สืบค้นงานวิจัย
การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทยและโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้
ณชัย ศราพันธุ์ - กรมปศุสัตว์
ชื่อเรื่อง: การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทยและโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้
ชื่อเรื่อง (EN): Study on Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Heat Shock Protein Genes (hsp70 and 90) in Thai Native and Crossbred Cattle in Comparison with Pure Breed Cattle
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ณชัย ศราพันธุ์
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Nachai Sarataphan
บทคัดย่อ: การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน 70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทย และโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้1/ ณชัย ศราธพันธุ์2/* ณรงค์ เลี้ยงเจริญ2/ ณัฐนันท์ ศิริรัตนธัญญะกุล 2/ สายใจ ชื่นสุข2/ และ วิษณุ ไพศาลรุ่งพนา3/ บทคัดย่อ วัตถุประสงค์ในการศึกษาครั้งนี้ เพื่อหาความหลากหลายชนิดของสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 ในโคจำนวน 58 ตัวและ 62 ตัวตามลำดับ โดยทำการขยายจำนวนชิ้นส่วนดีเอ็นเอขนาด 449 คู่เบสในส่วนโปรโมเตอร์ของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และดีเอ็นเอขนาด 646 คู่เบสในส่วนของเอกซอน 7-9 ของยีนฮีทช็อคโปรตีน90 ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสด้วยไพรเมอร์จำเพาะ และนำผลไปหาลำดับเบสจากตัวอย่างดีเอ็นเอ ผลการศึกษาพบความหลากหลายของสนิปส่วนโปรโมเตอร์ของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 จำนวน 2 ตำแหน่ง คือ C895D และ G1128T ซึ่งมี ความถี่จีโนไทป์ CC, C(-) และ -/- เท่ากับ 26.22, 25.55 และ 6.22 ตามลำดับ ส่วนความถี่จีโนไทป์ GG, GT และ TT เท่ากับ 22.34, 27.31 และ 8.34 ตามลำดับ เมื่อจำแนกเป็นสนิปฮาโปลไทป์ได้ 4 กลุ่ม ซึ่งแต่ละกลุ่มมีความถี่ของฮาโปลไทป์ CT, CG, DT และ DG เท่ากับ 23 (39.6%), 16 (27.6%), 13 (22.4%) และ 6 (10.4%) ตามลำดับ ในโคพื้นเมืองไทย 33 ตัวพบความถี่ของสนิปฮาโปลไทป์ CT, CG, DT และ DG เท่ากับ 39.4, 36.4, 18.2 และ 6% ตามลำดับ ในขณะที่ ในโคลูกผสมจำนวน 13 ตัวพบความถี่ของสนิปฮาโปลไทป์ CT, CG, DT และ DG เท่ากับ 38.5, 15.4, 30.8 และ 15.3% ตามลำดับ นอกจากนี้ ในโคสายยุโรปพันธุ์แท้จำนวน 9 ตัวพบความถี่ของสนิปฮาโปลไทป์ CT, CG, DT และ DG เท่ากับ 44.4, 22.2, 11.1 และ 22.2% ตามลำดับ ส่วนความหลากหลายของยีนฮีทช็อคโปรตีน90 ผลการศึกษาพบสนิปจำนวน 4 ตำแหน่ง คือ G2226A,T2323G, C2749T และ T2925C โดยมีความหลากหลายของ สนิป ซึ่งจำแนกเป็นสนิปฮาโปลไทป์เป็น 5 กลุ่มคือ GTCT, GGCT, GTCC, ATCC และ ATTC สนิปฮาโปลไทป์ที่พบมากที่สุดคือ GTCT คิดเป็น 79.03 % รองลงมาคือ ATCC คิดเป็น 11.29 % โคที่มีสนิปฮาโปลไทป์ GTCT มากที่สุด คือโคพื้นเมือง รองลงมาคือโคนมลูกผสมโฮลสไตน์ ผลการศึกษาในครั้งนี้สรุปได้ว่าสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 มีความหลากหลายอาจนำไปใช้เป็นเครื่องหมายทางพันธุกรรมสำหรับคัดเลือกโคที่มีลักษณะการทนร้อนได้ คำสำคัญ : ยีนฮีทช็อคโปรตีน 70 90 สนิป โคพื้นเมือง โคลูกผสม โคพันธุ์แท้ 1/ เลขทะเบียนวิจัย : 54(1)-(54:01)-0208-029 2/ กลุ่มวิจัยและพัฒนาเทคโนโลยีชีวภาพการปศุสัตว์ สำนักเทคโนโลยีชีวภาพการผลิตปศุสัตว์ อ. เมือง จ. ปทุมธานี 3/ ศูนย์ฝึกอบรมบุคลากรเทคโนโลยีชีวภาพการผลิตปศุสัตว์ อำเภอท่าหลวง จังหวัดลพบุรี
บทคัดย่อ (EN): Study on Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Heat Shock Protein Genes (HSP70 and 90) in Thai Native and Crossbred Cattle in Comparison with Pure brred Cattle1/ Nachai Sarataphan2*/ Narong Liangcharoen2/ Nattanan Sirirattanatanyakul2/ Saijai Cheunsuk 2/ and Wissanu Paisalrungphana3/ The aim of present study was to identify single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the bovine Hsp70 and Hsp90 beta genes in 58 and 62 cattle, respectively. DNA samples were amplified 449 bp of Hsp70 gene at promotor region and 646 bp of Hsp90 beta gene at exon 7-9 by polymerase chain reaction (PCR) with specific primer sets. The PCR products were direct DNA sequencing. The result revealed that two SNPs of Hsp70 gene were found known as C895D (-) and G1128T. The frequencies of SNPs were calculated for genotype frequency by using Hardy-Weinberg equation. C895D genotype of CC, C(-) and -/- were 26.22, 25.55 and 6.22, respectively, whereas G1128T genotype of GG, GT and TT were 2234, 27.31 and 8.34, respectively in 58 cattle. Four haplotype was classified as CT, CG, DT and DG with haplotype frequencies of 23 (39.6%), 16 (27.6%), 13 (22.4%) and 6 (10.4%), respectively in 58 cattle. Thirty-three of Thai native cattle carried CT, CG, DT and DG haplotype with 39.4, 36.4, 18.2 and 6%, respectively, as well as 13 crossbred cattle CT, CG, DT and DG haplotype with 38.5, 15.4, 30.8 and 15.3%, respectively, whereas 44.4, 22.2, 11.1 and 22.2%, respectively in 9 European pure breed cattle. The result also revealed that four SNPs of Hsp90 beta gene were found known as G2226A,T2323G, C2749T and T2925C. Five haplotype were classified as GTCT, GGCT, GTCC, ATCC and ATTC. The GTCT haplotype was found highest frequency with 79.03 % followed by ATCC haplotype with 11.29 % in 62 cattle. The highest frequency of GTCT haplotype was found in Thai native cattle followed in crossbred Holstein dairy cattle. This study suggested that the SNPs of Hsp70 and Hsp90 beta genes might be useful as molecular genetic markers to assist selection for heat tolerance in cattle. Keywords : Heat shock protein genes 70, 90, SNPs, native, crossbred, pure bred cattle 1/ Registrated No. : 54(1)-(54:01)-0208-029 2/ Research and Development Biotechnology Section, Bureau of Biotechnology in Livestock Production (BBLP), Muang, Pathumthani 3 Biotechnology Training Center, Tha Luang, Lopburi
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: กรมปศุสัตว์
คำสำคัญ: และ
คำสำคัญ (EN): hsp90
เจ้าของลิขสิทธิ์: ฐานข้อมูล NRMS
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ณชัย ศราพันธุ์. "การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทยและโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้Study on Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Heat Shock Protein Genes (hsp70 and 90) in Thai Native and Crossbred Cattle in Comparison with Pure Breed Cattle". กรมปศุสัตว์. 2555

ณชัย ศราพันธุ์. "การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทยและโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้Study on Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) of Heat Shock Protein Genes (hsp70 and 90) in Thai Native and Crossbred Cattle in Comparison with Pure Breed Cattle". กรมปศุสัตว์. 2555. Print.



TARR Wordcloud:
การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทยและโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้
ณชัย ศราพันธุ์
กรมปศุสัตว์
30 กันยายน 2555
กรมปศุสัตว์
การศึกษาสนิปของยีนฮีทช็อคโปรตีน 70 และ 90 ในโคพื้นเมืองไทยและโคลูกผสมเปรียบเทียบกับโคพันธุ์แท้ สมรรถนะการผลิตและลักษณะซากของโคพื้นเมืองไทยที่เลี้ยงด้วยอาหารหยาบที่มีคุณภาพแตกต่างกัน การศึกษาความเป็นไปได้ของการเลี้ยงโคพื้นเมืองภูเขาเป็นปศุสัตว์อินทรีย์ การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมและการจำแนกกลุ่ม โคพื้นเมืองไทยด้วยไมโตคอนเดรียดีเอ็นเอ การใช้มูลไก่และใบกระถินแห้งเป็นแหล่งโปรตีนในอาหารโคเนื้อ การผลิตตัวอ่อนโคพื้นเมืองไทยภายนอกร่างกายโดยเทคนิคการเจาะดูดไข่จากแม่โค การใช้วัสดุพลอยได้การเกษตรเลี้ยงโค การศึกษายีนที่สร้างสารเอ็นเทอโรท็อกซินในเชื้อ S. aureus ที่แยกได้จากโคที่เป็นโรคเต้านมอักเสบในภาคตะวันออกเฉียงเหนือของประเทศไทย การทดสอบการเสริม Urea Molasses Multinutrient Block (UMMB) แก่โครีดนมในฟาร์มเกษตรกร ผลของรูปแบบการใช้อาหารข้นของแม่โคและหญ้าแห้งที่มีต่อลูกโคก่อนหย่านม
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair