สืบค้นงานวิจัย
การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่3
ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ดร.พจมาลย์ สุรนิลพงศ์ - มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์
ชื่อเรื่อง: การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่3
ชื่อเรื่อง (EN): Identification and expression of gene associated with important trails in oil palm (Elaeis guineensis Jacq.)
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ผู้ช่วยศาสตราจารย์ ดร.พจมาลย์ สุรนิลพงศ์
บทคัดย่อ:          สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน) หรือ สวก. ได้สนับสนุนทุนวิจัยโครงการ “การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่ 3” แก่มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์ โดย ผศ.ดร.พจมาลย์ สุรนิลพงศ์ เป็นหัวหน้าโครงการ มีวัตถุประสงค์เพื่อ 1) ค้นหาและศึกษาการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับ การดูดซึม การลำเลียง และการรักษาสมดุลของแร่ธาตุอาหารในสายพันธุ์ปาล์มน้ำมันที่ปลูกเป็นการค้าของประเทศ และ 2) ศึกษาการเกิดการแสดงออกของยีน และวิวัฒนาการของยีนที่เกี่ยวข้องกับเซลล์ aerenchyma ที่เกิดขึ้นที่รากปาล์มน้ำมันเมื่ออยู่ในสภาพน้ำท่วมขัง และการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลของยีนที่เกี่ยวข้องกับสภาพน้ำท่วมในปาล์มน้ำมัน           ผลการศึกษาการค้นหาและศึกษาการแสดงออกของยีนกลุ่มที่เกี่ยวข้องกับการดูดซึมและการลำเลียงธาตุอาหารหลัก และรองบางกลุ่ม ของปาล์มน้ำมัน 3 พันธุ์ คือ พันธุ์สุราษฎร์ธานี1 2 และ 7 โดยการปลูกทั้งในโรงเรือน วิธีไฮโดรโปนิกส์ และการเก็บตัวอย่างจากแปลงทดลองปาล์มน้ำมัน โดยทำการศึกษาใน 3 ระยะการเจริญเติบโต ได้แก่ ระยะเมล็ดงอก ระยะต้นกล้า และระยะยืนต้น และได้ทำการศึกษาและเก็บข้อมูลลักษณะทางสรีรวิทยาของปาล์มน้ำมันทั้ง 3 พันธุ์ และทำการทดลองเพื่อศึกษาการตอบสนองของยีนกลุ่มเหล่านี้ ต่อการให้ปุ๋ยในแบบต่างๆ และการได้รับภาวะแล้ง พบยีนที่ครอบคลุมการศึกษาการดูดซึมลำเลียงและรักษาสมดุลแร่ธาตุหลักและรองที่มีการแสดงออกชัดเจน 12 ยีน ได้แก่ NRT1, NRT2, AMT1, AMT2, PT1, PT3, PT4, HAK1, HAK6, BT2, CuT และ MgT. โดยยีนที่น่าจะมีบทบาทสำคัญในการดูดซึมแร่ธาตุในปาล์มน้ำมันได้แก่ NRT1, NRT2, AMT1, AMT2, PT1, HAK6, และ MgT การให้ปุ๋ยทำให้ปาล์มน้ำมันมีการเจริญเติบโตที่เพิ่มขึ้น รวมถึงการสะสมแร่ธาตุอาหารโดยเฉพาะธาตุไนโตรเจนและฟอสฟอรัส ทั้งนี้การแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการดูดซึมธาตุไนโตรเจนพบว่า มีความสัมพันธ์กับการสะสมธาตุไนโตรเจน ในส่วนของการแสดงออกของยีน พบว่ายีน NRT1, NRT2 และ PT1 จะเพิ่มขึ้นในภาวะขาดธาตุไนโตรเจน หรือฟอสฟอรัสตามลำดับ เมื่อศึกษาความแตกต่างของพันธุ์ก็พบว่าพันธุ์ปาล์มน้ำมันมีการตอบสนองต่อการให้ปุ๋ยไนโตรเจนในแบบที่ต่างกัน เมื่อศึกษาการทนแล้งพบว่าปาล์มน้ำมันมีความทนแล้งน้อย และพบว่าการตรวจสอบความสามารถในการทนแล้งของปาล์มน้ำมันต้องใช้ดัชนีเหล่านี้ คือ ค่าปริมาณน้ำสัมพัทธ์ (CWR) ปริมาณคลอโรฟิลล์ทั้งหมด ปริมาณแคโรทีนอยด์ ลักษณะปากใบ ร่วมกันในการพิจารณา ซึ่งพบว่า ปาล์มน้ำมันพันธุ์สุราษฎร์ธานี 7 น่าจะมีความสามารถในการทนแล้งได้ดีกว่า นอกจากนี้ ภาวะแล้งทำให้เกิดการแสดงออกของยีนกลุ่มนี้ที่เปลี่ยนไปทั้งในรากและใบเพื่อรักษาการเจริญเติบโต การควบคุมการแสดงออกของยีนเหล่านี้เกี่ยวข้องกับหลายปัจจัยได้แก่ ปริมาณแร่ธาตุในดิน ปริมาณแร่ธาตุในต้นพืช พันธุ์ ปริมาณน้ำในดิน รวมถึงระยะการเจริญเติบโตของปาล์มน้ำมัน           สำหรับการค้นหาและการแสดงออกของยีนที่ตอบสนองต่อสภาพนน้ำท่วมขังในปาล์มน้ำมัน ได้ศึกษาการตอบสนองทางกายวิภาควิทยา การแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้าง aerenchyma ในรากปาล์มน้ำมัน และศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของยีน โดยการนำต้นกล้าปาล์มน้ำมันสายพันธุ์สุราษฎร์ธานี1 อายุประมาณ 7 เดือน มาปลูกในสภาพจำลองสภาวะน้ำท่วมขัง เป็นเวลา 0 1 2 3 5 10 และ 15 วัน จากนั้นทำการศึกษาการตายและเปอร์เซ็นต์ความพรุนของเซลล์รากที่ระยะเวลาต่างๆ พบว่า ปริมาณการดูดซึม evan blue ของรากมีความแตกต่างกันตามระยะเวลาที่อยู่ในสภาวะน้ำท่วมขัง และระหว่างชุดและตำแหน่งของราก กลไกการสร้างเนื้อเยื่อ aerenchyma ของรากปาล์มน้ำมันสายพันธุ์สุราษฎร์ธานี 1 มีรูปแบบเดียวกับข้าว และพืชจำพวก wetland plant และเมื่อคำนวณเปอร์เซ็นต์ความพรุนของรากจากพื้นที่เนื้อเยื่อ aerenchyma พบว่า มีแนวโน้มเพิ่มขึ้นตามระยะเวลาที่อยู่ในสภาพน้ำท่วมขังที่นานขึ้น ปาล์มน้ำมันสายพันธุ์ สุราษฎร์ธานี 1 เป็นสายพันธุ์ที่มีความสามารถในการปรับตัวให้ทนทานต่อสภาวะน้ำท่วมขังได้ดี ส่วนการหายีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้าง aerenchyma ในรากปาล์มน้ำมัน พบยีนที่เกี่ยวข้องจำนวน 20 ยีน ยีนทั้งหมดมีปริมาณการแสดงออกสูงในรากชุดที่ 1 ที่ระยะ 0.5-1.0 เซนติเมตร จากปลายราก และแสดงออกสูงที่สุดที่ระยะเวลาการขังน้ำ 2 และ 3 วัน ส่วนการศึกษาความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของยีนที่เกี่ยวข้องกับการสร้าง aerenchyma พบว่า ลำดับนิวคลีโอไทด์ของยีน ACO ในปาล์มน้ำมัน (E. guineensis) แสดงความใกล้ชิดกับปาล์มน้ำมัน E. oleifera มากที่สุด ในส่วนของการพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุล ได้ทำการออกแบบไพรเมอร์ จำนวน 79 คู่ไพรเมอร์ แต่สามารถหาสภาวะพีซีอาร์ที่เหมาะสมได้ จำนวน 64 คู่ไพร์เมอร์ หาลำดับนิวคลีโอไทด์ได้ จำนวน 61 คู่ไพร์เมอร์ พบตำแหน่งสนิปส์จำนวน 28 ตำแหน่ง มีตำแหน่งสนิปส์ที่สามารถตัดได้ด้วยเอนไซม์ตัดจำเพาะ จำนวน 6 ยีน ได้แก่ยีน ADH XTH22 SUS-1 ACO_homolog1 EXPA16 และ XTH23 ซึ่งสามารถตัดได้ด้วยเอ็นไซม์ตัดจำเพาะ Fnu4HI SspI Bsu36I EagI BstEII และ PsiI ตามลำดับ ซึ่งสนิปส์จากทั้ง 6 ยีนนี้ สามารถใช้จำแนกความแตกต่างของลักษณะทนน้ำท่วมในปาล์มน้ำมันแต่ละสายพันธุ์ได้ นอกจากนี้ผลการแสดงออกของยีนทั้ง 6 แสดงให้เห็นว่า ยีนส่วนใหญ่มีระดับการแสดงออกสูงขึ้นเมื่อได้รับสภาวะเครียดจากสภาวะน้ำท่วมที่นานขึ้น              ประโยชน์ที่จะได้รับของโครงการนี้ คือ ข้อมูลพื้นฐานของยีนที่เกี่ยวข้องกับการดูดซึมแร่ธาตุอาหาร และยีนที่ควบคุมลักษณะที่ทนต่อสภาพน้ำท่วมของปาล์มน้ำมัน ซึ่งจะนำไปสู่การพัฒนาเครื่องหมายโมเลกุลสำหรับนำไปใช้ในโครงการปรับปรุงสายพันธุ์ปาล์มน้ำมันของประเทศ โดยช่วยย่นระยะเวลาในโครงการปรับปรุงพันธุ์ นอกจากนี้ข้อมูลจากการศึกษาจะก่อให้เกิดประโยชน์แก่เกษตรกรในการตัดสินใจเลือกใช้สายพันธุ์ให้เหมาะสมกับสภาพพื้นที่ปลูกต่อไป
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์
คำสำคัญ: ปาล์มน้ำมัน ธาตุอาหาร แร่ธาตุที่จำเป็น การดูดซึม การลำเลียง การใช้ธาตุอาหาร การรักษาสมดุล สภาพน้ำท่วม เครื่องหมายโมเลกุล เทคนิค DDRT-PCR เทคนิค SSCP เทคนิค RACE เทคนิค qPCR เทคนิค Real time PCR
คำสำคัญ (EN): Real time PCR technique
เจ้าของลิขสิทธิ์: สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่3
มหาวิทยาลัยวลัยลักษณ์
1 มิถุนายน 2560
การทดสอบและสาธิตเทคโนโลยีการจัดการสวนปาล์มน้ำมันในเขตพื้นที่ภาคใต้ตอนบน ปีที่3 การทดสอบและสาธิตเทคโนโลยีการจัดการสวนปาล์มน้ำมันในเขตพื้นที่ภาคใต้ตอนบน ปีที่3 การผลิตถ่านกัมมันต์จากกะลาปาล์ม การแสดงออกของยีน choline monooxygenase (cmo) ในปาล์มน้ำมัน การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่ 2 การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่ 2 การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) ปีที่3 การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) การค้นหาและการแสดงออกของยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะที่สำคัญในปาล์มน้ำมัน (Elaeis guineensis Jacq.) การโคลนและการศึกษาการแสดงออกขอยีน EgLEC1 สำหรับคัดเลือกปาล์มน้ำมันพันธุ์ดี
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก