สืบค้นงานวิจัย
การปรับปรุงวิถีการสังเคราะห์แป้งในพืชโดยวิธีการวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบในระดับจีโนม
ปภาพิต อิงคสุวรรณ - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
ชื่อเรื่อง: การปรับปรุงวิถีการสังเคราะห์แป้งในพืชโดยวิธีการวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบในระดับจีโนม
ชื่อเรื่อง (EN): Pathway Reconstruction of Starch biosynthesis Using Comparative Genomic Approach
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ปภาพิต อิงคสุวรรณ
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Papapit Ingkasuwan
บทคัดย่อ (EN): Starch is the important reserved carbohydrate in higher plants. The properties of starchdiffer with the plant origin and its variety. In the genomic era, genetic manipulation is anovel concept to improve the functional properties and the specific utilization ofstarches. An implementation of the genetic modification requires more understanding ofthe starch biosynthesis pathway and how it influences the functional properties ofstarch. Up to the present, the actual mechanism for starch biosynthesis or degradation isnot fully-understood.In this study, a putative starch biosynthesis pathway was reconstructed utilizing thecomplete genomic information of Arabidopsis thaliana via the comparative genomicsapproach. The study focused on 7 enzymes in amyloplast, includingphosphoglucomutase, ADP glucose pyrophosphorylase, starch synthase, branchingenzyme, debranching enzyme, disproportionating enzyme, and starch phosphorylase.The isoform clusters of each plastidial enzyme were identified by their sequencessimilarity and phylogenetic analysis.Using the starch and sucrose metabolisms from KEGG database as the model template,a more complete starch biosynthesis was successfully developed to include the majorpathways in amyloplast and the translocation mechanism of intermediate metabolitesbetween the cytosol and amyloplast. Of seven types of plastidial enzymes, starchsynthase showed the highest variation in the numbers of isoforms and genes in eachisoform. Moreover, two unknown proteins in starch synthesis of Arabidopsis thalianawere discovered. The two genes (At5g65685 and At5g65691) encoding for the newlyfoundproteins were predicted to associate with starch synthases of isoform-v. The twoproteins were orthologous to starch synthases isoform-v of rice (AAK98690). Thelocalization prediction of both sequences using PREDOTAR program (version 0.5)confirms both proteins having plastidial origins and hence involving starch biosynthesisof Arabidopsis.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=54&RecId=5050&obj_id=14516
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
คำสำคัญ (EN): Comparative Genomics Approach
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
รายละเอียด: Starch is the important reserved carbohydrate in higher plants. The properties of starchdiffer with the plant origin and its variety. In the genomic era, genetic manipulation is anovel concept to improve the functional properties and the specific utilization ofstarches. An implementation of the genetic modification requires more understanding ofthe starch biosynthesis pathway and how it influences the functional properties ofstarch. Up to the present, the actual mechanism for starch biosynthesis or degradation isnot fully-understood.In this study, a putative starch biosynthesis pathway was reconstructed utilizing thecomplete genomic information of Arabidopsis thaliana via the comparative genomicsapproach. The study focused on 7 enzymes in amyloplast, includingphosphoglucomutase, ADP glucose pyrophosphorylase, starch synthase, branchingenzyme, debranching enzyme, disproportionating enzyme, and starch phosphorylase.The isoform clusters of each plastidial enzyme were identified by their sequencessimilarity and phylogenetic analysis.Using the starch and sucrose metabolisms from KEGG database as the model template,a more complete starch biosynthesis was successfully developed to include the majorpathways in amyloplast and the translocation mechanism of intermediate metabolitesbetween the cytosol and amyloplast. Of seven types of plastidial enzymes, starchsynthase showed the highest variation in the numbers of isoforms and genes in eachisoform. Moreover, two unknown proteins in starch synthesis of Arabidopsis thalianawere discovered. The two genes (At5g65685 and At5g65691) encoding for the newlyfoundproteins were predicted to associate with starch synthases of isoform-v. The twoproteins were orthologous to starch synthases isoform-v of rice (AAK98690). Thelocalization prediction of both sequences using PREDOTAR program (version 0.5)confirms both proteins having plastidial origins and hence involving starch biosynthesisof Arabidopsis.
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ปภาพิต อิงคสุวรรณ. "การปรับปรุงวิถีการสังเคราะห์แป้งในพืชโดยวิธีการวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบในระดับจีโนมPathway Reconstruction of Starch biosynthesis Using Comparative Genomic Approach". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2546

ปภาพิต อิงคสุวรรณ. "การปรับปรุงวิถีการสังเคราะห์แป้งในพืชโดยวิธีการวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบในระดับจีโนมPathway Reconstruction of Starch biosynthesis Using Comparative Genomic Approach". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2546. Print.



TARR Wordcloud:
การปรับปรุงวิถีการสังเคราะห์แป้งในพืชโดยวิธีการวิเคราะห์เชิงเปรียบเทียบในระดับจีโนม
ปภาพิต อิงคสุวรรณ
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
2546
การปรับปรุงคุณภาพแผ่นแป้งแหนมเนืองโดยการใช้แป้งผสมระหว่างแป้งข้าวเจ้ากับแป้งพุทธรักษา แนวทางการใส่ปุ๋ยข้าวในดินเปรี้ยวจัดโดยอาศัยการวิเคราะห์วิเคราะห์พืช พืชในสำนวนไทย: การวิเคราะห์ทางอรรถศาสตร์ การค้นหากลุ่มยีนที่เกี่ยวข้องในวิถีการสังเคราะห์แป้งในมันสำปะหลังด้วยเทคนิค Suppression subtractive hybridization. การวิเคราะห์เชิงเศรษฐศาสตร์การผลิตพืชผักแบบสัญญาผูกพันของเกษตรกร อำเภอพร้าว จังหวัดเชียงใหม่ ปีการเพาะปลูก 2546 พืชอาหารหรือพืชพลังงาน ? ยุทธวิธีการดำรงชีพขอเกษตรกรในที่ราบสูงโคราช ศึกษาวิเคราะห์เปรียบเทียบโภควิภาค 4 กับปรัชญาเศรษฐกิจพอเพียง การศึกษาเปรียบเทียบวิธีการลดเชื้อปนเปื้อนในพริก ระบบสารสนเทศเพื่อสนับสนุนการบริหารความเสี่ยงโครงการ โดยใช้เทคนิควิเคราะห์ความสัมพันธ์แบบเมตริกซ์เปรียบเทียบระดับความเสี่ยง ลายแคนเชิงวิเคราะห์ กรณีศึกษา สมบัติ สิมหล้า
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair