโยงกับรูปแบบหาง Wide tail ในเพศผู้ (P<0.0001) ในแผนที่เชื่อมโยงพันธุกรรมพ่อปลาจำนวน 3 แถบ อยู่ในกลุ่มลิงเกจที่ 1 คือ จำนวน 1 แถบดีเอ็นเอ คือ CACACC9 และในกลุ่มลิงเกจที่ 11 จำนวน 2 แถบดีเอ็นเอ คือ AGCGT5 และ AGCGT6 ส่วนในแผนที่เชื่อมโยงพันธุกรรมแม่ปลาไม่พบการเชื่อมโยงกับรูปแบบหาง Wide tail คำสำคัญ: แผนที่พันธุกรรม รูปแบบหาง ปลาหางนกยูง
บทคัดย่อ (EN): Construction of Genetic Linkage map for relationship with tail patterns in guppy (Poecilia reticulata) for improvement in commercialized guppy Suwanna Pholmai1 Suwit Wuthisuthimethavee2 and Sulaiman Madyod3 Construction of Genetic Linkage map for relationship with tail patterns in guppy (Poecilia reticulata) for improvement in commercialized guppy. This project was categorized into two steps, (1) Phylogenetic relationship of tail patterns in Guppy (Poecilia reticulata) using AFLP Marker and (2) Construction of Genetic Linkage map for relationship with tail patterns in guppy. Phylogenetic relationship of tail patterns in guppy (Poecilia reticulata) was analyzed using AFLP marker in 5 tail patterns consisting of Spear tail, Round tail, Top sword tail, Double sword tail and Swallow fin. DNA patterns generated from a total of 10 AFLP primer combinations were used to construct phylogenetic dendrogram by UPGMA using NTSYSpc program. Average genetic similarity among tail patterns varied from 70-78 % Phylogenetic analysis shows that the ten tail patterns could be divided into three major clades consisting of a group of Round tail and Top sword tail, a group of Double sword tail and second group of Swallow fin, and finally a group of Spear tail. However, low genetic variation was found under numbers of markers used. This study also established AFLP technology as a feasible approach in trait identification of tail patterns in guppy. Genetic maps related to tail pattern in guppy (Poecilia reticulata) were constructed using AFLP markers. Fish population used in this study was the offsprings of the crossbreeding between a “Spear tail” male and a “Double sword tail” female. A total of 80 offsprings (F2) was characterized phenotypically as 50 females and 30 males. From male offsprings, 23 were clearly observed as “Wide tail” and 7 were “Double sword tail”. Genotyping a total of 82 DNA samples including parents and offsprings with 20 AFLP primer combinations obtained a total of 1,023 AFLP bands, of which 332 (32.4%) showed polymorphism. Segregation analysis was performed to fit 1:1 ratio (P<0.01) by Chi-square test and the result showed that 103 bands in male and 84 in female were fitted. The fitted DNA bands were further used to construct genetic linkage map by MapMaker/Exp program using LOD score of 2.5 with a distance between two loci lesser than 50 cM. Two genetic linkage maps of guppy were obtained consisting male and female maps. The male map consisted of 38 DNA bands and those were grouped into 13 linkage groups covering 891.6 cM genome length. The other 65 DNA bands from male parent were unlinked bands. The female map consisted of 21 AFLP bands and those were grouped into 6 linkage groups covering 531.2 cM genome length. The other 63 DNA bands from female parent were unlinked bands. This study demonstrated that 3 DNA bands (CACACC9 AGCGT5 and AGCGT6) was significantly related to the Wide tail in male fish (P<0.0001) and it was mapped into the linkage group 7 and 11 of the male map. Key words: Genetic Linkage map, Tail pattern, Guppy (Poecilia reticulata)
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลศรีวิชัย
คำสำคัญ: ปลาหางนกยูง
คำสำคัญ (EN): Poecilia reticulata
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุวรรณา ผลใหม่. "การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้าConstruction of Genetic Linkage map for relationship with tail patterns in guppy (Poecilia reticulata) for improvement in commercialized guppy". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลศรีวิชัย. 2554

สุวรรณา ผลใหม่. "การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้าConstruction of Genetic Linkage map for relationship with tail patterns in guppy (Poecilia reticulata) for improvement in commercialized guppy". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลศรีวิชัย. 2554. Print.



TARR Wordcloud:
การสร้างแผนที่พันธุกรรมที่มีความสัมพันธ์กับรูปแบบหางในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulata) เพื่อการปรับปรุงพันธุ์ทางการค้า
สุวรรณา ผลใหม่
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีราชมงคลศรีวิชัย
30 กันยายน 2554
การพัฒนาพันธุ์ และคัดเลือกพันธุ์อะโวคาโดเพื่อบริโภคผลสด การเพาะเลี้ยงอับละอองเรณูเพื่อสร้างประชากรในการจัดทำแผนที่พันธุกรรมและการสร้างสายพันธุ์แท้ การปรับปรุงพันธุ์ปลาไนโดยวิธีการคัดเลือกแบบหมู่ ประสิทธิภาพของสารสกัดจาก ขิง (Zingiber officinale) กระเทียม (Allium sativum) และข่า (Alpinia galanga) ต่อการต้านการติดเชื้อเตตร้าไฮมีนาในปลาหางนกยูง (Poecilia reticulate) การปรับปรุงพันธุ์อ้อยเพื่อผลผลิตและพลังงาน การทำแผนที่ยีนที่ควบคุมความต้านทานต่อโรคราสนิมในถั่วเหลืองเพื่อการปรับปรุงพันธุ์ การพัฒนาแผนที่พันธุกรรมยางพาราของพันธุ์ RRIM 600 x PB 217 โดยการใช้ microsatellite markers การปรับปรุงพันธุ์สบู่ดำเพื่อการผลิตไบโอดีเซล การปรับปรุงพันธุ์ถั่วเหลืองและถั่วเขียว การปรับปรุงพันธุ์ฝ้ายสีธรรมชาติเพื่อสิ่งแวดล้อมและการพัฒนาที่ยั่งยืน
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair