สืบค้นงานวิจัย
การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกระท่อม (Mitragyna speciosa (Korth.) Havil.) ในประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลสนิปร่วมกับลักษณะสัณฐานวิทยา
ผู้ช่วยศาสตราจารย์ภัศจี คงศีล - สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
ชื่อเรื่อง: การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกระท่อม (Mitragyna speciosa (Korth.) Havil.) ในประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลสนิปร่วมกับลักษณะสัณฐานวิทยา
ชื่อเรื่อง (EN): Genetic Diversity Evaluation of Mitragyna speciosa (Korth.) Havil in Thailand by Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and Morphological Characteristics
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ: ผู้ช่วยศาสตราจารย์ภัศจี คงศีล
หน่วยงานสังกัดผู้แต่ง:
  1. มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
บทคัดย่อ: กระท่อม Mitragyna speciosa (Korth.) Havil. มีการปลูกกระท่อมมากในภาคใต้ และบางพื้นที่ใน ภาคกลางในประเทศไทย ใบกระท่อมมีสารเคมีที่สำคัญประกอบด้วย กลุ่มอินโดลแอลคะลอยด์ (Indole Alkaloids) กลุ่มออกอินโดลแอลคะลอยด์ (Oxindole Alkaloids) กลุ่มฟลาวานอยด์ (flavonoids) ซึ่งมีฤทธิ์ Anti-oxidants และกลุ่มอื่น ๆ เช่น ไฟโตสเตอรอล (Phytosterol), แทนนิน (Tannins) ที่พบจะแตกต่างกัน ตามสถานที่และเวลาเก็บเกี่ยว ปัจจุบันพืชกระท่อมได้ถูกยกเลิกจากการเป็นยาเสพติดให้โทษ กระท่อมไทยจึง เป็นอีกหนึ่งชนิดพืชที่มีโอกาสต่อยอดในเชิงเศรษฐกิจและผลักดันให้เป็นสินค้าส่งออก อย่างไรก็ตามการ นำมาใช้ประโยชน์และการวิจัยที่เกี่ยวข้องด้านสายพันธุ์ของกระท่อมไทยต้องหยุดชะงักลง เนื่องจากในปัจจุบัน จึงยังไม่มีการระบุสายพันธุ์ที่ชัดเจน ยังไม่มีการศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมโดยละเอียด เครื่องหมาย ดีเอ็นเอที่มีการศึกษาและใช้ที่ผ่านมานั้นเป็นเพียงเครื่องหมายดีเอ็นเอที่จำเพาะในบางบริเวณของจีโนมเท่านั้น ดังนั้นในงานวิจัยนี้ได้แก้ปัญหานี้โดยการค้นหาเครื่องหมายดีเอ็นเอสนิปที่ กระจายอยู่ทั่วจีโนม อีกทั้งยังขยาย ประชากรของกระท่อมที่จะศึกษาในหลายพื้นที่งานวิจัยนี้เป็นการดำเนินการเก็บรวบรวมตัวอย่างใบกระท่อม ในประเทศไทยได้แก่ ชุมพร ประจวบคีรีขันธ์ ระนอง สุราษฎร์ธานี สตูล พังงา กระบี่ นครศรีธรรมราช ตรัง พัทลุง ส่วนนอกเขตภาคใต้เก็บตัวอย่างในจังหวัดปทุมธานีนนทบุรีและเพชรบุรี จำนวนรวม 281 ตัวอย่าง นอกจากนั้นทางคณะผู้วิจัยจะเก็บข้อมูลตำแหน่ง และถ่ายภาพเพื่อประเมินข้อมูลสัณฐานของใบกระท่อม เพื่อ นำมาใช้ศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างลักษณะทางสัณฐานและที่ตั้งกับความหลากหลายทางพันธุกรรมของ กระท่อมโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลชนิดสนิป โดยการสกัดดีเอ็นเอจากตัวอย่างใบกระท่อมแล้วเตรียมตัวอย่าง ดีเอ็นเอเพื่อหาลำดับเบส จากนั้นการวิเคราะห์ลำดับนิวคลีโอไทด์ อาศัยหลักการ Sequencing by Synthesis (SBS) ซึ่งวิธีการนี้จะทำให้ทราบลำดับเบสของจีโนมกระท่อมเป็นส่วนๆ ตลอดทั้งจีโนมของกระท่อมซึ่งจะทำให้ สามารถวิเคราะห์เครื่องหมายดีเอ็นเอชนิดสนิปได้ในหลักพันตำแหน่งซึ่งเพียงพอสำหรับการวิเคราะห์ความ หลากหลายทางพันธุกรรมของตัวอย่างกระท่อมอย่างละเอียดและแสดงเป็น phylogentic tree หลังจากนั้น กลุ่มตัวอย่างกระท่อมที่มีความแตกต่างทางพันธุกรรมจะได้รับการเลือกมาจำนวน 20 ตัวอย่างเพื่อศึกษาหา ปริมาณสารสำคัญได้แก่ ปริมาณฟีนอลิกรวม ปริมาณแทนนินรวม ปริมาณแอลคาลอยด์ (Mitragynine Paynanthine Speciogynine และ 7-hydroxymitragynine) เพื่อเปรียบเทียบ ปริมาณของสารสำคัญในแต่ ละตัวอย่างใบกระท่อมที่มีพันธุกรรมแตกต่างกัน ซึ่ง phylogentic tree ที่ได้จากการวิจัยสามารถใช้บ่งชี้ความ ใกล้ชิดทางพันธุกรรมของตัวอย่างกระท่อมในแต่ละพื้นที่ได้ ทำให้ทราบที่มาของตัวอย่างกระท่อมว่ามีการนำไป ปลูกจากแหล่งใด อย่างไรก็ตามตัวอย่างกระท่อมที่มีพันธุกรรมใกล้เคียงกัน ไม่ได้มีสัณฐานของใบและปริมาณ สารสำคัญใกล้เคียงกัน ซึ่งจะต้องมีการศึกษาถึงปัจจัยทางสภาพแวดล้อมที่ส่งผลต่อปริมาณสารสำคัญ และต่อ ยอดองค์ความรู้โดยการใช้เครื่องหมายดีเอ็นเอสนิปในงานวิจัยนี้ในการค้นหาตำแหน่งของยีนที่ควบคุมลักษณะ การสร้างสารสำคัญในใบกระท่อมต่อไป
บทคัดย่อ (EN): Kratom Mitragyna speciosa (Korth.) Havil. grown in some areas in the southern and the central regions of Thailand contain important chemicals in leaf which are Indole Alkaloids, oxindole Alkaloids, flavonoids as anti-oxidants and phytosterol. Kratom has now been regarded as a non-narcotic in Thailand. Thai kratom is therefore has an opportunity to expand economically and be promoted as a high-value export product. However, the utilization and related research on kratom species has been limited because, at present, the genetic diversity of Kratom has not been studied profoundly. The DNA markers that have been studied and used in the past were only in certain regions in the genome which could use for identifying among species, but not within. Therefore, in this research, there is an aim to study genetic diversity by using SNP markers scattered throughout Kratom’s genome from the population of kratom diversified in many areas in Thailand. This research collected 281 samples of kratom leaves in these following provinces: Chumphon, Prachuap Khiri Khan, Ranong, Surat Thani, Satun, Phang-Nga, Krabi, Nakorn Si Thammarat, Trang, Phatthalung, Pathum Thani, Nonthaburi, Phetchaburi. The leaf samples were collected along with the location information and photographed to assess the morphological data used to analyze the relationship between leaf morphological traits, location and genetic diversity was studied by Sequencing by Synthesis principle providing thousands of SNP markers throughout Kratom’s genome which were by sufficient for a thorough analysis of the genetic diversity of the kratom samples and expressing them as a phylogenetic tree. Twenty of genetically different kratom samples were selected from phylogenetic tree for quantification of the metabolites, namely: total phenolic content, total tannin content, alkaloids ( Mitragynine, Paynanthine, Speciogynine and 7- hydroxy-mitragynine) for comparison the amount of these active substances in genetically various samples. As a result, the phylogentic tree obtained from this research could be used to indicate the genetic relationship of Kratom samples in Thailand to locate the origin of the samples. However, the kratom samples which were genetically similar did not share the same morphological leaf traits and the amount of active compounds. Thus, the information of environmental factors that affect the amounts of medicinal substances are required to be further studied to extend the knowledge of using SNP markers in this research to identify genes or loci that control the production of important substances in kratom leaves.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): th
เผยแพร่โดย: สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
คำสำคัญ: เครื่องหมายโมเลกุลสนิป
เจ้าของลิขสิทธิ์: มหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง

ผู้ช่วยศาสตราจารย์ภัศจี คงศีล. "การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกระท่อม (Mitragyna speciosa (Korth.) Havil.) ในประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลสนิปร่วมกับลักษณะสัณฐานวิทยาGenetic Diversity Evaluation of Mitragyna speciosa (Korth.) Havil in Thailand by Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and Morphological Characteristics". สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน) . 2564

ผู้ช่วยศาสตราจารย์ภัศจี คงศีล. "การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกระท่อม (Mitragyna speciosa (Korth.) Havil.) ในประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลสนิปร่วมกับลักษณะสัณฐานวิทยาGenetic Diversity Evaluation of Mitragyna speciosa (Korth.) Havil in Thailand by Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and Morphological Characteristics". สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน) . 2564. Print.



TARR Wordcloud:
การประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของกระท่อม (Mitragyna speciosa (Korth.) Havil.) ในประเทศไทยโดยใช้เครื่องหมายโมเลกุลสนิปร่วมกับลักษณะสัณฐานวิทยา
ผู้ช่วยศาสตราจารย์ภัศจี คงศีล
สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)
2564
การพัฒนาเทคโนโลยีและนวัตกรรมขั้นต่อยอดการขยายพันธุ์ปะการังอ่อนเพื่อลดต้นทุนการผลิตและเพิ่มคุณภาพผลผลิตสำหรับการใช้ประโยชน์ในเชิงการค้าและการฟื้นฟูทรัพยากรทางทะเลของประเทศไทย การรวบรวมพันธุ์และประเมินความหลากหลายทางพันธุกรรมของดีปลี (Piper retrofractum) ในประเทศไทยเพื่อการปรับปรุงพันธุ์และการใช้ประโยชน์ในอนาคต ระบาดวิทยา การสื่อสารความเสี่ยง ความเสียหายของเกษตรกร การประเมินมาตรการความควบคุมโรคและแผนปฏิบัติการการเฝ้าระวังป้องกันและควบคุมโรคลัมปีสกินในประเทศไทย การค้นหาเครื่องหมายพันธุกรรมในการคัดเลือกลักษณะทางเศรษฐกิจเพื่อเพิ่มสมรรถภาพการผลิตโคไทยบราห์มัน การออกแบบลักษณะเนื้อสัมผัสผลิตภัณฑ์อาหารจากข้าวไทยโดยใช้โครงสร้างโมเลกุลขององค์ประกอบทางเคมีในข้าว การประเมินประสิทธิภาพกุ้งขาวปรับปรุงพันธุ์ในโรงเพาะฟักและฟาร์มเลี้ยงกุ้งเชิงพาณิชย์ของประเทศไทย โครงการสร้างประชากรพ่อแม่พันธุ์กุ้งขาวปลอดโรคและโตดีเพื่อการเพาะเลี้ยงในประเทศไทยและการใช้ประโยชน์อย่างยั่งยืน การระบุเครื่องหมายพันธุกรรมที่เกี่ยวข้องกับกลไกทางชีวภาพที่ตอบสนองต่อสภาพอากาศร้อนจัดเนื่องจากภาวะแล้งด้วยเทคนิคทรานสคริปโตมเพื่อใช้ในการปรับปรุงพันธุ์ไก่เนื้อ การพัฒนาและทดสอบประสิทธิภาพของวัคซีนต้นแบบต่อโรคลัมปี สกิน สำหรับการระบาดฉุกเฉินในประเทศไทย การค้นหาตำรับยาแผนไทยที่มีศักยภาพในการบรรเทาอาการโรคโควิด-19 ผ่านการวิเคราะห์ตามทฤษฎีทางการแพทย์แผนไทย การเปรียบเทียบเทียบความเหมือนของสารออกฤทธิ์ที่เคยศึกษามาก่อน การใช้คอมพิวเตอร์โมเดลและการศึกษาฤทธ
คัดลอก URL
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก
พัฒนาระบบโดยศูนย์ความรู้เฉพาะด้านวิศวกรรมความรู้และวิศวกรรมภาษาDeveloped by Center of Excellence for Unified Knowledge and Language Engineering
สนับสนุนโดยสำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน)Supported by the Agricultural Research Development Agency (Public Organization)
แบบสำรวจความพึงพอใจQuestionair