สืบค้นงานวิจัย
Hevea genome sequencing: progress, problems and prospects
C. Tang - ไม่ระบุหน่วยงาน
ชื่อเรื่อง (EN): Hevea genome sequencing: progress, problems and prospects
ผู้แต่ง / หัวหน้าโครงการ (EN): C. Tang
บทคัดย่อ (EN): A high-quality genome assembly is essential to addressing the mechanims that account for rubber production and other agronomic traits in Hevea brasiliensis (the para rubber tree). Owing to the advent of the high-throughput and low-cost next-generation sequencing (NGS) technologies, decoding the genome of a complex yet economically important non-model plant species like rubber tree becomes feasible and rewarding. In 2013, the first draft genome of Hevea was released by a Malaysian-led team. In May and June of this year (2016), two more Hevea genomes were, respectively, reported by a Chinese-led team and a Japanese/Malaysian team. And in a couple of years, even more genome assemblies can be expected for this species. In this review, we compare the three available genome assemblies from the aspects of sequencing and assembly to the biological stories derived from the genome, including the insights into rubber production and other desirable agronomic traits. The pipeline developed by the Chiniese-led team that exploits BAC-pool sequencing to asstist scaffolding seems essential to the high-quality of its genome assemlby. We provide possilbe explanations for the obvious discrenpancies in the genome size and number of protein-coding genes predicted by the three groups for the same species. Strategies are proposed that are deemed appropirate to further improve the assembly qualilty of Hevea genome, and various genome-based applications are proposed.
บทคัดย่อ: ไม่พบข้อมูลจากหน่วยงานต้นทาง
ภาษา (EN): en
เผยแพร่โดย (EN): การยางแห่งประเทศไทย
คำสำคัญ (EN): prospects
เจ้าของลิขสิทธิ์ (EN): การยางแห่งประเทศไทย
หากไม่พบเอกสารฉบับเต็ม (Full Text) โปรดติดต่อหน่วยงานเจ้าของข้อมูล

การอ้างอิง


TARR Wordcloud:
กระทู้ของฉัน
ผลการสืบค้นทั้งหมด โพสต์     เรียงลำดับจาก