สืบค้นงานวิจัย
การตรวจหาเชื้อก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ด้วยวิธี Quantitative real-time PCR Simultaneous detection and quantification of 19 diarrhea-related pathogens with a quantitative real-time PCR panel assay
วราวรรณ วงษ์บุตร - 1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข จังหวัดนนทบุรี 2 ศูนย์ความร่วมมือการวิจัยโรคติดต่ออุบัติใหม่และอุบัติซ้ำระหว่างประเทศไทยกับประเทศญี่ปุ่น จังหวัดนนทบุรี 3 มหาวิทยาลัยโอซาก้า ประเทศญี่ปุ่น 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Nonthaburi, Thailand 2 Thailand-Japan Research Collaboration Center on Emerging and Re-emerging Infections, Nonthaburi, Thailand 3 Research Collaboration Center for Infectious diseases, Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka, Japan
ชื่อเรื่อง: การตรวจหาเชื้อก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ด้วยวิธี Quantitative real-time PCR Simultaneous detection and quantification of 19 diarrhea-related pathogens with a quantitative real-time PCR panel assay
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: วราวรรณ วงษ์บุตร
บทคัดย่อ: โรคอุจจาระร่วงที่มีสาเหตุเกิดจากการติดเชื้อจุลินทรีย์ ได้แก่ เชื้อแบคทีเรีย ไวรัส และปรสิต มีความสำคัญทางด้านสาธารณสุขทั่วโลก วิธีการตรวจวินิจฉัยเชื้อก่อโรคทางเดินอาหารแบบครอบคลุมสามารถช่วยให้การวินิจฉัยโรค มีความแม่นยำและน่าเชื่อถือ การศึกษานี้ ได้มีการพัฒนาวิธีเรียลไทม์พีซีอาร์เพื่อใช้ตรวจหาเชื้อจุลินทรีย์ จำนวน 19 ชนิด จากตัวอย่างอุจจาระ โดยใช้ยีนเป้าหมายจำนวน 24 ยีน ศึกษาโดยเลือกใช้ไพรเมอร์และโพรบซึ่งติดฉลากด้วยสารเรืองแสงที่แตกต่างกัน คือ FAM และ NED หรือ ABY ร่วมกับ passive reference dye (ROX) และการตรวจยีนควบคุมภายใน (Internal control) เพื่อตรวจหายีนเป้าหมายจำนวน 12 คู่ในคราวเดียวกัน ผลการศึกษาพบว่า วิธีเรียลไทม์พีซีอาร์ซึ่งมีความจำเพาะต่อยีนเป้าหมายแต่ละชนิดมีค่า R2 อยู่ในช่วง 0.980 - 1.0 และมีความไวในการตรวจพบเชื้อแบคทีเรีย ไวรัส และปรสิตที่ความเข้มข้น 1-103 fg (1-200 เซลล์) 10-102 copies และ 10 fg (1 parasite) ตามลำดับ วิธีนี้ ได้ตรวจประเมินความแม่นยำและนำไปประยุกต์ใช้ในตัวอย่างอุจจาระ ผลการศึกษาแสดงให้เห็นว่า วิธีเรียลไทม์พีซีอาร์ที่พัฒนาขึ้นนี้ เป็นวิธีการตรวจที่มีราคาเหมาะสม ง่ายต่อการใช้งาน และสามารถนาไปประยุกต์ใช้ได้กับเครื่องเรียลไทม์พีซีอาร์ต่างๆ ส่งผลให้การเฝ้าระวังโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลันมีประสิทธิภาพมากยิ่งขึ้น Diarrheal diseases are caused by a variety of microorganisms including bacteria, viruses or parasites, and are major public health problems worldwide. Simplified methods for detecting a wide range of diarrheagenic enteric microbes can identify the etiology and aid in the diagnosis of diarrhea diseases. We report here a quantitative real-time (q)PCR-based method for simultaneous detection of 24 targets from 19 microbes suspected of causing diarrhea in stool specimens. We first selected the 24 oligonucleotide primer sets and hydrolysis probes, conjugated with the fluorescent reporter dyes FAM and either NED or ABY along with an internal controls (ICs) and the passive reference dye (ROX) to establish a single-plate panel assay. The 12-duplex qPCR panel showed high linearity, with R2 values of 0.980-1.0 and limits of detection ranging from 1–103 fg bacterial DNA (1–200 cells), 10–102 copies of viral DNA/RNA, and 10 fg parasitic DNA (approximately 1 parasite) per reaction. The accuracy and robustness of the assay was demonstrated in experiments using clinical stool specimens. This platform is low cost and easily customizable, and, can be applied to various types of qPCR instruments. This technic will be useful surveillance of acute diarrhea.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://nih.dmsc.moph.go.th/research/showimgdetil.php?id=637
เผยแพร่โดย: 1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข จังหวัดนนทบุรี 2 ศูนย์ความร่วมมือการวิจัยโรคติดต่ออุบัติใหม่และอุบัติซ้ำระหว่างประเทศไทยกับประเทศญี่ปุ่น จังหวัดนนทบุรี 3 มหาวิทยาลัยโอซาก้า ประเทศญี่ปุ่น 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Nonthaburi, Thailand 2 Thailand-Japan Research Collaboration Center on Emerging and Re-emerging Infections, Nonthaburi, Thailand 3 Research Collaboration Center for Infectious diseases, Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka, Japan
คำสำคัญ: Diarrheal diseases
เจ้าของลิขสิทธิ์: สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุขกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การตรวจหาเชื้อก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ด้วยวิธี Quantitative real-time PCR Simultaneous detection and quantification of 19 diarrhea-related pathogens with a quantitative real-time PCR panel assay
1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข จังหวัดนนทบุรี 2 ศูนย์ความร่วมมือการวิจัยโรคติดต่ออุบัติใหม่และอุบัติซ้ำระหว่างประเทศไทยกับประเทศญี่ปุ่น จังหวัดนนทบุรี 3 มหาวิทยาลัยโอซาก้า ประเทศญี่ปุ่น 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Nonthaburi, Thailand 2 Thailand-Japan Research Collaboration Center on Emerging and Re-emerging Infections, Nonthaburi, Thailand 3 Research Collaboration Center for Infectious diseases, Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka, Japan
2561
1 สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ กระทรวงสาธารณสุข จังหวัดนนทบุรี 2 ศูนย์ความร่วมมือการวิจัยโรคติดต่ออุบัติใหม่และอุบัติซ้ำระหว่างประเทศไทยกับประเทศญี่ปุ่น จังหวัดนนทบุรี 3 มหาวิทยาลัยโอซาก้า ประเทศญี่ปุ่น 1 National Institute of Health, Department of Medical Sciences, Ministry of Public Health, Nonthaburi, Thailand 2 Thailand-Japan Research Collaboration Center on Emerging and Re-emerging Infections, Nonthaburi, Thailand 3 Research Collaboration Center for Infectious diseases, Research Institute for Microbial Diseases, Osaka University, Osaka, Japan
Simultaneous detection and quantification of 19 diarrhea-related pathogens with a quantitative real-time PCR panel assay ผลการแยกชนิดของระยะตัวเต็มวัยและไข่ของพยาธิเข็มหมุดโดยวิธี PCR ผลงานนำเสนอประชุมวิชาการกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ ครั้งที่ 23 เรื่อง ผลการแยกชนิดของระยะตัวเต็มวัยและไข่ของพยาธิเข็มหมุดโดยวิธี PCR การพัฒนาการตรวจหา เชื้อสเตรปโตคอคคัส ซูอิส และยีนที่จำเพาะต่อ ซีโรไทป์โดยใช้เทคนิค multiplex PCR การตรวจหาเชื้อไวรัสและแบคทีเรียก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ในการทดสอบเดียว ด้วยเทคนิค Multiplex real-time PCR Detection of 19 types of virus and bacteria causing acute diarrhea in single test b Rapid detection of tuberculosis resistant to isoniazid and rifampicin by real-time PCR and melting curve analysis โครงการวิจัยและพัฒนาเพื่อแก้ปัญหาโรคใบขาวของอ้อย การพัฒนาวิธีตรวจหาเชื้อ Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis ในสัตว์เคี้ยวเอื้อง ด้วยเทคนิคอณูชีวโมเลกุล 3 สายพันธุ์โควิด 19 ที่ต้องระวัง! การพัฒนาการตรวจวินิจฉัยโรคปากและเท้าเปื่อย โดยวิธี Real-Time PCR
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก