สืบค้นงานวิจัย
การตรวจสอบลายพิมพ์ดีเอ็นเอของโคลนพันธุ์ยูคาลิปตัสโดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์
สุรินทร์ ปิยะโชคณากุล - มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
ชื่อเรื่อง: การตรวจสอบลายพิมพ์ดีเอ็นเอของโคลนพันธุ์ยูคาลิปตัสโดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์
ชื่อเรื่อง (EN): DNA Fingerprinting of Eucalypt Clones using Microsatellite Markers
บทคัดย่อ: นำเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์มาใช้ตรวจสอบโคลนพันธุ์ยูคาลิปตัสจำนวน 25 ตัวอย่าง พบว่าไพรเมอร์ที่คัดเลือกมาทั้งหมด 39 คู่มีเพียง 28 คู่ที่สามารถเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอได้ และมี 18 คู่ ที่แสดงความหลากหลายทางพันธุกรรมของแต่ละโคลนพันธุ์ยูคาลิปตัสได้ จากการตรวจสอบดีเอ็นเอทั้ง 25 ตัวอย่างโดยใช้ไพรเมอร์ 18 คู่ มีแถบดีเอ็นเอที่แสดงความหลากหลายทั้งหมด 152 แถบ เมื่อนำมาวิเคราะห์ความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมโดยวิธี UPGMA (unweighed pair group method using arithmetic average ) พบว่าสามารถสร้างแผนภาพแสดงความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมซึ่งจัดกลุ่มยูคาลิปตัสออกเป็น 4 กลุ่ม เมื่อทำการคัดเลือกไพรเมอร์มาเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอแบบ duplex PCR พบว่ามีไพรเมอร์ 4 คู่ ที่สามารถนำมาใช้เพิ่มปริมาณดีเอ็นเอพร้อมกัน คือ EMBRA 2 กับ EMBRA 22, EMBRA 2 กับ EMBRA 63, EMBRA 22 กับ EMBRA 69 และ EMBRA 63 กับ EMBRA 69 ทำให้สามารถตรวจสอบดีเอ็นเอของ ยูคาลิปตัสได้รวดเร็ว และประหยัดค่าใช้จ่ายได้ อีกทั้งยังได้โคลนชิ้นดีเอ็นเอ หาลำดับเบส และ ออกแบบไพรเมอร์ใหม่ 6 คู่ แต่มีเพียง 4 คู่ ที่สามารถใช้เพิ่มปริมาณดีเอ็นเอตัวอย่างได้ อย่างไรก็ตามเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ที่คัดเลือกมาสามารถใช้แยกความแตกต่างระหว่างตัวอย่างยูคาลิปตัสที่มีความใกล้ชิดกันได้อย่างมีประสิทธิภาพ
บทคัดย่อ (EN): Microsatellite markers were used to verify 25 eucalyptus clones. Thirty nine primer pairs were selected. Twenty eight primer pairs could amplify DNA in which 18 of them showed polymorphic band pattern among 25 eucalyptus clones. One hundred and fifty-two distinct DNA bands were scored and calculated for the genetic similarity and cluster analysis using simple matching and UPGMA (unweighted pair group method using arithmetic average). The constructed phylogenetic tree divided these eucalyptus into four clusters. Two pairs of primer each; EMBRA 2 and EMBRA 22, EMBRA 2 and EMBRA 63, EMBRA 22 and EMBRA 69, EMBRA 63 and EMBRA 69, were selected to amplify DNA in the same reaction as a duplex PCR which made fingerprinting of eucalyptus clones easier and less expensive. In addition, five DNA fragments were cut from the gel, cloned, and sequenced. Six primer pairs were designed from these sequences and four primer pairs could amplify DNA of the samples. The result showed that these microsatellite markers could be used to examine and compare the genetic diversity among closely related samples.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
คำสำคัญ: ลายพิมพ์ดีเอ็นเอ
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การตรวจสอบลายพิมพ์ดีเอ็นเอของโคลนพันธุ์ยูคาลิปตัสโดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
30 กันยายน 2552
การวิเคราะห์พันธุกรรมของทุเรียนพื้นบ้านในภาคใต้โดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุลม้าวิ่ง ความหลากหลายและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของตุ๊กแกบ้าน (Gekko gecko) ในเอเชียตะวันออกเฉียงใต้โดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ ความหลากหลายทางพันธุกรรมของปลากระพงขาวจากทะเลสาบสงขลาและทะเลอันดามันโดยใช้เครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ดีเอ็นเอ การตรวจสอบลายพิมพ์ดีเอ็นเอและประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยน้ำว้าในจังหวัดพิษณุโลกด้วยเครื่องหมายโมเลกุล การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST เพื่อวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพืชสกุล Curcuma การสำรวจเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์ในปลาตระกูลตะเพียน โดยวิธีการทดสอบพีซีอาร์ข้ามชนิด การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST และการประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกล้วยไม้สกุลม้าวิ่ง การสร้างลายพิมพ์ดีเอ็นเอเพื่อระบุความจำเพาะของพลับพลึงธารพันธุ์ไม้น้ำใกล้สูญพันธุ์ในประเทศไทย และการปรับปรุงพันธุกรรมโดยใช้รังสีแกมมา การประยุกต์ใช้ลายพิมพ์ดีเอ็นเอเพื่อจำแนกสายพันธุ์กล้วยน้ำว้า
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก