สืบค้นงานวิจัย
การแยกและศึกษาคุณสมบัติของยีน oxyR ซึ่งถูกควบคุมโดยกลไก oxidative stress จากเชื้อ Agrobacterium tumefaciens NTL4
Kaewkanya Nakjarung - มหาวิทยาลัยมหิดล
ชื่อเรื่อง: การแยกและศึกษาคุณสมบัติของยีน oxyR ซึ่งถูกควบคุมโดยกลไก oxidative stress จากเชื้อ Agrobacterium tumefaciens NTL4
ชื่อเรื่อง (EN): Isolation and characterization of the oxidative stress regulated Oxyr gene from Agrobacterium tumefaciens NTL4
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): Kaewkanya Nakjarung
บทคัดย่อ: Agrobacterium tumefaciens เป็นแบคทีเรียในดินที่ทำให้เกิดโรคปุ่มปมในพืชใบเลี้ยงคู่และยังเป็นแบคทีเรียที่ใช้ใน การถ่ายยีนเข้าสู่พืชเพื่อประโยชน์ในการดัดแปลงพันธุกรรมพืช ในการปะทะสัมพันธ์ (interaction) ระหว่างพืชกับ แบคทีเรียและขบวนการหายใจโดยใช้ออกซิเจน Agrobacterium จะต้องสัมผัส reactive oxygen species (ROS) การที่ แบคทีเรียจะมีชีวิตอยู่ได้นั้นสารพิษเหล่านี้ต้องถูกทำลายอย่างรวดเร็ว แบคทีเรียมีกลไกในการป้องกันตัวเองจาก ROS หลายกลไก โดยบางกลไกจะถูกควบคุมด้วย โปรตีน OxyR ซึ่งโปรตีนนี้จะทำหน้าที่เป็นตัวรับสัญญาณจากสาร peroxide และเป็นตัวควบคุมการถอดรหัสของยีนที่เกี่ยวข้องในการตอบสนองต่อ peroxide stress ในที่นี้ ยีนสำหรับโปรตีน OxyR ของ A. tumefaciens ได้ถูกศึกษา และพบว่ายีน oxyR อยู่ถัดจากยีน kat A ( ยีน bifunctional catalase-peroxidase) ซึ่งยีนทั้ง สองถูกถอดรหัสในทิศทางตรงข้ามกัน A. tumefaciens สายพันธุ์ที่ถูกทำลายยีน oxyR โดยวิธีการแทนที่ยีน (เรียกว่า PN03) ถูกสร้างขึ้นและพบว่า PN03 มีความไวต่อสาร H2O2 มากขึ้นแต่ไม่ไวกับสารจำพวก superoxide generator (menadione) หรือ organic hydroperoxide (tBOOH) การกระตุ้น A. tumefaciens NTL4 ซึ่งเป็นสายพันธ์ปกติด้วย H2O2 และ menadione (MD) สามารถเหนี่ยวนำเอนไซน์ catalase-peroxidase (KatA) ได้แต่ไม่สามารถเหนี่ยวนำเอนไซน์ antioxidant อื่นๆ เช่น glucose-6-phosphate dehydrogenase, glutathione reductase และ superoxide dismutase โดยการเหนี่ยวนำนี้ไม่พบในสายพันธ์ PN03 ลักษณะ phenotype ต่างๆที่หายไปใน PN03 สามารถทดแทนด้วยการแสดงออกของยีน oxyR ในพลาสมิต pOxyR การวิเคราะห์ katA::lacZ promoter fusion ยืนยันผลจากการวิเคราะห์ปริมาณเอมโซน์และแสดงให้เห็นว่าการเหนี่ยวนำ ของ H2O2 นั้นขึ้นอยู่กับ โปรตีน OxyR นอกจากนี้ยังได้ศึกษาการควบคุมการแสดงออกยีน oxyR ในเชื้อ A. tumefaciens โดย พบว่า การกระตุ้นของ H2O2 ไม่สามารถเหนี่ยวนำการแสดงออกของยีน oxyR แต่สามารถเปลี่ยน reduced OxyR เป็น oxidized OxyR ได้ และจากการวิเคราะห์ promoter ของยีน oxyR พบว่ายีน oxyR สามารถควบคุมการแสดงออกด้วยตัวเอง และไม่สามารถถูกเหนี่ยวนำด้วย H2O2 นอกจากนี้ได้ศึกษาการตอบสนองต่อสาร oxidant ของ A. tumefaciens NTL4 พบว่าการกระตุ้น A. tumefaciens NTL4 ด้วยสาร H2O2 และสาร MD ที่ความเข้มข้นต่ำสามารถเหนี่ยวนำให้แบคทีเรียต้านทานการฆ่าด้วยสาร H2O2 ความเข้ม ข้นสูงๆได้มากขึ้น โดยการตอบสนองเหล่านี้ไม่พบใน PN03 เป็นการบ่งบอกว่าทั้ง adaptive และ cross-protective response ใน A. tumefaciens นั้นควบคุมโดยโปรตีน OxyR
บทคัดย่อ (EN): Agrobacterium tumefaciens is a soil-borne plant pathogenic bacterium causing crown gall tumors in many dicotyledonous plants. The bacterium is also widely used as a tool to generate genetically engineered plants. During interaction with plants and aerobic respiration, Agrobacterium is exposed to reactive oxygen species (ROS) that have to be rapidly detoxified if the bacterium wants to survive. Bacteria have evolved multiple systems to protect themselves from ROS, some of which are regulated by OxyR, a global regulator for the peroxide stress response. The protein is a bifunctional protein that acts as both a peroxide sensor and a transcriptional regulator in response to peroxide stress. Here, the gene for Agrobacterium tumefaciens OxyR was characterized. oxyR is located next to, and is divergently transcribed from, a bifunctional catalaseperoxidase gene (katA). An A. tumefaciens oxyR mutant (namely PN03) was constructed and shown to be hyper-sensitive to H2O2, but not to the superoxide generator, menadione, or an organic hydroperoxide. Exposure of A. tumefaciens NTL4 to H2O2 resulted in induction of the catalase-peroxidase enzyme but not other antioxidant enzymes, including glucose-6-phosphate dehydrogenase, glutathione reductase and superoxide dismutase. The induction was abolished in the oxyR mutant. All phenotypes of the PN03 could be complemented by expression of the functional oxyR from plasmid vector (pOxyR). In vivo analysis of a katA::lacZ promoter fusion confirmed the results of enzyme assays and indicated that induction of the katA promoter by H2O2 was dependent on OxyR. We also examined the regulation of oxyR in A. tumefaciens. Exposure to H2O2 did not induce expression of the gene, but simply changed OxyR from a reduced to an oxidized form. The in vivo oxyR promoter analysis showed that the promoter was auto-regulated and that transcription was not induced by H2O2. The response of A. tumefaciens oxidant pretreatments was also investigated. Exposure of A. tumefaciens NTL4 to sublethal doses of H2O2 and MD rendered bacterial cells more resistant to a subsequent H2O2 killing. These inductive responses were absented in the PN03 indicating that both adaptive and cross protective responses are mediated by OxyR.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เอกสารแนบ: http://dcms.thailis.or.th/dcms/dccheck.php?Int_code=126&RecId=1154&obj_id=1415
เผยแพร่โดย: มหาวิทยาลัยมหิดล
คำสำคัญ (EN): Agrobacterium tumefaciens
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยมหิดล
รายละเอียด: Agrobacterium tumefaciens เป็นแบคทีเรียในดินที่ทำให้เกิดโรคปุ่มปมในพืชใบเลี้ยงคู่และยังเป็นแบคทีเรียที่ใช้ใน การถ่ายยีนเข้าสู่พืชเพื่อประโยชน์ในการดัดแปลงพันธุกรรมพืช ในการปะทะสัมพันธ์ (interaction) ระหว่างพืชกับ แบคทีเรียและขบวนการหายใจโดยใช้ออกซิเจน Agrobacterium จะต้องสัมผัส reactive oxygen species (ROS) การที่ แบคทีเรียจะมีชีวิตอยู่ได้นั้นสารพิษเหล่านี้ต้องถูกทำลายอย่างรวดเร็ว แบคทีเรียมีกลไกในการป้องกันตัวเองจาก ROS หลายกลไก โดยบางกลไกจะถูกควบคุมด้วย โปรตีน OxyR ซึ่งโปรตีนนี้จะทำหน้าที่เป็นตัวรับสัญญาณจากสาร peroxide และเป็นตัวควบคุมการถอดรหัสของยีนที่เกี่ยวข้องในการตอบสนองต่อ peroxide stress ในที่นี้ ยีนสำหรับโปรตีน OxyR ของ A. tumefaciens ได้ถูกศึกษา และพบว่ายีน oxyR อยู่ถัดจากยีน kat A ( ยีน bifunctional catalase-peroxidase) ซึ่งยีนทั้ง สองถูกถอดรหัสในทิศทางตรงข้ามกัน A. tumefaciens สายพันธุ์ที่ถูกทำลายยีน oxyR โดยวิธีการแทนที่ยีน (เรียกว่า PN03) ถูกสร้างขึ้นและพบว่า PN03 มีความไวต่อสาร H2O2 มากขึ้นแต่ไม่ไวกับสารจำพวก superoxide generator (menadione) หรือ organic hydroperoxide (tBOOH) การกระตุ้น A. tumefaciens NTL4 ซึ่งเป็นสายพันธ์ปกติด้วย H2O2 และ menadione (MD) สามารถเหนี่ยวนำเอนไซน์ catalase-peroxidase (KatA) ได้แต่ไม่สามารถเหนี่ยวนำเอนไซน์ antioxidant อื่นๆ เช่น glucose-6-phosphate dehydrogenase, glutathione reductase และ superoxide dismutase โดยการเหนี่ยวนำนี้ไม่พบในสายพันธ์ PN03 ลักษณะ phenotype ต่างๆที่หายไปใน PN03 สามารถทดแทนด้วยการแสดงออกของยีน oxyR ในพลาสมิต pOxyR การวิเคราะห์ katA::lacZ promoter fusion ยืนยันผลจากการวิเคราะห์ปริมาณเอมโซน์และแสดงให้เห็นว่าการเหนี่ยวนำ ของ H2O2 นั้นขึ้นอยู่กับ โปรตีน OxyR นอกจากนี้ยังได้ศึกษาการควบคุมการแสดงออกยีน oxyR ในเชื้อ A. tumefaciens โดย พบว่า การกระตุ้นของ H2O2 ไม่สามารถเหนี่ยวนำการแสดงออกของยีน oxyR แต่สามารถเปลี่ยน reduced OxyR เป็น oxidized OxyR ได้ และจากการวิเคราะห์ promoter ของยีน oxyR พบว่ายีน oxyR สามารถควบคุมการแสดงออกด้วยตัวเอง และไม่สามารถถูกเหนี่ยวนำด้วย H2O2 นอกจากนี้ได้ศึกษาการตอบสนองต่อสาร oxidant ของ A. tumefaciens NTL4 พบว่าการกระตุ้น A. tumefaciens NTL4 ด้วยสาร H2O2 และสาร MD ที่ความเข้มข้นต่ำสามารถเหนี่ยวนำให้แบคทีเรียต้านทานการฆ่าด้วยสาร H2O2 ความเข้ม ข้นสูงๆได้มากขึ้น โดยการตอบสนองเหล่านี้ไม่พบใน PN03 เป็นการบ่งบอกว่าทั้ง adaptive และ cross-protective response ใน A. tumefaciens นั้นควบคุมโดยโปรตีน OxyR
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

Kaewkanya Nakjarung. "การแยกและศึกษาคุณสมบัติของยีน oxyR ซึ่งถูกควบคุมโดยกลไก oxidative stress จากเชื้อ Agrobacterium tumefaciens NTL4Isolation and characterization of the oxidative stress regulated Oxyr gene from Agrobacterium tumefaciens NTL4". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2546

Kaewkanya Nakjarung. "การแยกและศึกษาคุณสมบัติของยีน oxyR ซึ่งถูกควบคุมโดยกลไก oxidative stress จากเชื้อ Agrobacterium tumefaciens NTL4Isolation and characterization of the oxidative stress regulated Oxyr gene from Agrobacterium tumefaciens NTL4". มหาวิทยาลัยมหิดล. 2546. Print.



TARR Wordcloud:
การแยกและศึกษาคุณสมบัติของยีน oxyR ซึ่งถูกควบคุมโดยกลไก oxidative stress จากเชื้อ Agrobacterium tumefaciens NTL4
Kaewkanya Nakjarung
มหาวิทยาลัยมหิดล
2546
การศึกษาโปรตีนที่เกี่ยวข้องกับกลไกการควบคุมการถอดรหัสของยีนที่ไม่แสดงออกในพืชที่ผ่านการถ่ายยีน การศึกษาและตรวจสอบคุณสมบัติกลุ่มยีนการสร้าง rhamnolipid ในเชื้อ Burkholderia pseudomallei ลักษณะทางฟีโนไทป์ของเชื้อ Burkholderia thailandensis ก่อนและหลังจากติดเชื้อ bacteriophage ที่แยกได้จากเชื้อ Burkholder การศึกษาคุณสมบัติของยีนมะเร็งของไวรัส HPV16 : ความหลากหลายของยีน แหล่งที่อยู่และหน้าที่การกระตุ้นการแสดงออกของยีน แบบแผนการดื้อยาและการกระจายของยีนที่ควบคุมการก่อโรคของเชื้อ Arcanobacterium pyogenes จากมดลูกอักเส กลไกที่โปรตีน Myb มีผลต่อการทำงานของยีน C/EBPalpha. การศึกษาในโคลนและการแสดงออกของยีนที่ควบคุมเอนไซ การควบคุมการแสดงออกของยีน Human Manganese Superoxide Dismutase การแยกและควบคุมการเจริญเติบโตของเชื้อจุลินทรีย์ที่สร้างเม็ดสีแดงในระบบบำบัดแบบกึ่งไร้อากาศ การแยกโปรโมเตอร์ของยีน heat shock จากแบคทีเรียแลคติกโดยใช้ Green Fluorescent Protein (GFP) เป็นยีนแสดงผล
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair