คลังข้อมูลการวิจัยการเกษตรไทย

ผู้แต่ง Wongboot

เผยแพร่โดย

1 Thailand-Japan Research Collaboration Center on Emerging and Re-emerging Infections (RCC-ERI), Nonthaburi 11000, Thailand. 2 National Institute of Health, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Nonthaburi 11000, Thailand. 3 Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan.

เผยแพร่เมื่อ ไม่ระบุวันที่เผยแพร่

หน่วยงาน ไม่ระบุหน่วยงาน

งานวิจัยที่แนะนำ การตรวจหาเชื้อก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ด้วยวิธี Quantitative real-time PCR Simultaneous detection and quantification of 19 diarrhea-related pathogens with a quantitative real-time PCR panel การตรวจหาเชื้อไวรัสและแบคทีเรียก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ในการทดสอบเดียว ด้วยเทคนิค Multiplex real-time PCR Detection of 19 types of virus and bacteria causing acute diarrhea in single test b Rapid detection of tuberculosis resistant to isoniazid and rifampicin by real-time PCR and melting curve analysis Development of laboratory test for differentiation of Dengue, Chikungunya and Zika viruses by multiplex real-time RT-PCR method Pre-marketing Evaluation of real-time RT PCR Test Kits for SARS-CoV-2 Detection: Thailand Emergency Use Authorization 3 สายพันธุ์โควิด 19 ที่ต้องระวัง! Comparison of the Performances of Five Primer Sets for the Detection and Quantification of Plasmodium in Anopheline Vectors by Real-Time PCR Simultaneous detection of feces-specific bacteriophages of bacteroides fragilis with a duplex PCR assay Development of Zika virus detection method by real time RT-PCR for using in Thailand ความสัมพันธ์ระหว่างปริมาณเชื้อไวรัสตัวแดงดวงขาว (White spot syndrome virus, WSSV) กับการถ่ายทอดโรคในกุ้งกุลาดำโดยใช้เทคนิค real time PCR

คัดลอก URL

ชื่อเรื่อง (EN):	Simultaneous detection and quantification of 19 diarrhea-related pathogens with a quantitative real-time PCR panel assay
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN):	Wongboot
บทคัดย่อ (EN):	Acute diarrheal diseases are causes of global public health concern, especially in developing countries. A variety of diarrhea-associated microbial species, including bacteria, viruses, and protozoa, have been recognized. Simplified methods for detecting a wide range of diarrheagenic enteric microbes can clarify the etiology and aid in the diagnosis of diarrheal diseases. Here, we report a quantitative real-time (q)PCR-based method for simultaneous detection of 24 targets from 19 microbes suspected of causing diarrhea in stool specimens. We first selected the 24 oligonucleotide primer sets and hydrolysis probes conjugated with the fluorescent reporter dyes FAM, NED, or ABY, along with an internal control, and the passive reference dye ROX to establish a single-plate panel assay. The 12-duplex qPCR panel showed high linearity, with R2 values of 0.981–1.0 and limits of detection ranging from 1 to 103 fg for bacterial DNA (1–200 cells), 10–102 copies for viral DNA/RNA, and 10 fg for parasitic DNA (equivalent to approximately 1 parasite) per reaction. The accuracy and robustness of the assay was demonstrated in experiments using clinical stool specimens. This platform is low cost and easily customizable, and can be applied to various types of qPCR instruments and experimental designs for surveillance of acute diarrhea.
บทคัดย่อ:	ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN):	en
เอกสารแนบ (EN):	http://nih.dmsc.moph.go.th/research/showimgdetil.php?id=528
เผยแพร่โดย (EN):	1 Thailand-Japan Research Collaboration Center on Emerging and Re-emerging Infections (RCC-ERI), Nonthaburi 11000, Thailand. 2 National Institute of Health, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Nonthaburi 11000, Thailand. 3 Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan.
คำสำคัญ (EN):	Quantitative real-time PCR (qPCR); Diarrheagenic enteric microbes; Diarrhea; Surveillance
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN):	National Institute of Health, Department of Medical Science