สืบค้นงานวิจัย
Complete mitochondrial genome of three Bactrocera fruit flies of subgenus Bactrocera (Diptera: Tephritidae) and their phylogenetic implications
Yong H.-S. - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Complete mitochondrial genome of three Bactrocera fruit flies of subgenus Bactrocera (Diptera: Tephritidae) and their phylogenetic implications
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Yong H.-S.
บทคัดย่อ (EN): Bactrocera latifrons is a serious pest of solanaceous fruits and Bactrocera umbrosa is a pest of Artocarpus fruits, while Bactrocera melastomatos infests the fruit of Melastomataceae. They are members of the subgenus Bactrocera.We report here the complete mitochondrial genome of these fruit flies determined by next-generation sequencing and their phylogeny with other taxa of the subgenus Bactrocera. The whole mitogenomes of these three species possessed 37 genes namely, 13 protein-coding genes (PCGs), 2 rRNA and 22 tRNA genes. The mitogenome of B. latifrons (15,977 bp) was longer than those of B. melastomatos (15,954 bp) and B. umbrosa (15,898 bp). This difference can be attributed to the size of the intergenic spacers (283 bp in B. latifrons, 261 bp in B. melastomatos, and 211 bp in B. umbrosa). Most of the PCGs in the three species have an identical start codon, except for atp8 (adenosine triphosphate synthase protein 8), which had an ATG instead of GTG in B. umbrosa, whilst the nad3 (NADH dehydrogenase subunit 3) and nad6 (NADH dehydrogenase subunit 6) genes were characterized by an ATC instead of ATT in B. melastomatos. The three species had identical stop codon for the respective PCGs. In B. latifrons and B. melastomatos, the TΨC (thymidine-pseudouridine-cytidine)-loop was absent in trnF (phenylalanine) and DHU (dihydrouracil)-loop was absent in trnS1 (serine S1). In B. umbrosa, trnN (asparagine), trnC (cysteine) and trnF lacked the TΨC-loop, while trnS1 lacked the DHU-stem. Molecular phylogeny based on 13 PCGs was in general concordant with 15 mitochondrial genes (13 PCGs and 2 rRNA genes), with B. latifrons and B. umbrosa forming a sister group basal to the other species of the subgenus Bactrocera which was monophyletic. The whole mitogenomes will serve as a useful dataset for studying the genetics, systematics and phylogenetic relationships of the many species of Bactrocera genus in particular, and tephritid fruit flies in general. © 2016 Yong et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เอกสารแนบ (EN): https://www.scopus.com/inward/record.uri?eid=2-s2.0-84959018783&doi=10.1371%2fjournal.pone.0148201&partnerID=40&md5=e7a6a64130c8464b1780f7c4ae8e78be
เผยแพร่โดย (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Tephritidae
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): มหาวิทยาลัยมหิดล
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Yong H.-S.. "Complete mitochondrial genome of three Bactrocera fruit flies of subgenus Bactrocera (Diptera: Tephritidae) and their phylogenetic implications". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.

Yong H.-S.. "Complete mitochondrial genome of three Bactrocera fruit flies of subgenus Bactrocera (Diptera: Tephritidae) and their phylogenetic implications". ไม่ระบุหน่วยงาน. ม.ป.ป.. Print.



TARR Wordcloud:
Complete mitochondrial genome of three Bactrocera fruit flies of subgenus Bactrocera (Diptera: Tephritidae) and their phylogenetic implications
Yong H.-S.
มหาวิทยาลัยมหิดล
ไม่ระบุวันที่เผยแพร่
Differentiating sibling species of Zeugodacus caudatus (Insecta: Tephritidae) by complete mitochondrial genome Complete mitochondrial genome of Zeugodacus tau (Insecta: Tephritidae) and differentiation of Z. tau species complex by mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene การทำลายของแมลงวันพริก Bactrocera latifrons (Diptera: Tephritidae) ในผลพริก 8 สายพันธุ์ Complete mitochondrial genome of Orthetrum dragonflies and molecular phylogeny of Odonata Complete mitochondrial genome of Angiostrongylus malaysiensis lungworm and molecular phylogeny of Metastrongyloid nematodes Complete mitochondrial genome and phylogeny of Microhyla butleri (Amphibia: Anura: Microhylidae) Complete mitochondrial genome reveals genetic diversity of Angiostrongylus cantonensis (Nematoda: Angiostrongylidae) Species diversity and abundance of Tabanus spp. (Diptera: Tabanidae) in different habitats of Thailand ประสิทธิภาพของเชื้อราโรคแมลง Metarhizium anisopliae (Metsch.) Sorokin(Deuteromycotina: Hyphomyces) ต่อการควบคุมแมลงวันพริกBactrocera latifrons(Hendel)(Diptera: Tephritidae) ในสภาพห้องปฏิบัติการและเรือ การประยุกต์ใช้เชื้อรา Metarhizium anisopliae (Metsch.) Sorokin ร่วมกับน้ำมันปิโตรเลียมและผลิตภัณฑ์เมล็ดสะเดาช้าง ควบคุมแมลงวันแตง Bactrocera cucurbitae (Coquillett) (Diptera: Tephritidae) ในบวบเหลี่ยม
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair