สืบค้นงานวิจัย
การคัดเลือกและศึกษาหน้าที่ของ IS element จากไซยาโนแบคทีเรียสไปรูลิน่าเพื่อใช้ประโยชน์ในการพัฒนาระบบการส่งถ่ายยีน
วัฒนา เจียมตน - มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
ชื่อเรื่อง: การคัดเลือกและศึกษาหน้าที่ของ IS element จากไซยาโนแบคทีเรียสไปรูลิน่าเพื่อใช้ประโยชน์ในการพัฒนาระบบการส่งถ่ายยีน
ชื่อเรื่อง (EN): Identification and functional analysis of IS element fromcyanobacterium Spirulina platensis C1 for transformation system improvement
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: วัฒนา เจียมตน
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): WATTANA JEAMTON
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
บทคัดย่อ: insertion sequences elements (IS elements) จัดเป็น transposable element (TEs) ที่มี ขนาดเล็กที่สุดที่สามารถเคลื่อนที่ไปได้ในส่วนต่างๆของจีโนมภายในสิ่งมีชีวิต โดยที่องค์ประกอบหลักของ IS elements คือยีน transposase และ inverted repeat sequences จากการศึกษาข้อมูลจีโนมของ Arthrospira platensis C1 เพื่อค้นหา IS element เพื่อนำมาใช้ประโยชน์ในการพัฒนาระบบการส่งถ่าย ดีเอ็นเอ พบว่ามียีนหรือ open reading frame (ORF) ที่ถูกทำนายว่าเป็นยีน transposase ทั้งหมด 221 ORF โดยที่มี 95 ORF ที่มีความคล้ายคลึงกับยืน transposase ในกลุ่มของ IS630 family และมีเพียง 20 ORF ของยีนในกลุ่มนี้ที่มีความสมบูรณ์ของยีน ดังนั้นในการวิจัยจึงเลือกยีน transposase (SPLC1_S300890 มาศึกษาคุณสมบัติพบว่านดังกล่าวมีขนาด 876 คู่เบส ที่ถอดรหัสเป็นกรดอะมิโนได้ 291 กรดอะมิโน และพบการจัดเรียงตัวของกรดอะมิโนที่เรียกว่า DDE motif ซึ่งมีการอนุรักษ์ไว้ในกลุ่ม ของ IS element นอกจากนี้ยังพบลำดับเบสที่คาดว่จะเป็น inverted repeat sequences อยู่ใน บริเวณ upstream และ downstream ของยีนดังกล่าวทำให้สันนิฐานได้ว่าดีเอ็นเอของยีน transposase ร่วมกับลำดับเบสที่อยู่ในบริเวณ upstream และ downstream น่าที่จะมีคุณสมบัติของ IS element ใน กลุ่มของ IS630 family ตังนั้นในการวิจัยจึงได้นำดีเอ็นเอในบริเวณดังกล่าวมาใช้ในการสร้างพลาสมิดลูก ผสม pAG246 เพื่อศึกษาความสามารถในการเคลื่อนย้ายดีเอ็นเอใน่ไซยาโนแบคทีเรีย Synechococcus elongatus PCC 7942อย่างไรก็ดีภายหลังการส่งถ่ายพลาสมิดตังกล่าวเข้าสู่เซลล์ Synechococcus PCC7942 ยังไม่สามารถตรวจพบ transformant ที่ได้รับชิ้นดีเอ็นเอจากพลาสมิดดังกล่าว
บทคัดย่อ (EN): Insertion sequences elements are the smallest transposable elements that can move from one position to another in genome. These elements normally comprise of transposase gene and inverted repeat sequences that involve in their mobility. Analysis of Arthrospira platensis C1 genome, 221 open reading frames corresponding to transposase gene were found and 95 ORFs of them are similar to transposase gene of IS630 family. However only 20 ORFs of these shows complete characteristic of length. In this research, the DNA region containing the SPLC1_S300890 that encodes for transposase gene of IS630 family and the adjacent upstream and downstream region was chosen for further study. The characterization of this transposase gene showed 876 base pairs of length encoding for 291 amino acids which contain the conserved catalytic DDE motif. In addition the inverted repeat sequences located at upstream and downstream of this gene was also found. As a result, we postulated that this DNA region should be an IS element of IS630 family. So this DNA region was further used to construct recombinant plasmid PAG246 for studying of its transposition property in cyanobacteria Synechococcus PCC7942. Nevertheless after the transformation of this plasmid into Synechococcus PCC7942 , there wasnt any transformant was detected.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
คำสำคัญ: ระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอ
คำสำคัญ (EN): transformation
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

วัฒนา เจียมตน. "การคัดเลือกและศึกษาหน้าที่ของ IS element จากไซยาโนแบคทีเรียสไปรูลิน่าเพื่อใช้ประโยชน์ในการพัฒนาระบบการส่งถ่ายยีนIdentification and functional analysis of IS element fromcyanobacterium Spirulina platensis C1 for transformation system improvement". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2554

วัฒนา เจียมตน. "การคัดเลือกและศึกษาหน้าที่ของ IS element จากไซยาโนแบคทีเรียสไปรูลิน่าเพื่อใช้ประโยชน์ในการพัฒนาระบบการส่งถ่ายยีนIdentification and functional analysis of IS element fromcyanobacterium Spirulina platensis C1 for transformation system improvement". มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี. 2554. Print.



TARR Wordcloud:
การคัดเลือกและศึกษาหน้าที่ของ IS element จากไซยาโนแบคทีเรียสไปรูลิน่าเพื่อใช้ประโยชน์ในการพัฒนาระบบการส่งถ่ายยีน
วัฒนา เจียมตน
มหาวิทยาลัยเทคโนโลยีพระจอมเกล้าธนบุรี
30 กันยายน 2554
การสกัดสีและตรวจสอบความเป็นพิษในระดับยีนของสีที่สกัดจากพืชและไซยาโนแบคทีเรียเพื่อพัฒนาไปใช้ในระดับอุตสาหกรรม การพัฒนายีนคัดเลือกเพื่อใช้ในการปรับปรุงระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอในสาหร่ายสีเขียวแกมน้ำเงินสไปรูลินาให้มีความเสถียร การปรับปรุงประสิทธิภาพระบบการส่งถ่ายดีเอ็นเอของ Spirulina platensis C1 ด้วยการใช้ยีน methylase และการยับยั้งการทำงานของ restriction enzyme การทดสอบฤทธิ์ชีวภาพของสารสกัดจากสาหร่ายสไปรูลิน่า การศึกษากิจกรรมของเอนไซม์ต้านสารอนุมูลอิสระในรากพืชที่ได้รับสารสกัดจากไซยาโนแบคทีเรียHapalosiphon sp การใช้ประโยชน์จากข้อมูลจีโนมของสไปรูลิน่าเพื่อการศึกษากระบวนการถ่ายทอดยีนเพื่อประโยชน์ในการพัฒนาสายพันธุ์และอุตสาหกรรมเทคโนโลยีชีวภาพ ภารกิจหน้าที่ของ วว. การวิเคราะห์การทำงานของยีนที่ใช้ในการสังเคราะห์สารเคอร์คูมินอยด์ในขมิ้นชันโดย RNA interference การพัฒนาสูตรอาหารต้นทุนต่ำเพื่อการเพาะเลี้ยงสไปรูลิน่าระดับอุตสาหรรม โครงการ พัฒนาเยาวชนบนพื้นที่สูง
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair