สืบค้นงานวิจัย
การจำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ก่อโรค 5 สปีชีส์ด้วยวิธีมัลติเพล็กซ์เรียลไทม์พีซีอาร์ร่วมกับการวิเคราะห์การคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอ Identification and differentiation of five pathogenic Campylobacter species by multiplex real-time PCR melting curve
ชุติมา จิตตประสารทศีล - สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science
ชื่อเรื่อง: การจำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ก่อโรค 5 สปีชีส์ด้วยวิธีมัลติเพล็กซ์เรียลไทม์พีซีอาร์ร่วมกับการวิเคราะห์การคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอ Identification and differentiation of five pathogenic Campylobacter species by multiplex real-time PCR melting curve
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ชุติมา จิตตประสารทศีล
บทคัดย่อ: เชื้อแคมไพโลแบคเตอร์เป็นแบคทีเรียก่อโรคอาหารเป็นพิษและภาวะติดเชื้อในกระแสเลือดที่สำคัญ ปัจจุบันวิธีมาตรฐานในการตรวจยืนยันเชื้อคือการทดสอบทางชีวเคมีซึ่งเป็นวิธีที่ยุ่งยากซับซ้อนและใช้เวลามาก ในการศึกษานี้ได้ พัฒนาวิธีมัลติเพล็กซ์เรียลไทม์พีซีอาร์ร่วมกับการวิเคราะห์การคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอสำหรับตรวจวินิจฉัยและจำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ก่อโรค 5 สปีชีส์ที่พบบ่อยในคนได้แก่ C. jejuni, C. coli, C. fetus, C. lari และ C. upsaliensis โดยใช้ชุดไพรเมอร์ที่ออกแบบใหม่ให้จำเพาะกับเชื้อแต่ละสปีชีส์ร่วมกับไพรเมอร์ที่จำเพาะต่อยีน 16S rRNA ซึ่งใช้เป็นตัวควบคุมพีซีอาร์ ผลผลิตพีซีอาร์จาก 6 คู่ไพรเมอร์มีอุณหภูมิ melting point ที่ 74, 76, 78, 80, 82 และ 86 องศาเซลเซียส ซึ่งสามารถใช้จำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ทั้ง 5 สปีชีส์ได้อย่างชัดเจน นอกจากนี้ได้ออกแบบให้ผลผลิตพีซีอาร์มีขนาดแตกต่างกันทำให้ใช้วิเคราะห์โดยวิธีเจลอิเลกโตรโฟร์ซิสได้ด้วย เมื่อนำไปทดสอบกับเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์จำนวน 200 สายพันธ์ที่ตรวจยืนยันด้วยวิธีทางชีวเคมีแล้ว พบว่ามีความไวและความจำเพาะร้อยละ 100 เมื่อเปรียบเทียบกับวิธีทดสอบทางชีวเคมี วิธีที่พัฒนาขึ้นใหม่นี้เป็นวิธีที่ทำได้ง่าย รวดเร็ว ราคาไม่แพง ให้ผลการวิเคราะห์ชัดเจน และสามารถใช้ทดแทนวิธีทดสอบทางชีวเคมีแบบดังเดิมได้ Campylobacter are the important bacterial causes of human foodborne gastroenteritis and septicemia. Currently, the gold standard for confirmation of species identification using biochemical tests, which is often complex and time-consuming. In this study, a multiplex real-time PCR assay with melting curve analysis was developed and optimized for the detection and species differentiation of the five common pathogenic Campylobacter species including C. jejuni, C. coli, C. fetus, C. lari, and C. upsaliensis. The assay was developed using a combination of newly designed primers specific to each of the five Campylobacter species and 16S rRNA gene as an internal control. PCR products provided the melting point temperatures at an approximately 74, 76, 78, 80, 82 and 86 degree Celsius that sufficiently distinguished each of Campylobacter species. In addition, the assay was designed to provide a PCR product with difference in size by agarose gel electrophoresis. A total of 200 biochemically identified Campylobacter isolates were used for evaluation, the assay showed a 100% sensitivity and specificity when comparing to the biochemical tests. This newly developed multiplex real-time PCR melting curve assay is a simple, rapid, cost-effective and practical tool for identification of Campylobacter commonly associated with gastroenteritis and/or septicemia in humans, and offers an effective alternative to conventional biochemical-based assays
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://nih.dmsc.moph.go.th/research/showimgdetil.php?id=722
เผยแพร่โดย: สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science
คำสำคัญ: Melting curve analysis
เจ้าของลิขสิทธิ์: สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุขกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ชุติมา จิตตประสารทศีล. "การจำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ก่อโรค 5 สปีชีส์ด้วยวิธีมัลติเพล็กซ์เรียลไทม์พีซีอาร์ร่วมกับการวิเคราะห์การคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอ Identification and differentiation of five pathogenic Campylobacter species by multiplex real-time PCR melting curve". สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science. 2563

ชุติมา จิตตประสารทศีล. "การจำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ก่อโรค 5 สปีชีส์ด้วยวิธีมัลติเพล็กซ์เรียลไทม์พีซีอาร์ร่วมกับการวิเคราะห์การคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอ Identification and differentiation of five pathogenic Campylobacter species by multiplex real-time PCR melting curve". สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science. 2563. Print.



TARR Wordcloud:
การจำแนกเชื้อแคมไพโลแบคเตอร์ก่อโรค 5 สปีชีส์ด้วยวิธีมัลติเพล็กซ์เรียลไทม์พีซีอาร์ร่วมกับการวิเคราะห์การคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอ Identification and differentiation of five pathogenic Campylobacter species by multiplex real-time PCR melting curve
ชุติมา จิตตประสารทศีล
สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข กรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ National Institute of Health, Department of Medical Science
2563
จำแนก และคัดเลือกโปรโมเตอร์จากพืชโดยเฉพาะตระกูล Poaceae เพื่อใช้ในการเพิ่มประสิทธิภาพการแสดงออกของยีนเป้าหมายในระบบท่อลำเลียงของอ้อย การวินิจฉัยเชื้อ Thermophilic Campylobacter: วิธีทางจุลชีววิทยาเปรียบเทียบวิธี Multiplex Polymerase Chain Reaction การตรวจสอบแบคทีเรียในน้ำนมโคด้วยวิธีมัลติเพล็กซ์พีซีอาร์ พีซีอาร์ การวิเคราะห์ระบบนิเวศเกษตร โครงการวิจัยและพัฒนาเพื่อแก้ปัญหาโรคใบขาวของอ้อย การตรวจหาเชื้อไวรัสและแบคทีเรียก่อโรคอุจจาระร่วงเฉียบพลัน 19 ชนิด ในการทดสอบเดียว ด้วยเทคนิค Multiplex real-time PCR Detection of 19 types of virus and bacteria causing acute diarrhea in single test b การประยุกต์เทคนิคมัลติเพล็กซ์พีซีอาร์เพื่อตรวจสอบแบคทีเรียในอาหารทะเลแช่แข็ง การปนเปื้อนแคมไพโลแบคเตอร์ในกระบวนการผลิตสุกรแบบอินทรีย์ การตรวจแยกเพศตัวอ่อนโคโดยวิธี Real-Time PCR ด้วย TSPY gene
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair