สืบค้นงานวิจัย
การจำแนกพันธุ์และเพศมะละกอโดยใช้เทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF)
ทรงพล สมศรี - กรมวิชาการเกษตร
ชื่อเรื่อง: การจำแนกพันธุ์และเพศมะละกอโดยใช้เทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF)
ชื่อเรื่อง (EN): Identification of Certain Papaya Cultivars and Sex Identification in Papaya by DNA Amplification Fingerprinting (DAF)
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ทรงพล สมศรี
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Songpol Somsri
บทคัดย่อ: การศึกษาและตรวจสอบลักษณะประจำพันธุ์ในระดับพันธุกรรมมะละกอ (Carica papaya L.) ด้วยเทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF) และความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมด้วยวิธี UPGMA จากการใช้ไพร์เมอร์ที่คัดเลือกแล้วจำนวน 11 ไพร์เมอร์ ได้แก่ OPA 04, OPA 08, OPB 05, OPB 09, OPC 03, OPC 05, COP 06, OPC 10, OPE 17, OPG 01 และ OPS 10 ที่ศูนย์วิจัยพืขสวนจันทบุรี และสถาบันวิจัยพืชสวน พบว่า การจำแนกพันธุ์มะละกอ 14 พันธุ์ด้วยเทคนิค DAF โดยใช้ 11 ไพร์เมอร์ขยายปริมาณแถบ DNA ได้ทั้งหมด 129 แถบ โดยพบแถบที่แสดงความแตกต่าง (polymorphic loci) 28 แถบ คิดเป็น polymorphic loci 21.71 % และเมื่อวิเคราะห์ความแตกต่างของแถบ DNA แบ่งได้เป็น 3 กลุ่ม โดยกลุ่มที่ 1 ประกอบด้วยพันธุ์ปากช่องแขกดำ Mexico Mammy และแขกนวล กลุ่มที่ 2 ประกอบด้วยพันธุ์โกโก้ก้านดำ Apple Tainung แม่เหี๊ยะ Florida Tolerant, Sunset และ Mexico Amerilla กลุ่มที่ 3 ประกอบด้วยพันธุ์ Taiwan Kapoho Solo และ Richter สำหรับอัตราส่วนของสารละลายที่เหมาะสมที่สุด ในการขยายเพิ่มปริมาณแถบ DHA ของมะละกอ ด้วยเทคนิค DAF พบว่า ประกอบด้วย genomic DNA 2.5 ไมโครลิตร จำนวน 30 นาโนกรัม แมกนิเซียไอออน 5 มิลลิโมลาร์ ไพร์เมอร์ 10 mer 2.5 มิลลิโมลาร์ต่อสารละลาย (reaction solution) 20 ไมโครลิตร นอกจากนี้ได้จำแนกเพศของมะละกอในระยะต้นกล้าโดยไพร์เมอร์ทั้งหมด 52 ไพร์เมอร์ถูกนำมาใช้ในการวิเคราะห์แถบ DNA แบบ bulk sdgregate กับต้นมะละกอเพศผู้ เพศเมีย และต้นสมบูรณ์เพศ (กระเทย) ของลูกผสมชั่วที่ 1 พบว่า ไพร์เมอร์ OPA-06 (5' GGT CCC TGAC 3') ใช้จำแนกเพศของมะละกอได้ โดยจะให้ความแตกต่างของแถบ DNA (polymorphic) 2 แถบ ๆ แรกมีขนาดประมาณ 365 base pairs (bp) จากต้นสมบูรณ์เพศ (กระเทย) และอีกแถบมีขนาดประมาณ 360 pb จากต้นเพศผู้ ส่วนเพศเมียไม่พบแถบทั้งสอง ต่อมาได้ทำการทดสอบไพร์เมอร์ OPA-06 กับมะละกอลูกผสมชั่วที่ 1 2 3 4 และพ่อแม่พันธุ์จำนวน 254 ต้น พบว่า จำแนกเพศได้อย่างถูกต้อง 88.18 % และได้ทำการทดสอบกับต้นมะละกอที่ได้จากการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อ 47 ต้น พบว่าสามารถใช้จำแนกเพศได้ถูกต้อง 100 %
บทคัดย่อ (EN): DNA amplification fingerprinting (DAF) was employed to study the relationships among fourteen cultivrs of the papaya (Carica papaya L.) collected from Srisaket and Chantaburi Horticultural Reserch Centre. Ten-base synthetic oligonucleotides were chosen that gave multiple PCR amplification products using papaya DNA as template. Using the 11 primers, a total of 129 distinct fragments were mplified. Cultivars were scored for the presence or absence of DAF fragments and grouped by cluster analysis using sample matching coefficients of similarity and the unweighted pair-group method with rithmetic average (UPGMA). The results identified three groups of cultivars. The first group was coomprised of Cocoa Karn Dum, Apple, Tainung, Mae Hia, Florida Tolerant, Sunset and Mexico Amerilla. The third group was comprised of Taiwan, Kapoho Solo and Richter. The DAF Technology is a rapid, precise andsensitive techniques for genomic analysis, and is recomended as a accurate method to identify plantgenotypes within the same species. The best DAF reaction mixture contined 30 ng of genomic DNA, 5 mM magnesium ion, 2.5 mM primer per 20 ui reaction. A total of 52 primers were used inbulk segregate analysis (BSA) against of male, fermale andhermaphroditic plants. The OPA 06 (5' GGT CCC TGAC 3') primer could be used to identify the sex type of papaya plants. This primer produced two polymorphic bands: oneof ~ 365 base pirs (bP) from hermaphrodite bulk DNA and the other of ~ 360 bp from the male bulk DNA. Neither band was detected for females. Evaluation of the accuracy of OPA 06 analysis was done using 254 plants of different generations and their original parents, and the analysis correctly identify sex type for 88.18% of the plants. The final experiment, 47 tissue cultured hermaphrodite plants of the Khaeg Dum cultivar were examined using OPA 06 , and the sex type was identified correctly for 100% of teh plants.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: กรมวิชาการเกษตร
คำสำคัญ: พันธุ์มะละกอลูกผสมชั่วที่ 1 2 3 และ 4
คำสำคัญ (EN): DAF technique
เจ้าของลิขสิทธิ์: กรมวิชาการเกษตร
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ทรงพล สมศรี. "การจำแนกพันธุ์และเพศมะละกอโดยใช้เทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF)Identification of Certain Papaya Cultivars and Sex Identification in Papaya by DNA Amplification Fingerprinting (DAF)". กรมวิชาการเกษตร. 2549

ทรงพล สมศรี. "การจำแนกพันธุ์และเพศมะละกอโดยใช้เทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF)Identification of Certain Papaya Cultivars and Sex Identification in Papaya by DNA Amplification Fingerprinting (DAF)". กรมวิชาการเกษตร. 2549. Print.



TARR Wordcloud:
การจำแนกพันธุ์และเพศมะละกอโดยใช้เทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF)
ทรงพล สมศรี
กรมวิชาการเกษตร
2549
การศึกษาจำแนกสายพันธุ์ทุเรียนลูกผสมชั่วที่ 1 ที่ดีเด่นด้วยเทคนิค DNA Amplification Fingerprinting (DAF) การขยายพันธุ์มะละกอ (Carica papaya L.) สายพันธุ์ฮอลแลนด์ในสภาพปลอดเชื้อ การตรวจสอบเพศมะละกอแบบแม่นยำด้วยเทคนิค PCR การแสดงออกของพันธุ์และสายพันธุ์ถั่วฝักยาวในการปลูกแบบอินทรีย์และแบบใช้สารเคมี ศึกษาลักษณะประจำพันธุ์หม่อนโดยใช้ DNA marker การแปรรูปมะละกอ การเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่ออโกลนีมา (Aglaonema) โดยใช้เทคนิค Temporary Immersion การประยุกต์ใช้ลายพิมพ์ดีเอ็นเอเพื่อจำแนกสายพันธุ์กล้วยน้ำว้า การจำแนกชนิด พันธุ์ สายต้นของทุเรียน (Durio spp.) ด้วยเทคนิคดีเอนเอ . Amplification Fingerprinting (DAF) การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของพันธุ์หน้าวัวโดยเทคนิค Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair