สืบค้นงานวิจัย
การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ
Busabun Chaisalee - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ
ชื่อเรื่อง (EN): Amplified fragment length polymorphism DNA markers : usefulness for genetic mapping of Penaeus monodon
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Busabun Chaisalee
บทคัดย่อ: กุ้งกุลาดำเป็นสัตว์น้ำเศรษฐกิจที่สำคัญของประเทศไทย การเลี้ยงกุ้งที่เพิ่มจำนวนมากขึ้นส่งผลให้เกิดผลกระทบหลายอย่าง โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ปัญหาการคัดเลือกพ่อแม่พันธุ์ที่เหมาะสมของกุ้ง เทคนิคและความรู้ทางด้านอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์ได้ถูกนำมาใช้เพื่อช่วยในการแก้ปัญหาดังกล่าว ในงานวิจัยนี้ได้พัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรม AFLP ที่จำเพาะต่อการเติบโตของกุ้งกุลาดำและได้เปลี่ยนเครื่องพันธุกรรม AFLP เป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR ซึ่งเป็นเครื่องหมายพันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพและเหมาะสมกับการนำไปประยุกต์ใช้ในการคัดเลือกสายพันธุ์ โดยได้ใช้กุ้งกุลาดำที่มีอายุ 151 วัน และ จำแนกเป็น 4 กลุ่มตามเพศและขนาด DNA ของกุ้งแต่ละกลุ่มได้ถูกนำมารวมกันเพื่อใช้ในการวิเคราะห์ AFLP โดยใช้ไพรเมอร์จำนวน 96 คู่ระหว่าง EcoRI-ANN และ MseI-GNN ผลการวิเคราะห์ พบ 33 โพลีมอร์ฟิซึม จากไพรเมอร์ 24 คู่ หลังจากนี้ ไพรเมอร์ 24 คู่นี้ได้ถูกนำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างจำนวน 24 ตัวอย่าง พบว่าให้ผล 2 โพลีมอร์ฟิซึม นอกจากนี้ 80 คู่ไพร์เมอร์ระหว่าง EcoRI-ANN และ MseI-GNN ได้นำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้ง 24 ตัว ที่ใช้ในการรวม DNA เบื้องต้นและพบว่ามี 91 โพลีมอร์ฟิซึม จาก 36 คู่ไพร์เมอร์ เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP จำนวน 8 เครื่องหมายได้นำมาพัฒนาเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR และได้นำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้งที่ใช้ในการวิเคราะห์ AFLP และพบว่าเครื่องหมาย SFE9M38-3 SCAR สามารถตรวจสอบความแตกต่างระหว่างกุ้งกุลาดำตัวใหญ่และตัวเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 71% นอกจากนี้ เครื่องหมาย SFE9M38-3 SCAR ยังให้ผลความถูกต้องประมาณ 62% เมื่อนำมาทดสอบกับกุ้งกุลาดำอีกจำนวน 86 ตัว เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP และ SCAR ที่พัฒนาขึ้นสามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการคัดเลือกและพัฒนาสายพันธุ์ รวมถึงการสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมของกุ้งกุลาดำได้ต่อไป
บทคัดย่อ (EN): Penaeus monodon is one of the economically important species in Thailand. Farming of P. monodon has dramatically increased, and is also facing several problems such as infectious diseases and poor broodstock selection. The objectives for this project were to develop Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers specific to growth trait of P. monodon using E-ANN/M-GNN primer combinations, and to convert identified AFLP markers to Sequence Characterized Amplified Region (SCAR) markers. The AFLP technique was used to identify polymorphisms from 4 pools of shrimp, large male, large female, small male and small female pools using 96 primer combinations of EcoRI-ANN/MseI-GNN. Of these, 24 primer combinations generated 33 polymorphic bands. All 24 primer combinations were used to amplify with 24 individual samples that were used to construct the DNA pools, resulting in 2 polymorphic markers. Moreover, an additional 80 primer combinations were screened with individual samples, resulting 91 polymorphic markers which were generated from 36 primer combinations. In order to exploit the identified AFLP markers to Marker Assisted Selection (MAS) program, the AFLP markers should be converted to SCAR markers. The eight AFLP markers that showed P-values of less than 0.05 were converted to SCAR markers. The results revealed that the SFE9M38-3 SCAR marker showed polymorphism in genomic DNA of 24 individual samples with 71% phenotype prediction. This SCAR marker was further tested with 86 additional shrimp samples indicating that it can predict the phenotype of growth trait with 62% phenotype prediction. In conclusion, the results of this study demonstrated that the SFE9M38-3 marker seems to be a potential marker that can be used to exploit the MAS program of shrimp.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=2782&obj_id=2428
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Penaeus monodon
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: กุ้งกุลาดำเป็นสัตว์น้ำเศรษฐกิจที่สำคัญของประเทศไทย การเลี้ยงกุ้งที่เพิ่มจำนวนมากขึ้นส่งผลให้เกิดผลกระทบหลายอย่าง โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ปัญหาการคัดเลือกพ่อแม่พันธุ์ที่เหมาะสมของกุ้ง เทคนิคและความรู้ทางด้านอณูชีววิทยาและพันธุศาสตร์ได้ถูกนำมาใช้เพื่อช่วยในการแก้ปัญหาดังกล่าว ในงานวิจัยนี้ได้พัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรม AFLP ที่จำเพาะต่อการเติบโตของกุ้งกุลาดำและได้เปลี่ยนเครื่องพันธุกรรม AFLP เป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR ซึ่งเป็นเครื่องหมายพันธุกรรมที่มีประสิทธิภาพและเหมาะสมกับการนำไปประยุกต์ใช้ในการคัดเลือกสายพันธุ์ โดยได้ใช้กุ้งกุลาดำที่มีอายุ 151 วัน และ จำแนกเป็น 4 กลุ่มตามเพศและขนาด DNA ของกุ้งแต่ละกลุ่มได้ถูกนำมารวมกันเพื่อใช้ในการวิเคราะห์ AFLP โดยใช้ไพรเมอร์จำนวน 96 คู่ระหว่าง EcoRI-ANN และ MseI-GNN ผลการวิเคราะห์ พบ 33 โพลีมอร์ฟิซึม จากไพรเมอร์ 24 คู่ หลังจากนี้ ไพรเมอร์ 24 คู่นี้ได้ถูกนำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างจำนวน 24 ตัวอย่าง พบว่าให้ผล 2 โพลีมอร์ฟิซึม นอกจากนี้ 80 คู่ไพร์เมอร์ระหว่าง EcoRI-ANN และ MseI-GNN ได้นำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้ง 24 ตัว ที่ใช้ในการรวม DNA เบื้องต้นและพบว่ามี 91 โพลีมอร์ฟิซึม จาก 36 คู่ไพร์เมอร์ เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP จำนวน 8 เครื่องหมายได้นำมาพัฒนาเป็นเครื่องหมายพันธุกรรม SCAR และได้นำไปวิเคราะห์กับตัวอย่างกุ้งที่ใช้ในการวิเคราะห์ AFLP และพบว่าเครื่องหมาย SFE9M38-3 SCAR สามารถตรวจสอบความแตกต่างระหว่างกุ้งกุลาดำตัวใหญ่และตัวเล็กได้ โดยมีความถูกต้องที่วิเคราะห์ได้ในเบื้องต้นประมาณ 71% นอกจากนี้ เครื่องหมาย SFE9M38-3 SCAR ยังให้ผลความถูกต้องประมาณ 62% เมื่อนำมาทดสอบกับกุ้งกุลาดำอีกจำนวน 86 ตัว เครื่องหมายพันธุกรรม AFLP และ SCAR ที่พัฒนาขึ้นสามารถนำมาประยุกต์ใช้ในการคัดเลือกและพัฒนาสายพันธุ์ รวมถึงการสร้างแผนที่ทางพันธุกรรมของกุ้งกุลาดำได้ต่อไป
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Busabun Chaisalee. "การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำAmplified fragment length polymorphism DNA markers : usefulness for genetic mapping of Penaeus monodon". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2548

Busabun Chaisalee. "การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำAmplified fragment length polymorphism DNA markers : usefulness for genetic mapping of Penaeus monodon". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2548. Print.



TARR Wordcloud:
การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรม AFLP เพื่อประยุกต์ใช้ในการสร้างแผนที่พันธุกรรมของกุ้งกุลาดำ
Busabun Chaisalee
มหาวิทยาลัยมหิดล
2548
การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมชนิด AFLP ที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายพันธุกรรมที่จำเพาะต่อการเจริญเติบโตของกุ้งกุลาดำ การสืบค้นเครื่องหมายทางพันธุกรรมที่จำเพาะต่อเพศในกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon โดยการวิเคราะห์ด้วยเอเอฟแอลพี การพัฒนาเครื่องหมายติดภายในและการประมาณค่าอัตราพันธุกรรมต่อการเติบโตของกุ้งกุลาดำ Penaeus monodon Fabricius, 1798 โดยวิธี Full-sib analysis การประยุกต์ใช้โพรไบโอติกในการเลี้ยงกุ้งกุลาดำ (Penaeus monodon) การพัฒนาระบบหมุนเวียนน้ำแบบปิดด้วยการใช้สาหร่ายและตัวกรองชีวภาพในการบำบัดในบ่อเลี้ยงกุ้งกุลาดำแบบพัฒนา การโคลนและการศึกษาหน้าที่ของ cDNA ที่สร้างโปรตีน Argonaute ในกุ้งกุลาดำ การพัฒนาเครื่องหมายทางพันธุกรรมของหอยเป๋าฮื้อเขตร้อนในประเทศไทย การแสดงออกทางพันธุกรรมของโปรตีนติดตามเพื่อการประยุกต์ใช้ทางภูมิคุ้มกันวิทยาและการศึกษาทางชีววิทยาระดับโมเลกุล การย่อยสลายของเสียบางชนิดในบ่อเลี้ยงกุ้งกุลาดำแบบพัฒนาโดยกลุ่มแบคทีเรีย
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair