สืบค้นงานวิจัย
การระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนของ Spirulina platensis โดยใช้ Peptide Mass Fingerprinting
กานดา เลิศลดาลักษณ์ - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
ชื่อเรื่อง: การระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนของ Spirulina platensis โดยใช้ Peptide Mass Fingerprinting
ชื่อเรื่อง (EN): Genome-based Protein Identification in Spirulina platensis Using Peptide Mass Fingerprinting
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: กานดา เลิศลดาลักษณ์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Kanda Lertladaluck
บทคัดย่อ: ในการระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนด้วยการวิเคราะห์ Peptide Mass Fingerprinting(PMF) โดยใช้เทคนิค แมสสเปกโตรสโคปีมีบทบาทสำคัญในงานวิจัยทางโปรตีโอมิกส์ ซึ่งมีซอฟท์แวร์หลายชนิดในการ จัดการข้อมูลเหล่านี้ อย่างไรก็ตาม ซอฟท์แวร์เหล่านี้ไม่สามารถบอกชนิดของโปรตีนได้อย่างแม่นยำ หากจีโนมของสิ่งมีชีวิตนั้นยังบรรจุในฐานข้อมูลสาธารณะ ยกตัวอย่างเช่น Spirulina platensis ดังนั้น ในการศึกษาครั้งนี้จึงได้สร้างซอฟท์แวร์สำหรับการระบุหน้าที่ของโปรตีนโดยการ วิเคราะห์ PMF สำหรับสิ่งมีชีวิตดังกล่าว รวมถึงสิ่งมีชีวิตที่จีโนมได้รับการตีพิมพ์แล้ว โดยมี ส่วนประกอบหลัก 3 ส่วนคือ การทำ in silicon Digestion ของโปรตีนโดยใช้หลักการของเอนไซม์ แต่ละชนิด, การจัดการข้อมูลต่างๆในฐานะข้อมูล และ User-friendly Interface ซึ่งอำนวยความ สะดวกให้กับผู้ใช้ในการค้นหาเปปไทด์หรือโปรตีน จากฐานข้อมูลที่ตรงกับข้อมูลจากการทดลอง เพื่อที่จะระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนได้อย่างถูกต้อง นอกจากนี้ ซอฟท์แวร์นี้ยังประกอบไปด้วยส่วนของ High-throughput Data Analysis ซึ่งสามารถระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนหลายๆตัว โดยการใส่ข้อมูล PMF เพียงครั้งเดียว
บทคัดย่อ (EN): i) in silico digestion of the amino acid sequences according to cleavage rules of specified protease, ii) the management of the information in the relational database, iii) user-friendly interface, which facilitates the users to match the experimental peptide masses against the theoretical masses. Besides, the database and the user interface mention above, the software package also consists of high-throughput data analysis part, which can search hundreds ofPMF at a time.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=54&RecId=11484&obj_id=33717
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
คำสำคัญ (EN): Peptide Mass Fingerprinting
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
รายละเอียด: ในการระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนด้วยการวิเคราะห์ Peptide Mass Fingerprinting(PMF) โดยใช้เทคนิค แมสสเปกโตรสโคปีมีบทบาทสำคัญในงานวิจัยทางโปรตีโอมิกส์ ซึ่งมีซอฟท์แวร์หลายชนิดในการ จัดการข้อมูลเหล่านี้ อย่างไรก็ตาม ซอฟท์แวร์เหล่านี้ไม่สามารถบอกชนิดของโปรตีนได้อย่างแม่นยำ หากจีโนมของสิ่งมีชีวิตนั้นยังบรรจุในฐานข้อมูลสาธารณะ ยกตัวอย่างเช่น Spirulina platensis ดังนั้น ในการศึกษาครั้งนี้จึงได้สร้างซอฟท์แวร์สำหรับการระบุหน้าที่ของโปรตีนโดยการ วิเคราะห์ PMF สำหรับสิ่งมีชีวิตดังกล่าว รวมถึงสิ่งมีชีวิตที่จีโนมได้รับการตีพิมพ์แล้ว โดยมี ส่วนประกอบหลัก 3 ส่วนคือ การทำ in silicon Digestion ของโปรตีนโดยใช้หลักการของเอนไซม์ แต่ละชนิด, การจัดการข้อมูลต่างๆในฐานะข้อมูล และ User-friendly Interface ซึ่งอำนวยความ สะดวกให้กับผู้ใช้ในการค้นหาเปปไทด์หรือโปรตีน จากฐานข้อมูลที่ตรงกับข้อมูลจากการทดลอง เพื่อที่จะระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนได้อย่างถูกต้อง นอกจากนี้ ซอฟท์แวร์นี้ยังประกอบไปด้วยส่วนของ High-throughput Data Analysis ซึ่งสามารถระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนหลายๆตัว โดยการใส่ข้อมูล PMF เพียงครั้งเดียว
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

กานดา เลิศลดาลักษณ์. "การระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนของ Spirulina platensis โดยใช้ Peptide Mass FingerprintingGenome-based Protein Identification in Spirulina platensis Using Peptide Mass Fingerprinting". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2551

กานดา เลิศลดาลักษณ์. "การระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนของ Spirulina platensis โดยใช้ Peptide Mass FingerprintingGenome-based Protein Identification in Spirulina platensis Using Peptide Mass Fingerprinting". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2551. Print.



TARR Wordcloud:
การระบุหน้าที่ให้กับโปรตีนของ Spirulina platensis โดยใช้ Peptide Mass Fingerprinting
กานดา เลิศลดาลักษณ์
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
2551
โปรตีนถั่วเขียวเข้มข้นฟอสโฟรีลเลท : สมบัติการทำหน้าที่และการนำไปใช้ในอาหาร การผลิตผงโปรตีนเข้มข้นจากแมงกะพรุน และการประยุกต์ใช้ การใช้เอนไซม์ในการผลิตรำข้าวโปรตีนสูง. ผลของอุณหภูมิต่อการแสดงออกของยีน 12 DESATURASE (desA) ใน SPIRULINA PLATENSIS C1 ทรานสฟอร์เมชั่นของสาหร่ายเกลียวทอง (Spirulina platensis) การใช้โปรตีนเรืองแสงสีเขียวในการศึกษาตำแหน่งภายในเซลล์ของโปรตีน P3 ของไวรัสโรคใบด่างจุดวงแหวน / Sarasate Eiamtanasate การเพาะเลี้ยงสาหร่ายสไปรูลินา (Spirulina platensis) ในน้ำเสียฟาร์มโคนมเพื่อใช้เป็นอาหารโคนม ผลของความเข้มแสงและความเป็นกรด-เบสต่อการเจริญของ Spirulina platensis และ Chlorella vulgaris การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ การพัฒนาผลิตภัณฑ์เซรามิก โดยใช้เทคนิคการกระจายหน้าที่เชิงคุณภาพ
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair