สืบค้นงานวิจัย
การสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลือง
Jutamas Ngopon - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลือง
ชื่อเรื่อง (EN): Construction of cDNA library of Lymphoid Organ of YHV infected shrimp (penaeus monodon)
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Jutamas Ngopon
บทคัดย่อ: การเพาะเลี้ยงกุ้งกุลาดำเป็นอุตสาหกรรมที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจต่อประเทศไทย โดยไทยสามารถ ส่งออกกุ้งกุลาดำได้เป็นอันดันหนึ่งของโลก ต่อมาในระยะหลังปริมาณการส่งออกกุ้งของไทยลดลงเนื่องจากการ เกิดโรคระบาดซึ่งมีสาเหตุมาจากเชื้อไวรัส โดยเฉพาะเชื้อไวรัสหัวเหลือง (YHV) ทำให้เกิดการตายของกุ้งเป็น จำนวนมาก เพื่อศึกษาการแสดงออกของยีนในกุ้งกุลาดำที่ถูกกระต้นด้วยเชื้อไวรัสหัวเหลือง จึงสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลือง เมื่อสุ่มเลือกโคลนจำนวน 887 โคลน มาหาลำดับ นิวคลีโอไทด์ และเปรียบเทียบกับยีนที่มีรายงานแล้วใน GenBankโดยใช้โปรแกรม BlastX พบว่า 452 โคลน (51%) มีลำดับนิวคลีโอไทด์เหมือนกับยีนที่รายงานแล้วในขณะที่ 435 โคลน (49%) ไม่เหมือนกับยีนที่มีรายงานใน GenBank พบยีนที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันจำนวน 15 โคลน (3.3%) และยีนที่น่าจะเกี่ยวข้องกับการ ตอบสนองต่อไวรัส เช่น chelonianin, cathepsin B-like cysteine protease precursor, translational controlled tumor protein (TCTP), cyclophilin, peritrophin และ thrombospondin เป็นต้น อย่างไรก็ตามหน้าที่ในการตอบสนองต่อเชื้อไวรัสของยีนเหล่านี้จำเป็นต้องมี การศึกษาต่อไป นอกจากนี้ยังพบยีน ASF1 (anti-silencing factor1) ซึ่งพบครั้งแรกในยีสต์ (Saccharomyces cerevisiae) ทำหน้าเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโครมาตินซึ่งมีผลต่อการกระตุ้นการแสดงออก ของยีนในยีสต์ จากการแยกและศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์พบว่า ASF1 ที่พบในกุ้ง ประกอบด้วย 957 นิวคลีโอ ไทด์และแปลรหัสให้โปรตีนที่มีกรดอะมิโนจำนวน 200 ตัว และจากการศึกษาระดับการแสดงออกพบว่า ASF1 มีการแสดงออกกระจายอยู่ในหลายอวัยวะ โดยพบระดับการแสดงออกสูงทีสุดในกล้ามเนื้อของกุ้งที่ปกติและใน เม็ดเลือดของกุ้งที่ติดเชื้อ YHV ระดับการแสดงออกที่ลดลงของ ASF1 สามารถพบได้ในเกือบทุกอวัยวะของกุ้ง ที่ติดเชื้อ ยกเว้นในเม็ดเลือดซึ่งมีการแสดงออกเพิ่มขึ้นเล็กน้อย การแสดงออกที่ลดลงอย่างมากพบในกล้ามเนื้อ เหงือก และตับ จากการศึกษาก่อนหน้านี้แสดงให้เห็น ทั้งสามอวัยวะนี้เป็นอวัยวะแรกๆที่สามารถพบการติดเชื้อ ไวรัสหัวเหลือง และมีการตายของเซลล์เกิดขึ้น จากการแสดงให้เห็นว่า การแสดงออกที่ลดลงของ ASF1 เนื่องมาจากการติดเชื้อไวรัส และอาจจะมีผลกระทบต่อการควบคุมการแสดงออกของยีนที่ทำหน้าที่ต่างๆในเซลล์
บทคัดย่อ (EN): The yellow head virus (YHV) is a causative agent of yellow head disease in shrimp farming. This virus was first observed in Thailand and causes mass mortality in shrimp farming. This study was undertaken to investigate the gene expression profile of YHV infected shrimp. The cDNA library was constructed from the samples of lymphoid organs of YHV-infected shrimp inorder to identify the genes that are associated with shrimp immunity. From this library, 887 clones were randomly selected for EST (expressed sequence tags) sequencing, then they were searched for homologies in the GenBank database with the BlastX program. 452 clones (51.0%) showed significant homology with known genes in the database, whereas 435 EST clones (49.0%) did not show any significant homology to the known genes. The putative defense and homeostasis proteins accounted for 3.3% (15 clones). These genes might play a role during viral infection due to chelonianin (basic protease inhibitor, serine protease analogue), cathepsin B-like cysteine protease precursor, and lipoprotein localization factor, translational controlled tumor protein (TCTP), cyclophilin, peritrophin and thrombospondin. Whether these gene products are involved in response to viral infection, functional studies of these genes remain to be proven. ASF1 (anti-silencing factor1) is the histone chaperone H3/H4 binding protein, it plays an important role in assembly and disassembly of the chromatin. ASF1 is required for transcriptional activation in yeast (Saccharomyces cerevisiae). Shrimp ASF1 cDNA consists of 957 nucleotides encoding 200 amino acid residues. The amino acid sequence of shrimp ASF1 was similar to those of fruit flies, and other invertebrate and vertebrate ASF1 sequences. RT-PCR analysis has show that ASF1 expression was down-regulated in moribund shrimp, especially in the muscle, gill and hepatopancreas. A previous study indicated that these organs were a primary site of YHV infection and showed different degrees of cellular apoptosis. This study indicated that the down regulation of ASF1 expression was induced by viral infection and this may affect transcriptional regulation of the host cells.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=510&obj_id=5313
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Complementary
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: การเพาะเลี้ยงกุ้งกุลาดำเป็นอุตสาหกรรมที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจต่อประเทศไทย โดยไทยสามารถ ส่งออกกุ้งกุลาดำได้เป็นอันดันหนึ่งของโลก ต่อมาในระยะหลังปริมาณการส่งออกกุ้งของไทยลดลงเนื่องจากการ เกิดโรคระบาดซึ่งมีสาเหตุมาจากเชื้อไวรัส โดยเฉพาะเชื้อไวรัสหัวเหลือง (YHV) ทำให้เกิดการตายของกุ้งเป็น จำนวนมาก เพื่อศึกษาการแสดงออกของยีนในกุ้งกุลาดำที่ถูกกระต้นด้วยเชื้อไวรัสหัวเหลือง จึงสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลือง เมื่อสุ่มเลือกโคลนจำนวน 887 โคลน มาหาลำดับ นิวคลีโอไทด์ และเปรียบเทียบกับยีนที่มีรายงานแล้วใน GenBankโดยใช้โปรแกรม BlastX พบว่า 452 โคลน (51%) มีลำดับนิวคลีโอไทด์เหมือนกับยีนที่รายงานแล้วในขณะที่ 435 โคลน (49%) ไม่เหมือนกับยีนที่มีรายงานใน GenBank พบยีนที่เกี่ยวข้องกับระบบภูมิคุ้มกันจำนวน 15 โคลน (3.3%) และยีนที่น่าจะเกี่ยวข้องกับการ ตอบสนองต่อไวรัส เช่น chelonianin, cathepsin B-like cysteine protease precursor, translational controlled tumor protein (TCTP), cyclophilin, peritrophin และ thrombospondin เป็นต้น อย่างไรก็ตามหน้าที่ในการตอบสนองต่อเชื้อไวรัสของยีนเหล่านี้จำเป็นต้องมี การศึกษาต่อไป นอกจากนี้ยังพบยีน ASF1 (anti-silencing factor1) ซึ่งพบครั้งแรกในยีสต์ (Saccharomyces cerevisiae) ทำหน้าเกี่ยวข้องกับการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างของโครมาตินซึ่งมีผลต่อการกระตุ้นการแสดงออก ของยีนในยีสต์ จากการแยกและศึกษาลำดับนิวคลีโอไทด์พบว่า ASF1 ที่พบในกุ้ง ประกอบด้วย 957 นิวคลีโอ ไทด์และแปลรหัสให้โปรตีนที่มีกรดอะมิโนจำนวน 200 ตัว และจากการศึกษาระดับการแสดงออกพบว่า ASF1 มีการแสดงออกกระจายอยู่ในหลายอวัยวะ โดยพบระดับการแสดงออกสูงทีสุดในกล้ามเนื้อของกุ้งที่ปกติและใน เม็ดเลือดของกุ้งที่ติดเชื้อ YHV ระดับการแสดงออกที่ลดลงของ ASF1 สามารถพบได้ในเกือบทุกอวัยวะของกุ้ง ที่ติดเชื้อ ยกเว้นในเม็ดเลือดซึ่งมีการแสดงออกเพิ่มขึ้นเล็กน้อย การแสดงออกที่ลดลงอย่างมากพบในกล้ามเนื้อ เหงือก และตับ จากการศึกษาก่อนหน้านี้แสดงให้เห็น ทั้งสามอวัยวะนี้เป็นอวัยวะแรกๆที่สามารถพบการติดเชื้อ ไวรัสหัวเหลือง และมีการตายของเซลล์เกิดขึ้น จากการแสดงให้เห็นว่า การแสดงออกที่ลดลงของ ASF1 เนื่องมาจากการติดเชื้อไวรัส และอาจจะมีผลกระทบต่อการควบคุมการแสดงออกของยีนที่ทำหน้าที่ต่างๆในเซลล์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Jutamas Ngopon. "การสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลืองConstruction of cDNA library of Lymphoid Organ of YHV infected shrimp (penaeus monodon)". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2548

Jutamas Ngopon. "การสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลืองConstruction of cDNA library of Lymphoid Organ of YHV infected shrimp (penaeus monodon)". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2548. Print.



TARR Wordcloud:
การสร้างห้องสมุด cDNA จากอวัยวะน้ำเหลืองของกุ้งกุลาดำที่ติดเชื้อไวรัสหัวเหลือง
Jutamas Ngopon
มหาวิทยาลัยมหิดล
2548
การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ การศึกษาความแตกต่างของแบบแผนโปรตีนในกุ้ง penaeus vannamei ที่อยู่รอดจากการติดเชื้อไวรัสหัวเหลืองอย่างเฉียบพลัน การศึกษาแหลมสิงห์ไวรัสในเนื้อเยื่อประสาทของกุ้งกุลาดำ การศึกษาเปรียบเทียบระหว่างกุ้งขาวแปซิฟิก Penaeus vannamei ที่รอดชีวิตกับกุ้งที่ตายภายหลังการติดเชื้อไวรัสโรคตัวเหลือง การโคลนชิ้น cDNA ของตัวรับ 5-HT จากกุ้งกุลาดำ การตรวจสอบการเป็นภาหะของไวรัสโรคหัวเหลืองในกุ้งสกุล Macrobrachium การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ ประสิทธิผลของ bronopol ในการยับยั้งเชื้อวิบริโอและความเป็นพิษต่อกุ้งกุลาดำ (Penaeus Mondon) วัยอ่อน การลดปริมาณสารอาหารตกค้างและปรับปรุงคุณภาพของบ่อกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon) ด้วยเชื้อบาซิลลัส การศึกษากระบวนการยับยั้งการติดเชื้อไวรัสเดงกี่สายพันธุ์ที่ 2 ในเซลล์เลี้ยงเชื้อ โดยสารต้านไวรัส nitric oxide, mycophenolic acid และ ribavirin
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair