สืบค้นงานวิจัย
ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมา สาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงา
สุภาพร กลิ่นคง - มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
ชื่อเรื่อง: ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมา สาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงา
ชื่อเรื่อง (EN): Study of Genetic Diversity of Phytoplasmas Associated with Phyllody Disease of Sesame
บทคัดย่อ: ต้นงาที่แสดงอาการของโรคแตกพุ่มฝอยที่เก็บมาจากแหล่งปลูกงาสำคัญ 10 จังหวัดในประเทศไทย นำมาทำการเพิ่มปริมาณยีน 16S rRNA และ secY ด้วยเทคนิค polymerase chain reaction (PCR) โดยใช้ไพรเมอร์ R16F2/R16R2 และ AYsecYF1/AYsecYR1 ได้แถบดีเอ็นเอขนาดประมาณ 1,200 และ 1,300 คู่เบส ตามลำดับ นำข้อมูลของลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 16S rRNA ที่ได้จาก 15 ไอโซเลท เปรียบเทียบกับข้อมูลลำดับนิวคลี-โอไทด์ของเชื้อไฟโตพลาสมาที่เป็นตัวแทนกลุ่ม 15 กลุ่ม คือ 16SrI-16SrXV พบว่าเชื้อจัดอยู่ในกลุ่ม 16SrI (Aster yellows group) และ 16SrII (Peanut witches’-broom group) โดยมีค่าความคล้ายคลึงของลำดับนิวคลีโอไทด์ ? 97.5 เปอร์เซ็นต์ และจัดกลุ่มย่อยด้วยยีน 16S rRNA โดยการวิเคราะห์จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 16S rRNA ด้วยเทคนิคการวิเคราะห์ in silico restriction fragment length polymorphism (RFLP) พบว่า เชื้อจัดอยู่ในกลุ่มย่อย 16SrI-B และ 16SrII-A โดยมีค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึง > 0.97 ส่วนการจัดกลุ่มโดยใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน secY ของเชื้อกลุ่ม 16SrI ที่นำมาศึกษา เปรียบเทียบกับข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของเชื้อไฟโตพลาสมาที่เป็นตัวแทนกลุ่ม 11 กลุ่ม พบว่า เชื้อทั้ง 8 ไอโซเลท จัดอยู่ในกลุ่ม SecY-Iต้นงาที่แสดงอาการของโรคแตกพุ่มฝอยที่เก็บมาจากแหล่งปลูกงาสำคัญ 10 จังหวัดในประเทศไทย นำมาทำการเพิ่มปริมาณยีน 16S rRNA และ secY ด้วยเทคนิค polymerase chain reaction (PCR) โดยใช้ไพรเมอร์ R16F2/R16R2 และ AYsecYF1/AYsecYR1 ได้แถบดีเอ็นเอขนาดประมาณ 1,200 และ 1,300 คู่เบส ตามลำดับ นำข้อมูลของลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 16S rRNA ที่ได้จาก 15 ไอโซเลท เปรียบเทียบกับข้อมูลลำดับนิวคลี-โอไทด์ของเชื้อไฟโตพลาสมาที่เป็นตัวแทนกลุ่ม 15 กลุ่ม คือ 16SrI-16SrXV พบว่าเชื้อจัดอยู่ในกลุ่ม 16SrI (Aster yellows group) และ 16SrII (Peanut witches’-broom group) โดยมีค่าความคล้ายคลึงของลำดับนิวคลีโอไทด์ ? 97.5 เปอร์เซ็นต์ และจัดกลุ่มย่อยด้วยยีน 16S rRNA โดยการวิเคราะห์จากลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน 16S rRNA ด้วยเทคนิคการวิเคราะห์ in silico restriction fragment length polymorphism (RFLP) พบว่า เชื้อจัดอยู่ในกลุ่มย่อย 16SrI-B และ 16SrII-A โดยมีค่าสัมประสิทธิ์ความคล้ายคลึง > 0.97 ส่วนการจัดกลุ่มโดยใช้ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน secY ของเชื้อกลุ่ม 16SrI ที่นำมาศึกษา เปรียบเทียบกับข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ของเชื้อไฟโตพลาสมาที่เป็นตัวแทนกลุ่ม 11 กลุ่ม พบว่า เชื้อทั้ง 8 ไอโซเลท จัดอยู่ในกลุ่ม SecY-I
บทคัดย่อ (EN): Sesame plants (Sesamum indicum L.) with phyllody symptoms were collected from sesame plantations in 10 provinces of Thailand. The 16S rRNA and secY genes of phytoplasma were amplified by the polymerase chain reaction (PCR) using specific primers pairs of R16F2/R16R2 and AYsecYF1/AYsecYR1 which the expect amplified PCR products size of 1,200 and 1,300 bp respectively. Fifteen isolates of sesame phyllody phytoplasma were identified by using nucleotide sequences of 16S rRNA gene and further analyzed for the relationship with reference phytoplasma strains (16SrI-16SrXV group). The results indicated that the phytoplasma associated with sesame phyllody grouped into the 16SrI (Aster yellows group) and 16SrII (Peanut witches’-broom group) with ? 97.5% similarity. The subgroup of phytoplasmas were identified by in silico analysis of 16S rRNA restriction fragment length polymorphism (RFLP). The RFLP patterns of 16S rRNA gene sequence were classified as a 16SrI-B and 16SrII-A subgroup with a similarity coefficient > 0.97. Result of phylogenetic tree analysis of secY gene sequences of 8 isolates, which grouped in the 16SrI, were classified as SecY-I group.Sesame plants (Sesamum indicum L.) with phyllody symptoms were collected from sesame plantations in 10 provinces of Thailand. The 16S rRNA and secY genes of phytoplasma were amplified by the polymerase chain reaction (PCR) using specific primers pairs of R16F2/R16R2 and AYsecYF1/AYsecYR1 which the expect amplified PCR products size of 1,200 and 1,300 bp respectively. Fifteen isolates of sesame phyllody phytoplasma were identified by using nucleotide sequences of 16S rRNA gene and further analyzed for the relationship with reference phytoplasma strains (16SrI-16SrXV group). The results indicated that the phytoplasma associated with sesame phyllody grouped into the 16SrI (Aster yellows group) and 16SrII (Peanut witches’-broom group) with ? 97.5% similarity. The subgroup of phytoplasmas were identified by in silico analysis of 16S rRNA restriction fragment length polymorphism (RFLP). The RFLP patterns of 16S rRNA gene sequence were classified as a 16SrI-B and 16SrII-A subgroup with a similarity coefficient > 0.97. Result of phylogenetic tree analysis of secY gene sequences of 8 isolates, which grouped in the 16SrI, were classified as SecY-I group.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
คำสำคัญ: ยีน
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

สุภาพร กลิ่นคง. "ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมา สาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงาStudy of Genetic Diversity of Phytoplasmas Associated with Phyllody Disease of Sesame". มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 2553

สุภาพร กลิ่นคง. "ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมา สาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงาStudy of Genetic Diversity of Phytoplasmas Associated with Phyllody Disease of Sesame". มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์. 2553. Print.



TARR Wordcloud:
ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมา สาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงา
สุภาพร กลิ่นคง
มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
30 กันยายน 2553
ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมาสาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงา ศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของเชื้อไฟโตพลาสมา สาเหตุโรคแตกพุ่มฝอยของงา การศึกษาชนิดแมลงพาหะและพัฒนาแอนติบอดีเพื่อตรวจเชื้อไฟโตพลาสมาสาเหตุโรคพุ่มแจ้ของมันสำปะหลัง การศึกษาโครงสร้างและความหลากหลายทางพันธุกรรมในแมวพันธุ์ไทยเปรียบเทียบกับพันธุ์ต่างประเทศ เพื่อประโยชน์ในงานทางด้านนิติวิทยาศาสตร์ นวัตกรรมการตรวจสอบเชื้อไฟโตพลาสมาและการควบคุมโรคใบขาวอ้อยโดยชีววิธี การแพร่กระจายของเพลี้ย Yamatotettix flavovittatus และ Matsumuratettix hiroglyphicus แมลงพาหะโรคใบขาวอ้อยในพื้นที่ภาคกลางตอนบนของประเทศไทยและการตรวจสอบเชื้อไฟโตพลาสมาสาเหตุโรคใบขาวอ้อย การใช้สารกระตุ้นชีวภาพชนิดไคโตซานเพื่อลดอาการและปริมาณของเชื้อไฟโตพลาสมา และการระบาดของโรคใบขาวในอ้อย ความหลากหลายทางพันธุกรรมของยีนส์ Amylase ในโคเนื้อไทย ความหลากหลายของ pathotype ของเชื้อราสาเหตุโรคไหม้ข้าวในปี 2550/51 และยีนต้านทานกว้างขวางที่เป็นประโยชน์ในภาคเหนือตอนล่าง ความสัมพันธ์ของความแตกต่างทางพันธุกรรมของยีน Insulin-like growth factor II (IGF-II) ต่อลักษณะการเจริญเติบโตและขนาดร่างกายในประชากรสุกรเชิงการค้าแห่งหนึ่ง
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair