สืบค้นงานวิจัย
การประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์
กัลยา เก่งวิกย์กรรม - กรมปศุสัตว์
ชื่อเรื่อง: การประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์
ชื่อเรื่อง (EN): Estimation of genetic variability in the characterization of Thai Holstein Dairy Crossbred Cattle using 11 Microsatellite Markers.
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: กัลยา เก่งวิกย์กรรม
บทคัดย่อ: โคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ เป็นโคนมที่พัฒนาปรับปรุงพันธุ์มาอย่างต่อเนื่องเพื่อให้มีลักษณะที่เหมาะสม ให้ผลผลิตสูงในประเทศไทย การศึกษาในครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อการประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์ ตัวอย่างที่ทำการศึกษาเป็นโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์รวม 588 ตัว ที่มีสายเลือดโฮลสไตน์ 100, 93.75%, 90.63%, 87.5%, 81.25%, และ 75 เปอร์เซ็นต์ จำนวน 30, 110, 41, 242, 35, และ 131 ตัว ตามลำดับ ตัวอย่างดีเอ็นเอของสัตว์แต่ละตัวได้นำมาเพิ่มขยายชิ้นส่วนดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์ด้วยปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส ซึ่งใช้ไพรเมอร์ติดสีฟลูออเรสเซนต์จำนวน 11 เครื่องหมาย ได้แก่ TGLA227, BM2113, TGLA53, ETH10, SPS115, TGLA126, TGLA122, INRA23, ETH3, ETH225 และ BM1824 เมื่อนำผลขนาดชิ้นส่วนไมโครแซทเทิลไลท์ดีเอ็นเอแต่ละเครื่องหมายของแต่ละตัวอย่างมาวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรม พบว่ามีความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมสูงโดยมีค่าเฉลี่ยเฮทเทอโรซัยโกซิตี (He) เท่ากับ 0.8932 มีค่าเฉลี่ยรูปแบบพันธุกรรม (PIC) เท่ากับ 0.8833 ค่าเฉลี่ย fixation index FIS และ FIT เท่ากับ -0.0131 และ 0.0063 ส่วนค่า FST มีค่า 0.0837-0.1466 ซึ่งแสดงว่าประชากรโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ที่ทำการศึกษานี้มีส่วนน้อยเพียง 1.31 % ที่เป็นเฮทเทอโรซัยโกตเกินในระหว่างกลุ่ม และมีส่วนน้อยเพียง 0.63 % ที่เป็นเฮทเทอโรซัยโกที่ขาดในประชากรทั้งหมด ส่วนในประชากรกลุ่มย่อยมีความแตกต่างทางพันธุกรรมปานกลาง (8.37-14.66%) ค่าสหสัมพันธ์เฉลี่ยของลายพิมพ์พันธุกรรมของกลุ่มโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ที่มีสายเลือดโฮลสไตน์ 100, 93.75, 90.63, 87.5, 81.25 และ 75 เปอร์เซ็นต์ เท่ากับ 0.4218, 0.1300, 0.2797, 0.1106, 0.3353 และ 0.1529 ตามลำดับ เมื่อนำค่าความห่างทางพันธุกรรมมาสร้างความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมแบบต้นไม้พบว่าสามารถจำแนกออกเป็น 3 กลุ่มย่อย คือ โคนมไทยโฮลสไตน์สายเลือด 75% โคนมไทยโฮลสไตน์สายเลือดอื่นๆ และโคนมโฮลสไตน์พันธุ์แท้ ผลการศึกษาความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์ในครั้งนี้ สามารถนำเครื่องหมายไมโครแซทเทิลไลท์จำนวน 11 เครื่องหมายมาประยุกต์ใช้ในการตรวจความแตกต่างและหาเปอร์เซ็นต์สายเลือดโฮลสไตน์ในฝูงประชากรโคนมโฮลสไตน์ได้
บทคัดย่อ (EN): Thai Holstein crossbred dairy cattle are progressively developed for high milk production in tropical conditions of Thailand. The aim of this study was to evaluate DNA fingerprint diversity in Thai Holstein crossbred dairy cattle using microsatellite markers. A total of 588 animals including 30, 110, 41, 242, 35 and 131 animals of 100, 93.75, 90.63, 87.5 and 75 % Holstein, respectively, were used in this study. DNA samples of each animals were amplified microsatellite DNA by polymerase chain reaction using fluorescently-labelled primer sets of 11 loci including TGLA227, BM2113, TGLA53, ETH10, SPS115, TGLA126, TGLA122, INRA23, ETH3, ETH225 and BM1824. DNA fragments of 11 loci in each sample were analyzed genetic diversity of DNA fingerprint. The results revealed that high genetic diversity of DNA fingerprint was observed with 0.8932 of mean expected heterozygosity (He) and 0.8833 of mean polymorphic information content (PIC). The mean fixation index (FIS) and FIT were found to be -0.0131, 0.0063 and 0.0191, respectively, as well as FST was 0.0837-0.1466. The results indicates that there is a little shortfall, 1.31% of heterozygotes excess among group and 0.63% of heterozygotes deficit in the population. There was a moderate genetic differentiation (8.37-14.66%) among Thai Holstein dairy cattle groups. The mean correlation of multilocus analysis for single populations were 0.4218, 0.1300, 0.2797, 0.1106, 0.3353 and 0.1529 of 100, 93.75, 90.63, 87.5, 81.25 and 75 % Holstein populations, respectively. Phylogenetic tree was constructed using genetic distance by UPGMA method showing 3 clusters of 75% Holstein, 100% Holstein and the other Holstein crossbred dairy cattle. The results of this study suggested that 11 microsatellite markers can be used for discriminating and detecting unknown percentage of Holstein cattle population.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: กรมปศุสัตว์
คำสำคัญ: เครื่องหมายดีเอ็นเอไมโครแซทเทิลไลท์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

กัลยา เก่งวิกย์กรรม. "การประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์Estimation of genetic variability in the characterization of Thai Holstein Dairy Crossbred Cattle using 11 Microsatellite Markers.". กรมปศุสัตว์. 2552

กัลยา เก่งวิกย์กรรม. "การประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์Estimation of genetic variability in the characterization of Thai Holstein Dairy Crossbred Cattle using 11 Microsatellite Markers.". กรมปศุสัตว์. 2552. Print.



TARR Wordcloud:
การประเมินความหลากหลายของลายพิมพ์พันธุกรรมในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์ด้วยเครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดไมโครแซทเทิลไลท์
กัลยา เก่งวิกย์กรรม
กรมปศุสัตว์
30 กันยายน 2552
กรมปศุสัตว์
การจำแนกกลุ่มพันธุกรรมและการตรวจหาเครื่องหมายดีเอ็นเอของไก่กระดูกดำไทยโดยใช้ไมโครแซทเทิลไลท์ การศึกษาจีโนมิกของข้าวป่าชนิด Oryza rufipogon โดยใช้เครื่องหมายทางพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ การจำแนกกลุ่มพันธุกรรมและการตรวจหาเครื่องหมายดีเอ็นเอของไก่เนื้อดำไทยโดยใช้ไมโครแซทเทลไลท์ การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์เพื่อศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของปลาท้องถิ่นบางชนิดในแม่น้ำน่าน การศึกษาความหลากหลายและการจำแนกกลุ่มพันธุกรรมของความไทยในพื้นที่ลุ่มน้ำโขงจากข้อมูลไมโครแซทเทิลไลท์ การเปรียบเทียบโมเดลทางพันธุกรรมระหว่างค่าความแปรปรวนของความคลาดเคลื่อนแบบคงที่และไม่คงที่ในโคนมลูกผสมไทยโฮลสไตน์โดยใช้โมเดลวันทดสอบรีเกรซชั่นสุ่ม การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของข้าว โดยใช้เครื่องหมายโมเลกุล SSR การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมในประชากรปลาพลวงหินในประชากรธรรมชาติ บริเวณแม่น้ำน่าน โดยใช้เครื่องหมายพันธุกรรมไมโครแซทเทลไลท์ การศึกษาความหลากหลายของยีน HSP 70 ในไก่พื้นเมืองไทยสายพันธุ์ต่างๆ การพัฒนาเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์จากฐานข้อมูล EST เพื่อวิเคราะห์ความหลากหลายทางพันธุกรรมของพืชสกุล Curcuma
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair